بررسی تنوع ژنتیکی برخی ارقام سیب زمینی توسط الکتروفورز پروتئین
Abstract
چکیده در این بررسی 23 کلون منتخب سیب زمینی(solanum tuberosum l.) موجود در بانک ژن بخش تحقیقات نهال و بذر مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی در سال زراعی 1388 با هدف بررسی تنوع ژنتیکی و ارزیابی قرابت ژنتیکی این کلون ها مورد مطالعه قرار گرفت. کلونهای مورد مطالعه شامل agria, almera, arnova, desiree, diamant, fontaneh, granola, hermes, leady rosseta, marfona, marabel, impala, oshna, markies, picasso, sante, savalan, florida, sinora, emrad, labadia, alori, daifla می باشند. از نمونه های منجمد غده کلون های منتخب با استفاده از روش تغییر یافته لائملی (laemmli, 1970 ) بطور جداگانه استخراج پروتئین صورت گرفت. نقوش پروتئینی برای هر کلون در حضور پروتئین های نشانگر به روش sds-page با استفاده از الکتروفورز عمودی بر روی ژل پلی آکریل آمید بدست آمد. پس از آن باند های پروتئینی با کوماسی بلو r-250 رنگ آمیزی شد. درصد پلی مورفیسم کلون ها با شمارش باندهای متناظر و رسم جدول ماتریکس محاسبه گردید و براساس مقیاس اقلیدسی فاصله بصورت گرافیکی تحت عنوان دندروگرام کلون ها بر اساس روش upgma با استفاده از نرم افزار ntsys رسم شد. همچنین فاصله ژنتیکی نمونه های مورد بررسی در نرم افزار spss با استفاده از ضریب جاکارد محاسبه شد. نتایج دندروگرام حاصل از آنالیز پروتئین غده های 23 کلون منتخب سیب زمینی نشان داد که کلون oshna از نظر قرابت ژنتیکی به صورت مشخصی از سایر کلون ها مجزا بوده و در خوشه متمایزی واقع شد. همچنین سه کلون sinora و emrad diamant, با یکدیگر در خوشه دوم واقع شدند. ارقام labadia, savalan, marabel, fontaneh, granola, florida, picasso, impala, desiree درخوشه بندی متمایزی (خوشه سوم) واقع شدند. نتایج همچنین نشان می دهد ارقام almera, arnova دارای قرابت ژنتیکی بالایی بوده و به همراه ارقام daifla, alori, sante, leady rosseta, marfona, markies, hermes, agria در خوشه چهارم قرار گرفتند. ارقام oshna و agria دارای پایین ترین درصد شباهت (54%) می باشند. نتایج این تحقیق نشان دهنده وجود پتانسیل بالای تنوع ژنتیکی در بین کلون های سیب زمینی می باشد. در بخش دیگری از این بررسی مشخص گردید که تعداد باند بدست آمده از آنالیز پروتئینهای غده ( 28 باند) نسبت به برگ (17 باند) وساقه (14 باند) بیشتر است وبرای بررسی تنوع ژنتیکی مناسب تر می باشد.