چکیده زمینه و هدف: امروزه افزایش سویه های مقاوم به آنتی بیوتیک و ناکارآمد بودن واکسن های موجود برای پیشگیری از عفونت های پنوموکوکی ضرورت بررسی آنتی ژن های جدید پروتئینی را مشخص می کند. به نظر می رسد اتولیزین ماینور استرپتوکوکوس پنومونیه دارای خواص آنتی ژنیک می باشد. در این مطالعه برای اولین بار ژن آن کلون گردید. روش بررسی: پس از استخراج ژنوم سویه استاندارد استرپتوکوکوس پنومونیه (atcc 49619) آغا...

در پژوهش­های پیشین از بخش خالص شده پروتئوم باکتری xanthomonas campestris pv. campestris (xcc) که قابلیت محرک تولید اتیلن در گیاه آرابیدوپسیس را داشت، حدود 60 پروتئین مختلف شناسایی شدند که از بین آنها هشت پروتئین به عنوان پروتئین فرضی محافظت شده بودند. هدف از انجام این پژوهش توصیف این پروتئین­ها توسط ابزارهای بیوانفورماتیک مختلف می­باشد. همه پروتئین­های مورد بررسی دارای جرم مولکولی متوسطی بودند....

شیوع سیاه زخم طبیعی در انسان نادر است اما از آنجایی که این باکتری پتانسیل بالایی جهت استفاده به عنوان سلاح بیولوژیکی دارد تلاش ها برای تولید واکسن علیه این باکتری رو به افزایش است. ترکیب آنتی ژن ها با زیرواحد b کلرا توکسین ctb می تواند پاسخ آنتی بادی موکوزی قوی ایجاد نماید و به عنوان واکسن معرفی شود. در این مطالعه، ابتدا توالی های مربوطه از پایگاه داده ncbi اخذ و پس از بهینه سازی، از لینکری منا...

سیستم ایمنی انسان شامل انواع متنوعی از سلول¬ها و مولکول¬ها می¬باشد که در ارتباط تنگاتنگ با سایر سیستم¬های بدن می¬باشند. مقادیر افزاینده¬ی داده¬های تولید شده در دوره¬ی پساژنومیک بررسی این سیستم را پیچیده¬تر گردانده است. بنابراین نیاز به استفاده از رویکردهای محاسباتی و کامپیوتری جهت پردازش و تفسیر داده¬ها محسوس¬تر می¬باشد. ایمونوانفورماتیک به عنوان زیرمجموعه¬ای از بیوانفورماتیک رویکردی جدید با اب...

پوتی ویروس های موزائیک جنوبی مرغ  (bermuda grass southern mosaic virus, bgsmv) و موزائیک کوتولگی ذرت (maize dwarf mosaic virus, mdmv)  با وجود  شباهت هایی، به لحاظ پراکنش جغرافیایی و وجود قطعه 90 نوکلئوتیدی اضافی در ناحیه 5' ژن پروتئین پوششی bgsmv  با هم اختلاف دارند. در این پژوهش تاثیر تغییر دما بر روی شدت بیماری ناشی از  bgsmv  و mdmv مورد بررسی قرار گرفت و قطعه 90 نوکلئوتیدی در  ژن پروت...

زمینه و هدف: تیروزیناز یک آنزیم کلیدی در تولید رنگ دانه است. اختلالات مربوط به افزایش رنگ دانه در نتیجه تولید بیش ازحد ملانین در پوست ایجاد می شود؛ بنابراین گسترش مهارکننده های این آنزیم در زمینه های پزشکی، آرایشی و کشاورزی حائز اهمیت است. هدف این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی مهار آنزیم تیروزیناز به وسیله ی تعدادی از مشتقات هیدروکسی نیترو دی فنیل اتر است. مواد و روش ها: این پژوهش به روش توصیفی –ت...

پروتئین های آرگونات از جمله پروتئین های دخیل در بحث خاموشی ژن می باشند که فعالیت اندونکلئولیتیکی برای بسیاری از آنها به اثبات رسیده است. هدف از این تحقیق شناسایی و بررسی پروتئین های آرگونات موجود در ژنوم 6 گیاه دارویی با استفاده از ابزارها و روش های بیوانفورماتیکی می باشد. توالی های اسید آمینه ی پروتئین های آرگونات گیاهان مورد بررسی با استفاده از توالی های پروتئین های آرگونات آرابیدوپسیس، از پا...

شوری خاک یکی از عوامل مهم محیطی است که منجر به کاهش عملکرد گیاهان زراعی می شود. شناخت مکانیسم های مقاومت گیاهان در برابر تنش ها می تواند به شناسایی ژن های مقاومت و کاربرد آن ها در اصلاح گیاهان و افزایش محدوده کشت گیاهان منجر شود. روش آنالیز expressed sequence tag (est) و داده های ریزآرایه راهی سریع و منطقی برای شناسایی ژن های نامزد جدید برای مقاومت به تنش ها می باشد. در این تحقیق تعداد 2 کتابخا...