پروتکل روش پالس فیلد ژل الکتروفورزیس برای تایپ بندی سویه های اوروپاتوژنیک اشریشیاکلی
نویسندگان
چکیده مقاله:
مقدمه: ژل الکتروفورز در میدان ضربانی (pulsed field gel electrophoresis) یکی از بهترین روش هایی است که برای تیپ بندی و مطالعات اپیدمیولوژی در مناطق مختلف کاربرد دارد. این روش با قدرت تکرارپذیری و افتراق بالایی که دارد برای تمام پاتوژن های انسانی قابل استفاده می باشد. اما این روش بسیار حساس بوده و کوچک ترین تغییری در پارامترهای وابسته به آن باعث عدم نتیجه گیری درست می شود. با توجه به این موارد در مطالعه حاضر سعی شده است با استاندارد سازی بیش تر این روش و برطرف کردن اشکالات تکنیکی موجود در انجام آن به نتایج دقیق تری برای مقایسه سوش های مختلف در مطالعات اپیدمیولوژی دست یافت. روش کار: در تحقیق حاضر در راستای تعیین الگوی ژنتیکی سوش های اشریشیاکلی به وسیله پروتکل ژل الکتروفورز در میدان ضربانی، پارامتر های مختلفی از جمله غلظت DNA موجود در نمونه و رابطه آن با غلظت و طول مدت زمان مورد استفاده برای آنزیم ها مورد بررسی قرار گرفت. یافته ها: پس از بررسی های مختلف، مناسب ترین چگالی نوری (Optical Density) سوسپانسیون باکتریایی در طول موج 610 نانومتر بین 7/0 -6/0 نانومتر، غلظت آنزیم XbaI 150 واحد و زمان مناسب تاثیر آنزیم پروتئیناز K هفت ساعت مشخص شد. بحث و نتیجه گیری: به نظر می رسد که متغیر های مورد استفاده در این مطالعه برای بهینه سازی روش میدان ضربانی از اساسی ترین متغیر ها در راه اندازی یک روش کارآمد می باشند. بنابراین با رعایت نکات گفته شده، این روش ملکولی بیش از گذشته به محققین در مطالعات اپیدمیولوژی و مقایسه بین سوش های مختلف کمک خواهد کرد.
منابع مشابه
تایپینگ مولکولی سویه های بالینی اسینتوباکتر بومانی در شهر تهران با روش پالس فیلد ژل الکتروفورزیس
زمینه و هدف: امروزه، اسینتوباکتر بومانی (acinetobacter baumannii) به عنوان یک عامل مهم عفونت بیمارستانی در نظر گرفته می شود، چراکه اپیدمی های بیمارستانی ناشی از آن در نقاط مختلف گزارش شده است. از آنجایی که شناسایی مولکولی در حد سویه و گونه برای تعیین شیوع بیمارستانی از اهمیت بسیاری برخوردار است، این مطالعه با هدف تایپینگ مولکولی سویه های بالینی اسینتوباکتر بومانی در شهر تهران به روش پالس فیلد ژ...
متن کاملتیپ بندی مولکولی سویه های اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک(UPEC) در استان اصفهان و دسته‌بندی ژنتیکی جدایه‌های سروگروپ O25 به روش ERIC-PCR
سابقه و هدف: اشریشیاکلی شامل طیف گسترده ای از سویه های مختلف در اکوسیستم ها با تنوع زیاد در ژنوم آنها است. برخی از انواع سویه ها باعث ایجاد بیماری های جدی مانند عفونت های دستگاه ادراری (UTI) می گردند. اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک (UPEC) شایع ترین عامل ایجاد عفونت ادراری در انسان است. هدف از این مطالعه بررسی شیوع انواع سروگروپ های O در جدایه های اشریشیاکلی جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت ادراری در ...
متن کاملمولکولار اپیدمیولوژی سوشهای اشریشیاکلی جدا شده از عفونت های ادراری در کودکان
مقدمه: عفونت های ادراری از علل عمده مراجعه به بیمارستان ها و کلینیک ها است و درمان سریع آن به لحاظ ایجاد عوارض بسیار مهم است. از آنجا که باکتری اشریشیاکلی یکی از مهم ترین عامل های ایجاد عفونت های مجاری ادراری(UTI) در کودکان می باشد،این مطالعه ابتدا به بررسی الگوی مقاومت اشریشیاکلی های جدا شده از مجاری ادراری کودکان می پردازد. از آنجائی که تغییرات زیادی در خصوصیات فنوتیپی ارگانیسمهایی همچون اشری...
متن کاملشناسایی و تشخیص سویه های تهاجمی هموفیلوس آنفلوانزای تایپ b در نمونه های بالینی، به روش واکنش زنجیره ای پلیمراز
Background and purpose: Haemophilus influenzae type b (Hib), is one of the major causes of bacterial meningitis in children younger than five years of age, especially in countries that immunization against Hib is not conducted. In this study we have determined the serotype, encapsulated Haemophilus influenza strains isolated from clinical samples by polymerase chain reaction (PCR) method. Mater...
متن کاملردیابی مولکولی ژن کد کننده فیمبریه نوع یک (fimH) در سویه های اوروپاتوژنیک اشریشیاکلی جداشده از بیماران سرپایی مبتلابه عفونت مجرای ادراری
زمینه و هدف: عفونت مجرای ادراری یکی از متداولترین عفونتها در کلیه گروههای سنی است. اغلب این عفونتها توسط سویههای اوروپاتوژنیک اشریشیاکلی ایجاد میگردند. اتصال به سطح بافت پوششی مجرای ادراری، کلونیزاسیون و توانایی سویههای UPEC در ایجاد عفونتهای ادراری علامتدار به‌واسطه عوامل اتصالی نظیر فیمبریههای تیپ یک (fimH) انجام میشود. هدف این مطالعه تعیین فراوانی ژن کد کننده فیمبریه نوع یک (fimH...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 9 شماره 2
صفحات 1- 7
تاریخ انتشار 2011-05
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023