آنالیز شبکه برهم کنش پروتئین - پروتئین سلول‌های فیبروبلاست انسانی تیمار شده با الکل اتانول
نویسندگان
چکیده مقاله:
سابقه و هدف: مطالعات انجام شده نشان می‌دهد که اتانول بیان پروتئین‌ها متعددی را در سلول‌های فیبروبلاست تغییر می‌دهد. تعدادی از این پروتئین‌ها از فاکتورهای مهم در سرطان‌زایی هستند. بنابراین، آنالیز نقش عملکردی و برهمکنش این دسته از پروتئین‌ها به منظور شناسایی مکانیسم‌های عملکردی و سرطان‌زایی الکل دارای اهمیت است. مواد و روش‌ها: در این تحقیق با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape و الگوریتم‌های وابسته، شبکه برهمکنش پروتئینی، شش پروتئین شناسایی شده در پروتئوم سلول‌های فیبروبلاست (HFFF2) تیمار شده با الکل اتانول که تغییرات کاهشی محسوسی داشته‌اند آنالیز شد. یافته‌ها: با توجه به بررسی‌های به‌دست آمده شبکه برهمکنش پروتئینی به‌دست آمده شامل 756 گره و 1166 اتصال است. نتایج نشان می‌دهند که Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 با 528=Degree و 74/0=Betweenness centrality پروتئینی کلیدی محسوب می‌شود و الکل سبب اختلال در بیان آن می‌شود. هم‌چنین بر اساس مطالعه کمپلکس‌های پروتئینی، این پروتئین حضور بارزی در کمپلکس‌های مختلف دارد. از سوی دیگر نتایج آنالیز نرم‌افزار DAVID نشان می‌دهد که این پروتئین‌ها در تنظیم بخش عظیمی از فرایندهای درون سلولی مداخله می‌نماید. نتیجه‌گیری: شش پروتئین‌هایی که میزان بیان آنها تحت تاثیر الکل تغییر یافته است علاوه بر آن که می‌توانند خطر ابتلا به سرطان افزایش دهند، فرایندهای درون سلولی متنوعی را نیز مختل می‌کنند که Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 در این میان مهم‌ترین پروتئین است
منابع مشابه
آنالیز شبکه برهم کنش پروتئین - پروتئین سلول های فیبروبلاست انسانی تیمار شده با الکل اتانول
سابقه و هدف: مطالعات انجام شده نشان می دهد که اتانول بیان پروتئین ها متعددی را در سلول های فیبروبلاست تغییر می دهد. تعدادی از این پروتئین ها از فاکتورهای مهم در سرطان زایی هستند. بنابراین، آنالیز نقش عمل کردی و برهم کنش این دسته از پروتئین ها به منظور شناسایی مکانیسم های عمل کردی و سرطان زایی الکل دارای اهمیت است. مواد و روش ها: در این تحقیق با استفاده از نرم افزار cytoscape و الگوریتم های واب...
متن کاملبررسی ویژگی‌های توپولوژیکی ژن‌های تغییر بیان یافته خون در شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین برای بیماری دیابت نوع 1
سابقه و هدف: بیماری دیابت نوع 1 در نتیجه تخریب خودایمنی سلول‌های بتا تولید‌کننده انسولین در پانکراس ایجاد می‌شود. برای گسترش درمان بیماری، شناسایی نشانگرهای درمانی کارآمد مورد نیاز است. روش‌های سیستم بیولوژی سبب فهم بهتری از عوامل عملکردی در بیماری می‌گردند. هدف این مطالعه، جستجوی نشانگرهای کاندید در این بیماری با بررسی ویژگی‌های توپولوژیکی زیرشبکه حاصل از تلفیق داده‌های بیان ژن و برهمکنش پروت...
متن کاملپیدا کردنِ موتیف در شبکه های وزن دار برهم کنش پروتئین-پروتئین
شبکه های زیست شناسی، که عموماً شبکه هاِیی پیچیده و وسیع هستند، حاوی اطلاعات مهمی می باشند. امروزه نظر به پیشرفتِ قابل ملاحظه آنها ، عملیاتی بر روی این گونه شبکه ها برای استخراجِ اطلاعاتی که هر کدام از آنها دربردارند اِعمال می شود. از میان مهم ترین آنها پیدا کردن موتیف های شبکه است. موتیف به صورت الگوهایی از ارتباطات تعریف می شود که در شبکه با فراوانی بیشتری نسبت به حالت تصادفی مشاهده می شود. تحقیقات...
15 صفحه اول: مطالعه برهم کنش برخی داروها با برخی پروتئین های انسانی توسط روش های شبیه سازی مولکولی
امروزه داروهای ضد صرع از جمله داروهایی هستندکه مورد توجه زیادی واقع شده اند. در این پایان نامه به مطالعه ی داروی لاموتریژن که نوعی داروی ضد صرع می باشد، توسط نظریه تابعیت چگالی و شبیه سازی دینامیک مولکولی پرداخته شده است. پارامترهای میدان نیروی متعلق به این دارو برای اولین بار محاسبه شده است. برای رسیدن به پارامترهای میدان نیروی مورد نظر از طریق نظریه تابعیت چگالی از نر م افزارg09 استفاده شده ا...
15 صفحه اولاثرات اتانول بر تغییرات کروموزمی سلول‌های فیبروبلاست انسانی
سابقه و هدف: مصرف اتانول یا الکل اتیلیک منجر به اثرات سمی در بدن می شود. مسیرهای متابولیسیمی متنوع این ماده در بدن می تواند متابولیت‌هایی ایجاد کند که برای بدن سمی هستند. هدف این مطالعه یررسی اثرات اتانول بر تغییرات کروموزمی سلول‌های فیبروبلاست انسانی است. مواد و روش‌ها: سلول‌های فیبروبلاست انسانی به مدت 48 ساعت در محیط کشت RPMI حاوی اتانول با دو غلظت 54 و 108 میلی‌مولار قرار داده شدند...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 18 شماره 1
صفحات 35- 41
تاریخ انتشار 2016-09
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023