ردیابی مولکولی پاتوژن های قزل آلا در مزارع پرورشی به روش Lamp PCR

نویسنده

چکیده مقاله:

 مقدمه و هدف: هدف از این مطالعه ، مروری بر روش مولکولی Lamp PCR در شناسایی و ردیابی پاتوژن های مهم قزل آلای پرورشی با تاکید بر دو بیماری مهم (Bacterial Kidney Disease (BKD و (Enteric Redmouth Disease (ERM در آبزیان بود. Loop-mediated Isothermal Amplification) Lamp PCR)، یا تکثیر همدمای وابسته به لوپ، از روش های تغییر یافته PCR است که قادر به تکثیر کپی های متعدد از توالی هدف، در کمتر از یک ساعت و بدون نیاز به معرف های خاص است. از مزایای Lamp PCR نسبت به PCR کلاسیک ، سادگی ، سرعت ، عدم نیاز به ترموسایکلرو جلوگیری از آلودگی های احتمالی است. (BKD) بیماری کلیوی باکتریایی که توسط باکتری Renibacterium salmoninarum ایجاد و علائمی از قبیل زخم های باز روپوستی، آسیب شدید کلیوی(تورم با سطح چین دار) وکبد و طحال دارد. قابل انتقال از گونه ای به گونه دیگر وحتی در جریان تخم ریزی قزل آلا است.  مواد و روش کار: در مطالعه saleh و همکاران، سویه های بیماری زا جمع آوری و در محیط کشت انتخابی (SKDM) آگارکشت و توسط تست های بیوشیمیایی شناسایی شدند. DNA ژنومی سویه ها استخراج، و واکنش در حضور پلی مراز Bstانجام شد. پرایمرهای Lamp وپروب های فلورسنت براساس پروتئین آنتی ژن P57 (پروتئین سطحی و ترشحی) کد کننده ژن باکتری R. salmoninarum طراحی گردید. محصولات Lamp توسط  (Fluorescent Detection Reagent (FDR و با استفاده از SYBR Green رقیق شده در DMSO رد یابی گردید. نتایج و بحث: محصولات واکنش با استفاده از ژل الکتروفورز و همچنین real time بررسی شد. اختصاصیت آزمون توسط هضم آنزیمی با EcoRV که باند های 90 و 120 bp ایجاد می کرد، ارزیابی شد. محصولات Lamp بعد از افزودن SYBR Green به رنگ سبز قابل مشاهده بود. رد یابی سریع پاتوژن ها در مزارع پرورش ماهی به منظور جلوگیری از انتشار سریع عفونت امری ضروری به نظر می رسد. با وجود اینکه PCR روش موثری برای ردیابی این پاتوژن هاست، اما تجهیزات گرانقیمت مانند ترموسایکلر را نیاز دارد. در این مطالعه از روش real-time LAMP برای ردیابی استفاده شد که در آن تنها با استفاده از یک تیوب و بن ماری برای تنظیم حرارت استفاده شد.     

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

ردیابی مولکولی پاتوژن های قزل آلا در مزارع پرورشی به روش lamp pcr

مقدمه و هدف: هدف از این مطالعه ، مروری بر روش مولکولی lamp pcr در شناسایی و ردیابی پاتوژن های مهم قزل آلای پرورشی با تاکید بر دو بیماری مهم (bacterial kidney disease (bkd و (enteric redmouth disease (erm در آبزیان بود. loop-mediated isothermal amplification) lamp pcr)، یا تکثیر همدمای وابسته به لوپ، از روش های تغییر یافته pcr است که قادر به تکثیر کپی های متعدد از توالی هدف، در کمتر از یک ساعت و...

متن کامل

مقایسه‌ی دو روش مولکولی PCR و LAMP در تشخیص سالمونلا

Background and Objective: There are several techniques for the diagnosing of salmonella infectious. Several molecular methods such as PCR and hybridization assay have recently been used for the detection of this bacterium. However, these methods require precision instruments for amplification and complex procedures, which are the major obstacles to the widespread use of these methods in relativ...

متن کامل

بررسی عوامل موثر بر عملکرد مزارع پرورشی ماهی قزل آلا در شهرستان ماهنشان

افزایش عملکرد کمی و کیفی مزارع پرورش ماهی قزل آلا در سال های اخیر با توجه به افزایش سرانه مصرف گوشت سفید بخصوص ماهی ضروری است. از عوامل مهم اثرگذار بر عملکرد این واحدها، سطح دانش و مهارتهای مدیریتی پرورش دهندگان مزارع می باشد. تحقیق توصیفی همبستگی حاضر با هدف بررسی عوامل موثر بر عملکرد پرورش دهندگان ماهی قزل آلا در شهرستان ماهنشان صورت گرفت. جامعه آماری تحقیق را کلیه واحدهای پرورش ماهی قزل آلای...

تعیین ضخامت عدسی چشم ماهی قزل آلا به روش اولتراسونوگرافی

مطالعه حاضر یکی از مهمترین اجزاء چشم یعنی عدسی چشم ماهی را مورد بررسی قرار داده و با اندازه گیری آن به جزئیات عضو مورد نظر که در مسایل تغذیهای و حفاظتی نقش بسزایی دارد اشاره مینماید. یکی از روشهای کاربردی تصویر برداری تشخیصی چشم استفاده از اولتراسوند است که در این روش با استفاده از یک باریکه امواج صوتی مخصوصی که مستقیماً به چشم فرستاده میشود و برگشت اکوهای صوتی مختلفی که در اثر برخورد این اموا...

متن کامل

مطالعه ی پراکنش بیماری نکروز عفونی پانکراس در مزارع قزل آلای ایران به روش RT-PCR

    در این مطالعه پراکنش جغرافیایی بیماری ویروس نکروز عفونی پانکراس به روش مولکولی (RT-PCR) در 18 استان کشور و در قالب بررسی موردی طی سال‌های 1391-1390 انجام گرفته است.  با توجه به بروز عفونت‌های هم زمان بیماری‌های نکروز عفونی پانکراس (IPN)، نکروز عفونی بافت خون‌ساز (IHN) و سپتی سمی هموراژیک ویروسی (VHS) و نیز علائم بالینی مشابه ناشی از این بیماری‌ها، همه‌ی موارد نمونه‌های مورد مطالعه از بچه ما...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 4  شماره 1

صفحات  144- 144

تاریخ انتشار 2012-08-22

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023