نتایج جستجو برای: نشانگر est ssr

تعداد نتایج: 41992  

2007
Rajeev K. Varshney Kamel Chabane Prasad S. Hendre Ramesh K. Aggarwal Andreas Graner

A set of 16 expressed sequence tag (EST)-derived simple sequence repeat (SSR) and 15 EST-derived single nucleotide polymorphism (SNP) markers together with 4 amplified fragment length polymorphism (AFLP) primer combinations were analyzed on 43 wild (Hordeum vulgare ssp. spontaneum – HS), 35 cultivated (H. vulgare ssp. vulgare – HV) and 12 elite (H. vulgare ssp. vulgare – from EU) barley lines. ...

Journal: :Insect molecular biology 2007
Y Weng P Azhaguvel G J Michels J C Rudd

The abundance and distribution of microsatellites, or simple sequence repeats (SSRs) were explored in the expressed sequence tag (EST) and genomic sequences of the pea aphid, Acyrthosiphon pisum (Harris), and the green peach aphid, Myzus persicae (Sulzer). A total of 108 newly developed, together with 40 published, SSR markers were investigated for their cross-species transferability among six ...

2014
Sompong Chankaew Takehisa Isemura Sachiko Isobe Akito Kaga Norihiko Tomooka Prakit Somta Hideki Hirakawa Kenta Shirasawa Duncan A. Vaughan Peerasak Srinives

Vigna reflexo-pilosa, which includes a neglected crop, is the only one tetraploid species in genus Vigna. The ancestral species that make up this allotetraploid species have not conclusively been identified, although previous studies suggested that a donor genome of V. reflexo-pilosa is V. trinervia. In this study, 1,429 azuki bean EST-SSR markers were developed of which 38 EST-SSR primer pairs...

Journal: :In silico biology 2006
B. Jayashree Ramu Punna P. Prasad Kassahun Bantte C. Tom Hash Subhash Chandra David A. Hoisington Rajeev K. Varshney

Simple sequence repeats (SSRs) or microsatellites are an important class of molecular markers for genome analysis and plant breeding applications. In this paper, the SSR distributions within ESTs from the legumes soybean (Glycine max, representing 135.86 Mb), medicago (Medicago truncatula, 121.1 Mb) and lotus (Lotus japonicus, 45.4 Mb) have been studied relative to the distributions in cereals ...

2016
Hui Li Defang Li Anguo Chen Huijuan Tang Jianjun Li Siqi Huang

Kenaf (Hibiscus cannabinus L.) is an economically important natural fiber crop grown worldwide. However, only 20 expressed tag sequences (ESTs) for kenaf are available in public databases. The aim of this study was to develop large-scale simple sequence repeat (SSR) markers to lay a solid foundation for the construction of genetic linkage maps and marker-assisted breeding in kenaf. We used Illu...

پایان نامه :وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری - دانشکده علوم کشاورزی 1390

ارزیابی ژنتیکی ژن اعاده کننده باروری برای نر عقیمی نوع waدر برنج با استفاده از لاین نر عقیم سیتوپلاسمی ir58025a در ترکیب با آمل- 2 مورد مطالعه قرار گرفت. در این مطالعه تعداد 270 بوته از جمعیت f2 حاصل از تلاقی (آمل- 2 ×a25ir580) به طور تصادفی انتخاب و درصد باروری یا عقیمی این گیاهان مورد مطالعه قرار گرفت. نسبت باروری دانه گرده در گیاهان نسل f2 به صورت 143 گیاه بارور، 61 گیاه نیمه بارور، 55 گیاه ...

ژورنال: :پژوهش های زعفران 0
مهدی بیات دانش آموخته دکتری زراعت، گرایش اکولوژی گیاهان زراعی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه رضا امیرنیا دانشیار دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه مهدی تاجبخش 3- استاد دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه بهاتین تانیولاچ استاد دانشکده بیومهندسی، دانشگاه اگه، ازمیر، ترکیه.

به منظور مطالعه تنوع ژنتیکی زعفران، شش اکوتیپ زراعی از نقاط مختلف استان خراسان رضوی (مشهد، تربت­جام، گناباد و تربت­حیدریه) و استان خراسان جنوبی (قاین و بیرجند) تهیه و با استفاده از نشانگرهای مولکولی ipbs و ssr مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج تجزیه­های مولکولی نشان داد که 28 نشانگر ipbs و 22 نشانگر ssr به ترتیب 179 و 44 آلل چندشکلی را شناسایی نمودند و تعداد باندهای تکثیر یافته برای هر نشانگر به ...

پایان نامه :وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه یاسوج - دانشکده کشاورزی 1393

تنش شوری پس از تنش خشکی، دومین عامل محدود کننده عملکرد گیاهان زراعی در سطح جهانی است. سورگوم بر اساس تقسیمبندی گیاهان از نظر تحمل به تنش شوری، در کلاس نیمه متحمل قرار می گیرد. در مرحله رویشی و مراحل اولیه زایشی، بسیارحساس بوده در حالی که در دوره گلدهی و مرحله پر شدن دانه به ترتیب کمترین حساسیت را به تنش شوری دارند. به منظور شناسایی ارقام متحمل به شوری در سورگوم (در مرحله گیاهچه ای) و یافتن نشان...

پایان نامه :وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری - پژوهشکده کشاورزی 1389

وجود رنگدانه های آنتوسیانین در برنج عامل اصلی تولید پایه ساقه ارغوانی رنگ محـسوب می شود. رنگ پایه ساقه در برنج رابطه مستقیم و قوی با تشکیل دانه های رنگی در برنج دارد که در زیر پوسته آنها به دلیل تراکم متفاوت رنگیزه های آنتوسیانین در لایه های مختلف پریکارپ، پوشش دانه و آلورون، رنگ-های سرخ، ارغوانی و سیاه مشاهده می شود. بمنظور درک درست از مسیر بیوسنتزی آنتوسیانین که اطلاعات مفیدی را در زمینه بیول...

ژورنال: :به نژادی نهال و بذر 0
مهربانو کاظمی الموتی m. kazemi alamuti payam-e-nour university, tehran, iran.دانشگاه پیام نور، تهران محمدعلی ابراهیمی m. a. ebrahimi مهرشاد زین العابدینی m. zeynalabedini محسن مردی m. mardi طه رودبار شجاعی t. roodbar shojaie مریم پژمان مهر m. pezhman mehr هاشم پورایراندوست

در این مطالعه تنوع ژنتیکی 238 ژنوتیپ انار ترش ایران موجود در کلکسیون انار یزد با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره بررسی شد. تجزیه خوشه بندی با روش های upgma و nj٬ با استفاده از نرم افزار mega4، و تجزیه ساختار با روش bayesian با استفاده از نرم افزار structure 2.2 و تجزیه به مختصات اصلی (pcoa) با نرم افزار ntsys، به منظور بررسی روابط ژنتیکی و ساختار جمعیت ژنوتیپ ها انجام شد. آغازگرهای ssr-mp26 و s...

نمودار تعداد نتایج جستجو در هر سال

با کلیک روی نمودار نتایج را به سال انتشار فیلتر کنید