شناسایی مولکولی ویروس پیسک توت‌فرنگی (Strawberry mottle virus) از مزارع توت‌فرنگی استان کردستان بر اساس منطقه 3΄NCR

در تابستان 1397، علائم ویروسی شامل پیسک، بدشکلی و سوختگی حاشیه برگ­ها از مزارع توت­فرنگی استان کردستان مشاهده و تعداد 48 نمونه برگی جمع­آوری شد. ابتدا برخی نمونه­ها به گیاه محک Fragaria vesca با استفاده از شته توت­فرنگی (Chaetosiphon fragaefolii) تلقیح و علایم مطابق با Strawberry mottle virus (SMoV) ظاهر شد. سپس، آر ان ­ا کل از نمونه­ها با روش سیلیکا استخراج و دی ان ا مکمل آن‌ها با آغازگرهای تصادفی شش­تایی ساخته شد. PCR با آغازگرهای اختصاصی SMoV- Sm2ncr1a و SMoV-Smdetncr4a انجام و قطعه­ای به طول 461 جفت باز در 28 نمونه از 48 نمونه فوق تکثیر گردید. به‌منظور اطمینان از نتیجه RT-PCR و بررسی مشخصات مولکولی، پنج جدایه براساس منطقه جغرافیایی، رقم میزبان و نوع علایم انتخاب و پس از الحاق به پلاسمید pTG-19 در باکتری Escherichia coliانتقال و پلاسمیدهای نوترکیب همسانه شده تعیین توالی شدند. میانگین فاصله ژنتیکی در بین جدایه­های در این تحقیق در سطح نوکلئوتیدی 002/0 ± 005/0 و با سایر جدایه­های موجود در بانک ژن 008/0 ± 084/0 بود. مقایسه دوبه دوی توالی­های نوکلئوتیدی نشان داد که بیشترین و کمترین فاصله ژنتیکی به‌ترتیب میان جدایه K3 با جدایه NSper51 از کانادا (015/0 ± 093/0) و جدایه SQA یا AG با جدایه NB926 از کانادا (007/0 ± 019/0) وجود داشت.این اولین گزارش از شناسایی این ویروس در مزارع توت­فرنگی استان کردستان می­باشد.