پویش ژنگان کل برای تعیین جایگاه‌های تحت انتخاب مثبت در گوسفندان نژاد زندی
Authors
Abstract:
شناسایی مناطق ژنگانی (ژنوم) که هدف انتخاب بودهاند، یکی از راهکار‌های اصلی تحقیقات زیستی است. هدف این پژوهش، پویش کل ژنگان برای شناسایی مناطقی از ژنگان گوسفندان نژاد زندی که در طی سالهای مختلف هدف انتخابهای طبیعی یا مصنوعی قرار گرفته‌اند، بود. بدین منظور 96 رأس گوسفند نژاد زندی با استفاده از آرایههای ژنگانی Illumina ovine SNP50K BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. برای شناسایی نشانههای انتخاب بر پایۀ روشهای نداشتن تعادل پیوستگی (لینکاژی) از آزمون (iHS)integrated haplotype score استفاده شد. نتایج یازده منطقۀ ژنگانی روی کروموزومهای 1 (2 منطقه)، 3، 6، 7، 8، 9، 10، 17، 22 و 26 را شناسایی کرد. تجزیه‌وتحلیل داده‌های زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد، برخی از این مناطق ژنگانی به‌طور مستقیم و غیرمستقیم با ژنهای مؤثر بر سازگاری (آداپتاسیون) به آب‌وهوای گرم و خشک (DNAJB4، HSPA4L، MSRB3)، پاسخ ایمنی (IL23A، STAT6، LY96)، توسعه و اندازۀ بدن (STAC3، LAP3)، توسعۀ نظام ساختار بدنی یا اسکلتی (SPP1، MEPE، IBSP) و سوخت‌وساز (متابولیسم) انرژی (ATP5B، GLS2، CS) همپوشانی دارند. درنهایت بررسیQTLهای گزارش‌شده در ژنگان گوسفند نشان داد، این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با رشد، لاشه و پشم در ارتباط است. به‌هرحال، برای شناسایی دقیق این ژنها و QTLها لازم است بررسی‌های پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام شود.
similar resources
برآورد مؤلفه‌های (کو) واریانس و پارامترهای ژنتیکی کل وزن شیرگیری بره‌های هر میش تحت آمیزش در نژاد زندی
این مطالعه برای برآورد پارامترهای ژنتیکی صفت ترکیبی مجموع وزن بره‌های از شیر گرفته شده هر میش تحت آمیزش (TWW/EJ) در دوره‌های زایش اول تا چهارم از رکوردهای 1912 میش که طی 17 سال (1370-1386) در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند زندی، واقع در ایستگاه خجیر تهران جمعآوری شده بود، انجام شد. برآوردها با استفاده از روش حداکثر درستنمایی محدود شده و بر اساس مدل‌های حیوانی یک متغیره و چند متغیره انجام شد...
full textمطالعه ساختار و لایهبندی جمعیتی و ارتباط ژنومی هاپلوتیپی صفات کیفی پشم در گوسفندان نژاد زندی
زمینه مطالعاتی: شناسایی ژنهای بزرگ اثر، مؤثر بر صفات مهم اقتصادی یکی از مهم‌ترین اهداف اصلاح نژادی در پرورش گوسفند است. هدف: این تحقیق به منظور بررسی ساختار و لایهبندی جمعیتی و شناسایی جایگاه‌ها و ژنهای مرتبط با صفات کیفی پشم، از طریق مطالعه ارتباط ژنومی هاپلوتیپی (GWAS) با استفاده از تراشه SNP ژنوم گوسفند (Illumnia SNPChip 50K Beadchip) در یک جمعیت گوسفند زندی بود. روشکار: برای هر دام، صفا...
full textپویش کل ژنوم هشت نژاد گاو بومی ایران برای شناسایی نشانه های انتخاب
در تحقیق حاضر، قسمت‌هایی از ژنوم گاوهای بومی ایران که شواهدی از انتخاب برای جهش‌های مختلف را نشان می‌دهند، شناسایی شد. بدین منظور از داده‌های 777962 نشانگر چندشکلی تک‌نوکلئوتید پراکنده در سرتاسر ژنوم و 90 حیوان از هشت نژاد گاو بومی ایران (سرابی، کرمانی، سیستانی، نجدی، کردی، تالشی، پارس و مازندرانی) برای شناسایی نشانههای انتخاب استفاده شد. بررسی تمایز جمعیتی با استفاده از روش شاخص تثبیت (Fst)...
full textتعیین جایگاه‌های تحت انتخاب مثبت در نژادهای گوسفند ایرانی بلوچی و زل
نشانههای انتخاب در کل ژنگان (ژنوم)، ما را در درک سازوکارهای انتخاب و شناسایی مناطقی از ژنگان که در طی سالیان متمادی به‌صورت طبیعی و یا مصنوعی انتخاب شدهاند، راهنمایی میکنند. هدف این تحقیق شناسایی نقاطی از ژنگان در گوسفندان زل و بلوچی بود که در طی سالهای مختلف به‌صورت مصنوعی یا طبیعی انتخاب شدهاند. 143 رأس گوسفند بلوچی (96 رأس) و زل (47 رأس)، با استفاده از آرایههای ژنگانیIllumina ovine SN...
full textبررسی ساختار جمعیت و شناسایی نواحی تحت انتخاب در ژنگان اسب‌های کرد و عرب ایرانی
اسب عرب از قدیمیترین نژادهای اسب جهان است. این نژاد عملکرد بسیار خوبی در مسابقات استقامتی و به‌طورکلی عملکرد ورزشی داشته و در تشکیل برخی نژادهای مهم جهان نقش داشته است. در مقابل، اسب کرد که بیشتر در زمین‌های ناهموار و مناطق کوهستانی زندگی میکند، مناسب سواری در مناطق کوهستانی و مسابقات چوگان است. برای بررسی ساختار جمعیت و شناسایی قطعه‌های کروموزمی تحت انتخاب در این دو جمعیت، از 38 اسب عرب و 58...
full textMy Resources
Journal title
volume 48 issue 4
pages 533- 548
publication date 2018-02-20
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023