ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل و جایگاه تاکسونومیکی جدایه های جو و گندم سویه گندم ویروس کوتولگی گندم در ایران
Abstract
ویروس کوتولگی گندم ((wdv از عوامل اصلی ایجادکننده بیماری های کوتولگی و زردی غلات است. دو سویه جو (wdv-b) و گندم (wdv-w) از این ویروس از مزارع گندم و جو مناطق مختلف ایران گزارش شدهاند. مطالعه پراکنش سویه های wdv در مزارع غلات ایران نشان داده است که wdv-w از گسترش بیشتری نسبت به wdv-b برخوردار است. بیش از این ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل یک جدایه از wdv-b از استان خراسان (wdv-bar[ir:bar]) تعیین شده است. برای مشخص شدن وضعیت تاکسونومیکی جدایه های گندم و جو wdv-w در ایران، ژنوم کامل یک جدایه گندم wdv-w از شهرکرد استان چهارمحال و بختیاری ( wdv-whe[iran:sh:whe]) و یک جدایه جو از همین سویه از منطقه بوانات استان فارس (wdv-whe [iran:ba:bar] ) به ترتیب شامل 2750 و 2749 نوکلئوتید تعیین ترادف شدند. دندروگرام حاصل از مطالعات تبارزایی تقسیم بندی سویههای wdv را به دو گروه wdv-w و wdv-b تأئید نمود به طوری که wdv-whe[iran:sh:whe] وwdv-whe[iran:ba:bar] در گروه wdv-w و wdv-bar[ir:bar] همراه با سایر جدایه های wdv-b در گروه دیگر قرار گرفتند. نتایج حاصل از ترادف نوکلئوتیدی در قسمت های مختلف ژنوم نیز نشان داد که دو جدایه wdv-w مورد مطالعه با یکدیگر و با جدایه های سویه گندم موجود در بانک ژن بیشترین شباهت را در ناحیه پروتئین همراه با همانندسازی و کمترین شباهت را در ناحیه پروتئین حرکتی و ناحیه بین ژنی بزرگ دارند