کلونینگ ژن PapG اشریشیاکلی یوروپاتوژن و بررسی تنوع توالی آن

زمینه: اشریشیاکلی یوروپاتوژن، پاتوژن غالب در عفونت‌های ادراری می‌باشد. عفونت‌های دستگاه ادراری، یکی از شایع‌ترین عفونت‎های انسانی می‌باشد. با وجود آنتی‌ژن‌ها و توکسین‌های مختلف باکتری‌های دخالت کننده در ایجاد عفونت، یکی از عوامل مهم در عفونت‌های ناشی از اشریشیاکلی و سایر باکتری‌های گرم منفی، چسبیدن باکتری به سطح سلول میزبان می‌باشد، بنابراین مهار اتصال باکتری، راهکاری مناسب جهت مهار عفونت می‌باشد. با توجه به‌اینکه، پروتئین PapG به‌عنوان ادهسین عمل می‌نماید، کاندیدی مناسب برای تهیه واکسن می‌باشد. مواد و روش‌ها: DNA ژنومیک باکتری اشریشیاکلی سویه بالینی حاوی ژن II papG، استخراج گردید. با طراحی پرایمر برای ژن papG II، واکنش PCR انجام گرفت. محصول PCR در پلاسمید (SK-)pBluescript کلون گردید. با استفاده از نرم‌افزار ClustalW و MEGA4 توالی به‌دست آمده با توالی ژنی موجود در بانک ژن هم‌طراز گردید و تنوع ژنی آن بررسی گردید. یافته‌ها بر اساس این همطرازی، ناحیه N ترمینال در سطح پروتئین و DNA حفاظت شده می‌باشد. نتیجه‌گیری: ناحیه N ترمینال ژن PapG در بین سویه‌های بالینی یک توالی حفاظت‌شده است و می‌توان از آن برای طراحی واکسن علیه عفونت ادراری استفاده نمود