تعیین ویژگی‌های ژنوم کامل یک جدایه ویروس کوتولگی زرد جو (BYDV-PAV) از ایران

نویسندگان

  • آرزو پاکدل نویسنده
  • علیرضا افشاری‌فر مسئول مکاتبه
  • کرامت‌اله ایزدپناه نویسنده
چکیده مقاله:

ویروس‌های کوتولگی زرد جو یکی از مهمترین ویروس‌های غلات در دنیا می باشند. بررسی‌های انجام‌شده بیانگر پراکنش ویروس‌های کوتولگی زرد جو (Barley yellow dwarf virus, BYDV) و غلات (Cereal yellow dwarf virus, CYDV) در کشور و غالب بودن BYDV-PAV می‌باشد. به منظور تعیین ترادف کامل ویروس کوتولگی زرد جو (BYDV-PAV) در ایران، جدایه‌ای از منطقه اسفندقه از استان کرمان که دارای علائم شدید آلودگی به ویروس مذکور بود انتخاب شد. استخراج آر. ان. ای کل از بافت گیاهی آلوده به ویروس با استفاده از کیت TM RNX (-plus) (شرکت سیناژن) انجام شد. کل ژنوم ویروس با استفاده از نه جفت آغازگر اختصاصی PAV با روش RT-PCR تکثیر شد. قطعه‌های تکثیرشده با استفاده از InsT/AClone PCR Product Cloning Kit (Fermentas) در پلاسمید PTZ57R/T وارد و در سویه  DH5αباکتری Escherichia coliهمسانه‌سازی شد. آنالیز ترادف نوکلئوتیدی کامل نشان داد که جدایه کرمان ویروس کوتولگی زرد جو (KP771878) با 94% در صد تشابه با جدایه‌های AF235167 (از ایلی نویز آمریکا) و EF043235 (جدایه کانزاس از آمریکا) در یک گروه قرار می‌گیرند در حالیکه در صد تشابه این جدایه با سایر جدایه‌های موجود در بانک ژن کمتر از 90% می‌باشد و کمترین در صد تشابه آن با جدایه AY855920 از چین (78%) است. نتایج حاصل از مقایسه ترادف‌ها در سطح هر یک از ژن‌ها نیز، وجود تنوع زیاد در بین جدایه‌های این ویروس و همچنین احتمال نوترکیبی ژن‌ها را تایید می‌نماید. به طوری که ORF4 حفاظت‌شده‌ترین و ORF6 متغیرترین ناحیه در ژنوم این ویروس است.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

تعیین ویژگی های ژنوم کامل یک جدایه ویروس کوتولگی زرد جو (bydv-pav) از ایران

ویروس های کوتولگی زرد جو یکی از مهمترین ویروس های غلات در دنیا می باشند. بررسی های انجام شده بیانگر پراکنش ویروس های کوتولگی زرد جو (barley yellow dwarf virus, bydv) و غلات (cereal yellow dwarf virus, cydv) در کشور و غالب بودن bydv-pav می­باشد. به منظور تعیین ترادف کامل ویروس کوتولگی زرد جو (bydv-pav) در ایران، جدایه­ای از منطقه اسفندقه از استان کرمان که دارای علائم شدید آلودگی به ویروس مذکور ب...

متن کامل

القای مقاومت به ویروس کوتولگی زرد جو (BYDV-PAV) در گندم نان با به‌کارگیری روش خاموشی ژن پس از ترانویسی

بیماری‌های کوتولگی زرد جو و کوتولگی زرد غلات از مخرب‌ترین و وسیع‌ترین بیماری‌های ویروسی غلات دانه ریز هستند. خسارت‌های ناشی از ویروس‌های عامل بیماری از یک سو و محدود بودن، ناکارآمد بودن و ژنتیک پیچیده ژن‌های مقاومت از دیگر سو، زمینه به‌کارگیری رهیافت‌های نوین مبتنی بر مقاومت با واسطه ویروس را توجیه می‌نماید. در تحقیق حاضر سه نوع سازه سنس، آنتی سنس و سنجاق سری دارای اینترون با استفاده از قسمتی ا...

متن کامل

خالص‌سازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس

ویروس موزائیک زرد کدو (Zucchini yellow mosaic virus) ازنمونه‌های کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به‌عنوان جدایه فارس این ویروس ((ZYMV-F به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. ZYMV-F در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافت‌های آلوده برای خالص‌سازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتی‌سرمب...

متن کامل

ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل و جایگاه تاکسونومیکی جدایه های جو و گندم سویه گندم ویروس کوتولگی گندم در ایران

ویروس کوتولگی گندم ((wdv از عوامل اصلی ایجادکننده بیماری های کوتولگی و زردی غلات است. دو سویه جو (wdv-b) و گندم (wdv-w) از این ویروس از مزارع گندم و جو مناطق مختلف ایران گزارش شده­اند. مطالعه پراکنش سویه های wdv در مزارع غلات ایران نشان داده است که wdv-w از گسترش بیشتری نسبت به wdv-b برخوردار است. بیش از این ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل یک جدایه از wdv-b از استان خراسان (wdv-bar[ir:bar]) تعیین شد...

متن کامل

خالص سازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس

ویروس موزائیک زرد کدو (zucchini yellow mosaic virus) ازنمونه­های کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به عنوان جدایه فارس این ویروس ((zymv-f به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. zymv-f در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافت­های آلوده برای خالص­سازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتی­سرمبه دست آمده...

متن کامل

بررسی بیان چند ژن مرتبط با دفاع میزبانی در یک رقم متحمل گندم پس از آلودگی با ویروس کوتولگی زرد جو ( bydv-pav)

ویروس های کوتولگی زرد جو یکی از وسیع الانتشارترین و خسارت بارترین ویروس های غلات در سراسر دنیا می باشند. بررسی های انجام شده بیانگر پراکنش ویروس های کوتولگی زرد جو (bydvs) و غالب بودن bydv-pav در کشور می باشد. گیاهان دارای چندین مکانیزم دفاع القایی در مقابل بیمار گر های میکروبی هستند از جمله sar (مقاومت سیسمیک اکتسابی) و isr (مقاومت سیستمیک القایی). sar با افزایش موضعی و سیستمیک میزان sa درونی ...

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 51  شماره 2

صفحات  163- 176

تاریخ انتشار 2015-11-01

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023