نتایج جستجو برای: مدل پتانسیلی tip3p

تعداد نتایج: 120338  

2017
Christopher M. Siwy Christopher Lockhart Dmitri K. Klimov

By applying REMD simulations we have performed comparative analysis of the conformational ensembles of amino-truncated Aβ10-40 peptide produced with five force fields, which combine four protein parameterizations (CHARMM36, CHARMM22*, CHARMM22/cmap, and OPLS-AA) and two water models (standard and modified TIP3P). Aβ10-40 conformations were analyzed by computing secondary structure, backbone flu...

ژورنال: :فیزیک زمین و فضا 2004
علیرضا محب الحجه رباب مشایخی

برای بررسی کمی و کیفی جواب های الگوریتم های حل عددی معادلات بسیط فشارورد، مقایسه با رفتار جو واقعی نمی تواند ملاک اصلی یا حداقل تنهـا ملاک در تعیبن دقت الگوریتم ها قرار گیرد. این حکم به ویژه در کاربست به صنطقه محدود که شرایط مرزی بر پیچبدگی تعبین جواب مطلوب می افزایند صادق است. این پیچیدگی حاصل درآمیختگی خطای مدل بسیط فشارورد. خطای خود الگوریتم، خطای وارد در چگونگی خوراند داده ها است. بر این ...

Journal: :The Journal of chemical physics 2014
Robert B Best Cayla Miller Jeetain Mittal

In contrast to the well-known destabilization of globular proteins by high pressure, recent work has shown that pressure stabilizes the formation of isolated α-helices. However, all simulations to date have obtained a qualitatively opposite result within the experimental pressure range. We show that using a protein force field (Amber03w) parametrized in conjunction with an accurate water model ...

Journal: :Protein science : a publication of the Protein Society 2016
Duy P Hua He Huang Amitava Roy Carol Beth Post

Three implicit solvent models, namely GBMVII, FACTS, and SCPISM, were evaluated for their abilities to emulate an explicit solvent environment by comparing the simulated conformational ensembles, dynamics, and electrostatic interactions of the Src SH2 domain and the Lyn kinase domain. This assessment in terms of structural features in folded proteins expands upon the use of hydration energy as ...

ژورنال: فیزیک زمین و فضا 2013
علیرضا محب‌الحجه محمد جغتایی

توسعه هسته دینامیکی هیدروستاتیک برای مدل گردش کلی جوّ بر مبنای تاوایی پتانسیلی با الگوریتم فرابرد پربندی نیمه‌لاگرانژی دررو مورد بررسی قرار می­گیرد. خطی‌سازی معادلات بسیط با مختصه قائم تعمیم‌یافته حول حالت پایه ساکن امکان استخراج مُدهای قائم و استفاده از آنها برای طراحی و پیاده‌سازی طرحواره گام‌برداری زمانی نیمه‌ضمنی را فراهم ‌می‌کند. استفاده از متغیرهای پیش‌یابی تاوایی پتانسیلی، واگرایی سرعت و ت...

ژورنال: :علوم باغبانی ایران 2012
علیرضا فرامرزپور مجتبی دلشاد مسعود پارسی نژاد

عملکرد بالا و همچنین کیفیت مناسب از پیش شرط های لازم جهت دست یافتن به تولید سود آور خیار گلخانه ای می باشد. از طرف دیگر با توجه به بحران کمبود آب در جهان و بالاخص در ایران لازم است که در مصرف این سرمایه بزرگ صرفه جویی بعمل آید. به منظور بهینه سازی مصرف آب در کشت خاکی خیار گلخانه ای و تحت شرایط سیستم آبیاری قطره ای، با استفاده از تانسیومتر، آزمایشی در یکی از گلخانه های سبزیکاری پردیس کشاورزی و م...

ژورنال: فیزیک زمین و فضا 2017

در مقاله حاضر، تغییرات مکانی ارتفاع لایه آمیخته جوّی شهر تهران در دو مطالعه موردی در فصل تابستان و زمستان با استفاده از مدل پیش‌بینی عددی WRF بررسی شده‌است. تغییرات محلی نیمرخ قائم دمای پتانسیلی و نسبت آمیختگی بخار آب در پنج نقطه مختلف از حوزه چهارم مدل که شامل نقاط شهری و ارتفاعات شمالی تهران هستند، همچنین تأثیر عوامل سطحی نظیر ارتفاع زمین، دما و رطوبت نسبی دومتری و شار گرمایی سطحی بر ارتفاع لا...

ژورنال: :نشریه جغرافیا و برنامه ریزی 2013
داریوش رحیمی سیدحجت موسوی

روند روبه رشد شهرستان شاهرود در سال­های اخیر، راهبرد مدیریت منابع آب در این منطقه را بیش از پیش ایجاب می­کند. یکی از راهکارهای مدیریتی منابع آب، شناسایی مناطق آبی با پتانسیل های مختلف و بهره برداری از آنها با توجه با ظرفیت­شان می باشد. هدف از این پژوهش پهنه بندی مناطق پتانسیل آبی در حوضه آبخیز شاهرود- بسطام با استفاده از عوامل موثر در تغذیه سفره های آب زیرزمینی، از طریق مدل ahp و تکنیک gis است....

ژورنال: فیزیک زمین و فضا 2002
فرهنگ احمدی گیوی

مطالعات نظری و موردی بی شماری در طی چند دهه اخیر برای بررسی اثرات فرایند های فیزیکی در دینامیک چرخندهای عرض های میانی و تقویت آنها انجام شده است بنابر نتایج این مطالعات عوامل متعددی از قبیل آزاد شده گرمای نهان شارش های سطحی گرما و اثرات پستی و بلندی می تواند در ساختار و تشدید چرخش های یک سیستم چرخندی موثر باشد .همچنین نتایج حاکی از آن است که آزاد شده گرمای نهان مهم ترین فرایند(دررو) در میان فرا...

ژورنال: :فیزیک زمین و فضا 2002
فرهنگ احمدی گیوی

مطالعات نظری و موردی بی شماری در طی چند دهه اخیر برای بررسی اثرات فرایند های فیزیکی در دینامیک چرخندهای عرض های میانی و تقویت آنها انجام شده است بنابر نتایج این مطالعات عوامل متعددی از قبیل آزاد شده گرمای نهان شارش های سطحی گرما و اثرات پستی و بلندی می تواند در ساختار و تشدید چرخش های یک سیستم چرخندی موثر باشد .همچنین نتایج حاکی از آن است که آزاد شده گرمای نهان مهم ترین فرایند(دررو) در میان فرا...

نمودار تعداد نتایج جستجو در هر سال

با کلیک روی نمودار نتایج را به سال انتشار فیلتر کنید