بررسی ژن‏ های رفرنس موجود در برگ کنجد تحت تنش شوری به روش Real- Time PCR

Authors

  • سمیرا شاکری دانش‌آموخته کارشناسی‌ارشد اصلاح‌نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
  • سید حمید رضا هاشمی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی پژوهشکده ژنتیک و زیست‌فناوری طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
Abstract:

تجزیه و تحلیل بیان ژن جزء لاینفک مطالعات ژنومیکس کاربردی در همه موجودات زنده بشمار می‏رود.  Real-time PCR تکنیک بسیار قوی برای بررسی بیان کمی ژن می‏باشد. با این حال، علاوه بر قابل اعتماد بودن، دارای یک‌ سری مشکلات خاص، از جمله انتخاب‏ ژن (های) کنترل داخلی مناسب برای نرمال‏سازی داده‏ها می‏باشد. این تحقیق در خصوص انتخاب ژن‏های رفرنس در گیاه کنجد در مراحل مختلف نمو و تحت تنش شوری، مورد بررسی قرار گرفت .بدین منظور چهار ژن کنترل داخلی شامل Alpha- Tubulin، Beta- Actin، eIF4- A و UBQ5 که معمولاً به عنوان ژن خانه‏دار در گیاهان استفاده می‏شود انتخاب و  پایداری بیان آنها در سطوح مختلف شوری (صفر و 75 میلی‏مولار) و مراحل مختلف نموی در شش دوره زمانی (0 ساعت، 6 ساعت، 1 روز، 4 روز، 8 روز و 16 روز) در بافت برگ مورد بررسی قرار گرفتند. بررسی بیان ژن‏های رفرنس با استفاده از نرم‏افزار geNORM نشان داد که ژن‏های eIF4- A و Beta-Actin از پایداری بیان بیشتری نسبت به سایر ژن‌های مورد بررسی در مراحل نمو و تنش شوری در نمونه بافت برگی برخوردار بودند. استفاده از این ژن‌ها می‌تواند در نرمال‌سازی بیان ژن به وسیله آنالیز Real-Time PCR مفید باشد. نتایج این تحقیق را می‏توان به عنوان ژن‏های رفرنس درآنالیز بیان ژن در Real-Time PCR در گیاه کنجد استفاده نمود.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی ژن‏ های رفرنس موجود در برگ کنجد تحت تنش شوری به روش real- time pcr

تجزیه و تحلیل بیان ژن جزء لاینفک مطالعات ژنومیکس کاربردی در همه موجودات زنده بشمار می‏رود.  real-time pcr تکنیک بسیار قوی برای بررسی بیان کمی ژن می‏باشد. با این حال، علاوه بر قابل اعتماد بودن، دارای یک سری مشکلات خاص، از جمله انتخاب‏ ژن (های) کنترل داخلی مناسب برای نرمال‏سازی داده‏ها می‏باشد. این تحقیق در خصوص انتخاب ژن‏های رفرنس در گیاه کنجد در مراحل مختلف نمو و تحت تنش شوری، مورد بررسی قرار گ...

full text

ارزیابی سه ژن مرجع جهت نرمال سازی داده های Real-time PCR در ریشه گندم تحت تنش شوری

پژوهش­های بیان ژن با استفاده از Real-time PCR ابزار قدرتمندی برای تجزیه و تحلیل سازوکار­های مقاومت به تنش­های غیر زیستی در گیاهان بشمار می­رود. یکی از مراحل مهم استفاده از این روش انتخاب و اعتبارسنجی ژن­های مرجع بمنظور نرمال کردن بیان ژن­های هدف تحت شرایط مختلف تنش می­باشد. بمنظور انتخاب ژن مرجع مناسب در پژوهش­های ریشه گندم تحت تنش شوری، پایداری بیان سه ژن معروف GAPِDH، Actin وTa.22845 با استفاد...

full text

افزایش بیان ژن BIM در بیماران مبتلا به Multiple Sclerosis با روش Real Time PCR

مقدمه و هدف: بیماری مالتیپل اسکلروزیس (MS)، به‌عنوان یک بیماری خودایمن سیستم اعصاب مرکزی شناخته می‌شود. یافته‌های به‌دست‌آمده حاکی از نقش سیستم ایمنی و عوامل مرتبط با تنظیم عملکرد این سیستم در بروز بیماری‌های سیستم اعصاب مرکزی مانند مالتیپل اسکلروزیس است. در این میان، ژن Bim به‌عنوان یکی از ژن‌های دخیل در تنظیم فعالیت‌های زیستی سلول مانند آپوپتوز، ازجمله ژن‌های کاندید مرتبط با این بیماری گزارش ...

full text

بررسی جهش V617F ژن JAK2 در بیماران مشکوک به ترومبوزیس به روش Taq man Allele Specific Real Time PCR

سابقه و هدف: ترومبوز یا ترومبوزیس، به تشکیل لخته خون در داخل یک رگ خونی می گویند. این عارضه عموماً با تجمع پلاکت ‌های خون پدید می ‌آید. این تمایل به لخته شدن ناشی از عوامل بیرونی و فاکتورهای ژنتیکی است که حاصل تغییر در مکانیسم لخته شدن می ‌باشد. این مطالعه با هدف به کارگیری از روش Taq man Allele-Specific Real-Time  برای تشخیص و غربالگری جهش V617F  ژن JAK2  در بیماران مستعد به ترومبوزیس صورت گرفت...

full text

بررسی بیان آنزیم sod (در سطح mrna) به روش real-time pcr در گیاه چای تحت تنش خشکی

در میان عوامل غیرزیستی، خشکی به عنوان یکی ازمهم ترین فاکتورهای محدود کننده رشد و محصول دهی در چای درمناطق چایخیز دنیا است. در این تحقیق اثرات تنش خشکی و تعدیل اثرات حاصل از تنش با آبیاری مجدد مورد بررسی قرار گرفت. نمونه گیری در دو مرحله 10 روزه (اعمال تنش خشکی با قطع آبیاری) و 17 روزه (دو بار آبیاری مجدد در طول یک هفته) انجام شد. روند تغییرات بیان آنزیم سوپراکسید دیسموتاز به روش real-time pcr و...

15 صفحه اول

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 4  issue 8

pages  1- 10

publication date 2015-03-19

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023