نتایج جستجو برای: ژن 16s rrna
تعداد نتایج: 50970 فیلتر نتایج به سال:
The RDP Classifier is a widely used bioinformatic program that performs taxonomic classification of 16S rRNA gene sequences. However, the accuracy of the program is not clear when it is applied to common PCR products of the 16S rRNA variable regions, which are heavily used in microbiome projects. In this study, fulllength 16S rRNA gene alignments from the SILVA database were used to simulate th...
16S ribosomal RNA currently represents the most important target of study in bacterial ecology. Its use for the description of bacterial diversity is, however, limited by the presence of variable copy numbers in bacterial genomes and sequence variation within closely related taxa or within a genome. Here we use the information from sequenced bacterial genomes to explore the variability of 16S r...
یکی از مهمترین زئوپلانکتون هایی که در نواحی مصبی و دریایی مورد تغذیه آبزیان قرار می گیرد سخت پوست پارامایسیس اینترمدیا paramysis intermedia است. با توجه به وجود ذخایر این زئوپلانکتون در خلیج فارس و دریای عمان، آگاهی از ساختار ژنتیکی و جمعیتی آن به منظور حفظ تنوع زیستی و خزانه ژنی حائز اهمیت می باشد. در پژوهش حاضر ساختار ژنتیکی و جمعیتی سخت پوست پارامایسیس اینترمدیا در دو منطقه تیاب در حوزه خلیج...
150 نمونه خون از گاوها در منطقه ای از اصفهان تهیه شد.dna استخراجی از نمونه های خونی توسط آغازگر اختصاصی a. centrale سویه آموری که بر اساس ژن 16s rrna طراحی شده بود با روش nested-pcr مورد بررسی قرار گرفت. گسترش های خونی از نظر a. centrale منفی بودند. نتایج نشان می دهند که از 150 نمونه مورد آزمایش با پرایمر اختصاصی a. centrale سویه آموری 2 نمونه (33/1درصد) مثبت بودند. این گزارش اولین تشخیص ملکو...
Even though the 16S rRNA gene is the most commonly used taxonomic marker in microbial ecology, its poor resolution is still not fully understood at the intra-genus level. In this work, the number of rRNA gene operons, intra-genomic heterogeneities and lateral transfers were investigated at a fine-scale resolution, throughout the Pseudomonas genus. In addition to nineteen sequenced Pseudomonas s...
We conducted a comparative evaluation of 12S rRNA and 16S rRNA genes of the mitochondrial genome for molecular differentiation among three oryx species (Oryx leucoryx, Oryx dammah and Oryx gazella) with respect to two closely related outgroups, addax and roan. Our findings showed the failure of 12S rRNA gene to differentiate between the genus Oryx and addax, whereas a 342-bp partial sequence of...
Deep-subsurface samples obtained by deep drilling are likely to be contaminated with mesophilic microorganisms in the drilling fluid, and this could affect determination of the community structure of the geothermal microflora using 16S rRNA gene clone library analysis. To eliminate possible contamination by PCR-amplified 16S rRNA genes from mesophiles, a combined thermal denaturation and enzyme...
The availability of a large number of completely sequenced bacterial genomes allows the rapid and reliable determination of intragenomic sequence heterogeneity of 16S rRNA genes. In the present study we assessed the intragenomic sequence heterogeneity of 16S rRNA genes in 55 bacterial genomes, representing various phylogenetic groups. The total number of rRNA operons in genomes included ranged ...
BACKGROUND The intra- and inter-species genetic diversity of bacteria and the absence of 'reference', or the most representative, sequences of individual species present a significant challenge for sequence-based identification. The aims of this study were to determine the utility, and compare the performance of several clustering and classification algorithms to identify the species of 364 seq...
سابقه و هدف: هلیکوباکتر هپاتیکوس یکی از شایعترین گونههای هلیکوباکتر میباشد. این باکتری یکی از عوامل مهم ایجاد بیماریهای گوناگون گوارشی، صفراوی و کبدی میباشد. موش متداولترین میزبان این باکتری است و نقش مهمی در انتقال بیماریهای مشترک انسان و حیوان دارد. هدف از این پژوهش تعیین میزان شیوع هلیکوباکتر هپاتیکوس در موشهای خانگی سطح استان اصفهان با روش PCR می...
نمودار تعداد نتایج جستجو در هر سال
با کلیک روی نمودار نتایج را به سال انتشار فیلتر کنید