نتایج جستجو برای: نشانگر مولکولی rnaseq

تعداد نتایج: 21587  

Journal: :Bioinformatics 2013
Pan Tong Yong Chen Xiao Su Kevin R. Coombes

MOTIVATION Identification of bimodally expressed genes is an important task, as genes with bimodal expression play important roles in cell differentiation, signalling and disease progression. Several useful algorithms have been developed to identify bimodal genes from microarray data. Currently, no method can deal with data from next-generation sequencing, which is emerging as a replacement tec...

2016
Hongyang Wang Rui Li Xiang Zhou Liyao Xue Xuewen Xu Bang Liu

Polyadenylation, a critical step in the production of mature mRNA for translation in most eukaryotes, involves cleavage and poly(A) tail addition at the 3' end of mRNAs at the polyadenylation site (PAS). Sometimes, one gene can have more than one PAS, which can produce the alternative polyadenylation (APA) phenomenon and affect the stability, localization and translation of the mRNA. In this st...

2016
Brian K. Lohman Jesse N. Weber Daniel I. Bolnick

11 RNAseq is a relatively new tool for ecological genetics that offers researchers insight into changes 12 in gene expression in response to a myriad of natural or experimental conditions. However, standard 13 RNAseq methods (e.g., Illumina TruSeq or NEBNext) can be cost prohibitive, especially when 14 study designs require large sample sizes. Consequently, RNAseq is often underused as a method...

بهزاد صادق زاده خشنود علیزاده دیزج, صادق شهبازی دورباش وحید فتحی رضایی,

وجود تنوع ژنتیکی از ضروریات اجرای برنامه‌‌های اصلاحی بوده و تعیین میزان این تنوع لازمه استفاده بهینه از منابع ژنتیکی می‌باشد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی گلرنگ، 20 لاین (14 لاین ایرانی و 6 لاین خارجی) با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD و نیز صفات زراعی در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی در سه تکرار در سال زراعی 87-86 مورد بررسی قرار گرفت. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که لاین ها در همه صفات زراعی به جز ت...

تنش شوری نه تنها از طریق کاهش حاصلخیزی، بلکه از طریق تجمع و سمیت ناشی از یونهای سدیم و کلر اثر منفی روی رشد و نمو و عملکرد گیاه دارد. با استفاده از شاخص­های تحمل می توان ارقام با عملکرد بالا در شرایط نرمال و تنش شوری را شناسایی نمود. در تحقیق حاضر، به منظور شناسایی نشانگرهای مولکولی مرتبط با شاخص­های تحمل به شوری، 59 لاین خویش آمیخته نوترکیب آفتابگردان حاصل از تلاقی PAC2 × RHA266 به همراه والدی...

حسن زینالی رضا توکل افشاری سیروس عبدمیشانی علی اکبر شاه‌نجات بوشهری فرزاد جاویدفر

کیفیت روغن کلزا (Brassica napus L.) توسط نسبت ترکیب اسید‌های چرب تعیین می‌گردد. در این مطالعه نشانگرهای مولکولی DNA شامل RAPD، ISSR و SSR برای تهیه نقشه مولکولی در جمعیت هاپلوئید مضاعف کلزا با 119 لاین مورد استفاده قرار گرفتند. تعداد 151 نشانگر در 21 گروه پیوستگی قرار گرفته و طول 1173 سانتی مورگان را پوشش دادند. تجزیه QTL براساس مکان‌یابی فاصله‌ای مرکب برای پنج اسید‌چرب اسید‌پالمیتیک، اسید‌استئ...

کلکسیون هسته مجموعه‌ای از نمونه‌های گزینش شده است که معرف تنوع ژنتیکی موجود در کلکسیون پایه می باشد. این استراتژی به منظور به حداقل رساندن هزینه حفاظت از ذخائر ژنتیکی با حفظ حداکثری تنوع ژنتیکی معرفی شده است. در این روش امکان ارزیابی سریع ژرم پلاسم و دسترسی آسانتر به کلکسیون پایه فراهم می شود. در این تحقیق، به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی و تشکیل کلکسیون هسته، 139 نمونه Prunus dulcisMill. با منشأ ...

ژورنال: علوم زراعی ایران 2005
صادق زاده اهری, داود, قره یاضی, بهزاد, محمدی, سیدابوالقاسم, مردی, محسن, پورایراندوست, هاشم, پیرسیدی, سیدمصطفی,

دراین تحقیق تنوع ژنتیکی 35 لاین مشتق شده از گندم سرداری با استفاده از 60 نشانگر ریز ماهواره بررسی شد. نتایج تجزیه‌های مولکولی نشان داد که تعداد الل‌های مشاهده شده در هر جایگاه نشانگری از 2 تا 6 و محتوای اطلاعات چندشکلی از 11/0 تا 83/0 متغیر بود. نتایج تجزیه‌های خوشه‌ای و تابع تشخیص، لاین‌های مورد مطالعه را به 5 گروه با فاصله‌های ژنتیکی متفاوت تقسیم کرد. نتایج این تحقیق وجود تنوع ژنتیکی در لاین‌...

ثمانه حسینی سید مصطفی پیرسیدی سیروس عبدمیشانی علی اکبر شاه نجات بوشهری لاله کریمی فرساد محسن مردی محمدرضا غفاری یوسف نامی

جهت ایجاد نشانگرهای مولکولی مبتنی بر EST پیوسته با ژن‌های کنترل کننده مقاومت به FHB در گندم، عملکرد بیولوژیک 8660، EST‌ موجود در بانک های اطلاعات مطالعه شد و 260، EST با عملکرد مشخص انتخاب شدند. در مجموع 62 جفت آغازگر با استفاده از نقاط حفظ شده و غیر حفظ شده طراحی شد. نتایج تجزیه پیوستگی و QTL با استفاده از داده‌های ژنوتیپی و فنوتیپی در نسل‌های 3F و 5F حاصل از تلاقی های فرونتانا (نیمه مقاوم) / ...

ژورنال: جنگل ایران 2015

در این تحقیق، تنوع ژنتیکی درون و بین‌جمعیتی 125 ژنوتیپ از نه جمعیت برودار (Quercus brantii) در جنگل‌های زاگرس شمالی با استفاده از نشانگرهای ریخت‌شناختی برگ، توالی‌های تکراری سادة میانی (ISSR) و چندشکلی تکثیرشده بین رتروترانسپوزون‌ها (IRAP) بررسی شده است. براساس تجزیة خوشه‌ای مبتنی بر داده‌های ریختاری، جمعیت‌های مورد بررسی به‌طور معنی‌داری از هم متمایز شدند و در شش خوشة اصلی قرار گرفتند...

نمودار تعداد نتایج جستجو در هر سال

با کلیک روی نمودار نتایج را به سال انتشار فیلتر کنید