تعیین هویت ایزوله‏ های بالینی مایکوباکتریوم جدا شده از بیماران ایرانی با استفاده از روش‏های فنوتیپیک و مولکولی

سابقه و هدف. از آنجایی که گونه‏های مختلف مایکوباکتریوم دارای الگوی حساسیت دارویی متفاوتی می‏باشند، شناسایی دقیق برای به کار گیری درمان صحیح ضروری است و نهایتاً می تواند بر نتیجه درمان بیمار موثر باشد. در میان روش‏های مولکولی گوناگون استفاده از بررسی پلی مورفیسم حاصل از هضم آنزیمی محصول (PCR (PRAبر اساس ژن hsp65 به علت آسان بودن، سریع و ارزان بودن برای شناسایی ایزوله‏های پاتوژن مایکوباکتریومی تا سطح گونه ارجهیت دارد. تلفیقی از روش‏های فنوتیپیک و PRA بر اساس قطعه 441 جفت بازی از ژن hsp65 برای شناسایی تنوع گونه‏های ایزوله‏های بالینی مایکوباکتریومی مورد استفاده قرار گرفت. مواد و روش‏ها. سویه‏های مورد بررسی شامل 270 ایزوله‏های بالینی مایکوباکتریومی می‏شدند که از 2358 بیمار در دو آزمایشگاه مرجع جمع آوری شده بودند. تعداد 207 ایزوله متعلق به مایکوباکتریوم توبرکولوزیس به وسیله روش‏های فنوتیپیک رایج و PCR اختصاصی بر اساس شناسایی IS6110 تشخیص داده شدند. ایزوله‏های متعلق به مایکوباکتریوم‏های محیطی (NTM) با استفاده از تعدادی تست فنوتیپکی و PRA ژن hsp65 مورد شناسایی قرار گرفتند. یافته‏ها. از تعداد 270 سویه بالینی تعداد 207 ایزوله با استفاده از روش‏های فنوتیپکی و PCR اختصاصی بر اساس IS6110، به عنوان مایکوباکتریوم توبرکلوزیس شناخته شدند. سویه‏های NTM (63 ایزوله) تنوعی از گونه‏های مختلف شامل 12 ایزوله M. simiae، 9 ایزوله M. fortuitum، 5 ایزوله M. gordonae، 5 ایزوله M. abscessus، 5 ایزوله M. kansasii و گونه‏های کمیاب شامل 3 ایزوله M. massilainase، 3 ایزوله M. thermoresitbile، 2 ایزوله M. senegalense type 2، 1 ایزوله M. conceptionense type 1 یا M. senegalense type 1، 1 ایزوله M. phlei، 1 ایزوله M. chelonae، 1 ایزوله M. nonchromogenicum، 1 ایزوله M. genavense،1 ایزوله M. montefiorense یا M. triplex،1 ایزوله M. branderi، 1 ایزوله M. novocastrense، 1 ایزوله M. nebraskense،1 ایزوله M. lentiflavumو 1 ایزوله M. avium شدند. نتیجه گیری. این مطالعه نشان داده که تکنیک hsp65-PRA یک روش ساده، سریع و دقیق برای شناسایی ایزوله‏های بالینی NTM می باشد.