بررسی پروتئوم ریشه و برگ برنج تحت تنش شوری
Abstract(in Persian; no English abstract is available)
شوری خاک و آب یکی از عوامل محدودکننده کشت برنج در سراسر دنیا می باشد. این گیاه در مرحله گیاهچه (seedling) حساسیت زیادی نسبت به شوری دارد. پروتئومیکس با توانایی کشف پروتیینها و ژن های پاسخدهنده به تنش، در فرایند اصلاح برای تنش ها به ویژه تنش شوری نقش کاربردی دارد. جهت بررسی اثر تنششوری بر فرآیند های فیزیولوژیکی و الگوی بیان پروتیین های گیاه برنج، بذرهای دو رقم متحمل و حساس، به ترتیب (oryza sativa cv.ir651 and cv.ir29) در محیط کشت یوشیدا، در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار کشت شدند. وزن خشک، تر و نسبت + k+/naدر برگ سوم و ریشهی گیا هان اندازه گیری شد. نتایج نشان داد، کاهش وزن کل ماده خشک گیاهچه ها در رقم حساس (ir29) نسبت به رقم متحمل (ir651) اثر معنی دار داشت. همچنین نسبتk+/na+ در رقم ir651 بیش از دو برابر این نسبت در رقم ir29 بود. پروتیین های برگ سوم و ریشه گیاهچه ها به روشtca/acetone استخراج و الکتروفورز دوبعدی با استفاده از سیستم ipg انجام شد. با استفاده از نرم افزار melanie3 345 نقطه پروتیینی تکرار پذیر در برگ و 468 نقطه در ریشه شناسایی شد از این تعداد 107 پروتیین در ریشه و 86 پروتیین در برگ هر دو ژنوتیپ پاسخ معنیدار به تنش نشان دادند. سپس پروتیینها با استفاده از روشesi-q-tof ms/ms توالییابی شدند که مهمترین آنها عبارت اند از فریتین، آسکوربات پراکسیداز و روبیسکو اکتیواز در برگ و پراکسیداز و آسکورباتپراکسیداز در ریشه. پروتیین های مذکور همگی آنزیم بوده و در سازوکارهای سم زدایی و حذف رادیکال های آزاد اکسیژن (پراکسیداز، آسکوربات پراکسیداز)، هموستازی آهن (فریتین) و فعال سازی دیگر آنزیم ها (روبیسکو اکتیواز) نقش دارند.