مطالعه ارتباط کمّی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت مهارکنندگی PIM مشتق‌های تری آزولوپیریدین با استفاده از الگوریتم ژنتیک ـ برازش خطی چندگانه

نویسندگان

  • مهدی نکوئی گروه شیمی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شاهرود، شاهرود، ایران
چکیده مقاله:

مطالعه ارتباط کمی ساختار ـ فعالیت (QSAR) برای مد­ل­ سازی و پیش­ بینی فعالیت مهارکنندگی PIM،39 ترکیب از مشتق­ های تری آزولوپیریدین به کار گرفته شد. نخست پس از رسم و بهینه سازی ساختار ترکیب­ ها و محاسبه توصیف کننده ­ها، مجموعه داده ­ها به­ صورت تصادفی به دو مجموعه آموزش و آزمون تقسیم شد. در انتخاب مهم­ترین توصیف کننده­ ها روش گام به گام (SW) و الگوریتم ژنتیک (GA) استفاده شد. سپس برای مدل­ سازی و پیش­ بینی فعالیت های ترکیب ­ها از روش برازش خطی چندگانه (MLR) استفاده شد. مقایسه مدل­ های SW-MLRو GA-MLR نشان داد که GA-MLR نسبت به SW-MLR نتیجه­ های بهتری به­ دست می­ دهد. سپس برای بررسی اعتبار مدل ­ها از روش ­های اعتبارسنجی تقاطعی (LOO) و (LGO)، Y- تصادفی و آزمون خارجی استفاده شد. این مطالعه نشان داد که مدل GA-MLR با پنج توصیف کننده می­ تواند برای پیش ­بینی فعالیت ترکیب­ های دارویی همانند به کار رود و همچنین از تحلیل توصیف کننده­ های مدل می­ توان در طراحی ترکیب ­های دارویی نوین استفاده کرد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

پیش بینی فعالیت ضدسرطانی مشتقات ۱و۸- نفتیریدین توسط روش الگوریتم ژنتیک-رگرسیون خطی چندگانه

سابقه و هدف: این مطالعه به مقایسه مدل سازی QSAR فعالیت ضد سرطانی ترکیبات ۱و۴-دی هیدرو-۴-اکسو-۱-(۲-تیازولیل)-۱و۸-نفتیریدین و مشتقات آن با روش رگرسیون خطی چندگانه مرحله ای (S-MLR ) و روش الگوریتم ژنتیک-رگرسیون خطی چندگانه (GA-MLR) پرداخت. روش بررسی: مجموعه ای از ۱۰۰ ترکیب با فعالیت ضد سرطانی مشخص از مقاله معتبر بین المللی انتخاب شد و روش میدان نیروی آلینجر MM2 برای کمینه کردن انرژی مولکول­ها استف...

متن کامل

کاربرد الگوریتم ژنتیک به همراه رگرسیون خطی چند گانه برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها

مطالعه ارتباط کمی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها، با استفاده از توصیف کننده های ساختاری و روش رگرسیون خطی چند گانه توسعه داده شده است. توصیف کننده های مولکولی با استفاده از الگوریتم ژنتیک انتخاب شدند. سپس یک مدل ساده، قوی، قابل تفسیر و با خطای کم و ضریب همبستگی بالا ساخته شد. نتایج نشان می دهد که تکنیک های خطی مانند رگرسیون خطی چند گانه که با یک روش انتخاب متغیر من...

متن کامل

روش های خطی و غیرخطی ارتباط کمی ساختار- فعالیت جهت پیش بینی فعالیت دارویی برخی از مشتقات آمینواسیدها

این پژوهش به پیش بینی فعالیت دارویی 38 مشتق آمینواسید به عنوان بازدارنده های هیستون دی استیلاز (hdac) جهت درمان سرطان و برخی از بیماری ها اختصاص دارد. آنزیم های hdac موجب تسریع روند حذف گروه های استیل از باقیمانده های لیزین از پروتیین های شامل هیستون (histone) می شوند. پس از محاسبه ی توصیف کننده های مولکولی مستقل، با استفاده از روش مرحله ای انتخاب متغیر و گزینش 4 توصیف کننده، جهت مدل سازی از رگ...

متن کامل

مطالعه روابط کمی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت دارویی ضد ایدز مشتقات ایمیدازول

در این مطالعه مدل یابی فعالیت ضد ایدز وضد آروماتاز (بیماری سرطان سینه) مبتنی برساختار مولکولی برخی از ترکیبات مربوط به مشتقات ایمیدازول، پریمیدازول، فتالازینون و بنزآلفاتالید همچنین مشتقات تری آزول و ایمیدازول با استفاده از روابط کمی ساختارـ فعالیت مورد بررسی قرار گرفت. مطالعه برروی دو مجموعه اصلی شامل 42مولکول با فعالیت ضد ایدز و57 مولکول با فعالیت ضد آروماتاز(بیماری سرطان سینه) با ?50 حداقل ...

15 صفحه اول

کاربرد الگوریتم ژنتیک به همراه رگرسیون خطی چند گانه برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها

مطالعه ارتباط کمی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها، با استفاده از توصیف کننده های ساختاری و روش رگرسیون خطی چند گانه توسعه داده شده است. توصیف کننده های مولکولی با استفاده از الگوریتم ژنتیک انتخاب شدند. سپس یک مدل ساده، قوی، قابل تفسیر و با خطای کم و ضریب همبستگی بالا ساخته شد. نتایج نشان می دهد که تکنیک های خطی مانند رگرسیون خطی چند گانه که با یک روش انتخاب متغیر من...

متن کامل

مطالعه ارتباط کمی ساختار- فعالیت برای پیش‌‌بینی شاخص LD50 در آفت‌کش‌های ارگانوفسفات

سموم ارگانوفسفات از جمله سموم شیمیایی خطرناک برای سلامت انسان محسوب می ­شوند. بسیاری از محققین، با وجود رعایت اصول ایمنی و جلوگیری از مواجهه با خطرات ناشی از استفاده از ترکیبات شیمیایی، به­ منظور بررسی میزان سمیت ترکیبات ارگانوفسفات در تماس با این سموم قرار دارند و احتمال جذب این سموم از طریق پوست وجود دارد. مطالعه ارتباط ساختار - فعالیت با کمک رو ش­ها و مدل­های تئوری پیش­بینی کننده، با صرف حدا...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 37  شماره 2

صفحات  137- 148

تاریخ انتشار 2018-08-23

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023