طراحی مدلهای پیشبینی، جهت تعیین ساختار آنزیم استریول آسیل کریر پروتئین دیسچوراز 1
نویسندگان
چکیده مقاله:
زمینه و هدف: اسیدهای چرب ضروری مانند آلفا لینولئیک اسید به‌عنوان یک امگا-3 و آلفا لینولئیک اسید به‌عنوان یک امگا-6 در سلول‌های انسانی تولید نمی‌شوند. بنابراین، به‌وسیله منابع غذایی مانند ماهی، روغن سویا، دانه کتان و دانه‌های آفتابگردان تأمین می‌شوند. مراحل تولید آلفا لینولئیک اسید توسط 6 آنزیم صورت می‌گیرد که یکی از آنها آسیل کریر پروتئین دیسچوراز است. این مطالعه با هدف طراحی مدلهای پیشبینی جهت تعیین ساختار ارگانیزمی آنزیم استریول آسیل کریر پروتئین دیسچوراز 1 انجام شد. روش بررسی: تعدادی از ابزارهای بیوانفورماتیک جهت تعیین مهم‌ترین مشخصه‌های ژنی آنزیم آسیل کریر پروتئین دیسچوراز به جهت توسعه مدلهای پیشبینی ارگانیزمی اجرا شد. سپس از تکنیک‌های داده‌کاوی مانند (Feature selection, Decision tree, Classification models) در جهت تولید الگوریتم‌های پیشبینی دقیق و کارآمد برپایه خصوصیات ژنی آنزیم (S-ACP-DES1) از ارگانیزم‌های مختلف استفاده شد. یافته‌ها: مهم‌ترین متغیر ژنی در تشخیص ساختارهای ارگانیزمی آنزیم (S-ACP-DES1)، فراوانی طول بوده است. همچنین مدلهای پیشبینی طراحی‌شده نشان داد مدل Naive Bayse با معیار FCdb با دقت 38/97% می‌تواند ارگانیزم آنزیم‌های جدید را براساس خصوصیات ژنی پیشبینی کند. دو یافته فوق برای اولین بار در این مطالعه گزارش شدند. نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان داد با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی می‌توان به‌سهولت نسبت به دسته‌بندی آنزیم DESA1 براساس ارگانیزم آن اقدام کرد و متغیر طول ژن‌ها، بهترین شاخص برای این دسته‌بندی است. همچنین بهترین ماشین یادگیری مدل Baysian درNaive Bayse با دقت بالای 38/97% جهت تعیین آنزیم DESA1 برای اولین بار در این مطالعه گزارش شد.
منابع مشابه
طراحی مدل های پیش بینی، جهت تعیین ساختار آنزیم استریول آسیل کریر پروتئین دیسچوراز ۱
زمینه و هدف: اسیدهای چرب ضروری مانند آلفا لینولئیک اسید به عنوان یک امگا-3 و آلفا لینولئیک اسید به عنوان یک امگا-6 در سلول های انسانی تولید نمی شوند. بنابراین، به وسیله منابع غذایی مانند ماهی، روغن سویا، دانه کتان و دانه های آفتابگردان تأمین می شوند. مراحل تولید آلفا لینولئیک اسید توسط 6 آنزیم صورت می گیرد که یکی از آنها آسیل کریر پروتئین دیسچوراز است. این مطالعه با هدف طراحی مدل های پیش بینی ج...
متن کاملبررسی بیوانفورماتیکی ژن آسیل کریر پروتئین (ACP) در یوکاریوت‌ها و پروکاریوت‌ها
مسیر بیوسنتز اسید چرب یکی از مسیرهای مهم در بدن اکثر موجودات (پروکاریوت‌ها و یوکاریوت‌ها) است که آنزیم Acyl carrier protein (ACP) نقش مهمی در مسیر بیوسنتز اسید چرب دارد. هدف از این مطالعه آنالیز in silico و فیلوژنتیکی ژن ACP است. با آنالیز های بیشتر مشخص شد که ژنACP در پروکاریوت‌ها دارای 4 اگزون و 3 اینترون و 2mRNA و در یوکاریوت‌ها دارای 13 اگزون، 12 اینترون و 9 mRNA است. این پروتئین در یوکا...
متن کاملبررسی بیوانفورماتیکی ژن آسیل کریر پروتئین (ACP) در یوکاریوت‌ها و پروکاریوت‌ها
مسیر بیوسنتز اسید چرب یکی از مسیرهای مهم در بدن اکثر موجودات (پروکاریوت‌ها و یوکاریوت‌ها) است که آنزیم Acyl carrier protein (ACP) نقش مهمی در مسیر بیوسنتز اسید چرب دارد. هدف از این مطالعه آنالیز in silico و فیلوژنتیکی ژن ACP است. با آنالیز های بیشتر مشخص شد که ژنACP در پروکاریوت‌ها دارای 4 اگزون و 3 اینترون و 2mRNA و در یوکاریوت‌ها دارای 13 اگزون، 12 اینترون و 9 mRNA است. این پروتئین در یوکا...
متن کاملبررسی تأثیر جهش‌های نقطه‌ای ژن آنزیم آسیل کوآ- دهیدروژناز زنجیر کوتاه (SCAD) بر ساختار آنزیم با مدلسازی
متن کامل
تاثیر چرخه تجاری بر پایداری مدلهای پیشبینی ورشکستگی
پژوهش حاضر به بررسی تاثیر چرخه تجاری بر پایداری الگوهای پیشبینی ورشکستگی در محیط اقتصادی ایران میپردازد. در این پژوهش چرخه تجاری ایران با استفاده از فیلتر هدریک پرسکات شناسایی شده و برای پیشبینی ورشکستگی از مدلهای لاجیت و تحلیل تمایزی استفاده شده است. دادههای مالی 118 شرکت پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران برای سال‌های 1381تا 1390 جمع‌آوری و فرضیه پژوهش با مقایسه کارایی و پایداری مدل...
متن کاملارزیابی مدلهای رگرسیون در پیشبینی هزینههای تعمیر و نگهداری تراکتور
مدیریت جایگزینی ماشین (به ویژه تراکتور) یکی از فاکتورهای کلیدی در انجام دادن به موقع عملیات زراعی میباشد. بنابراین باید با دقت هزینههای تعمیر و نگهداری تراکتور پیشبینی شود. این تحقیق برای ارزیابی تکنیک رگرسیونی در پیشبینی هزینههای تعمیر و نگهداری تراکتور اجرا شد. در این مطالعه از دادههای واقعی 60 تراکتور دو چرخ محرک موجود در کشت و صنعت آستان قدس رضوی استفاده شده است. تجزیة رگرسیونی انجام ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 9 شماره 8
صفحات 13- 20
تاریخ انتشار 2015-10
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023