نتایج جستجو برای: n50

تعداد نتایج: 630  

2016
Lingling Shi Yunfei Guo Chengliang Dong John Huddleston Hui Yang Xiaolu Han Aisi Fu Quan Li Na Li Siyi Gong Katherine E Lintner Qiong Ding Zou Wang Jiang Hu Depeng Wang Feng Wang Lin Wang Gholson J Lyon Yongtao Guan Yufeng Shen Oleg V Evgrafov James A Knowles Francoise Thibaud-Nissen Valerie Schneider Chack-Yung Yu Libing Zhou Evan E Eichler Kwok-Fai So Kai Wang

Short-read sequencing has enabled the de novo assembly of several individual human genomes, but with inherent limitations in characterizing repeat elements. Here we sequence a Chinese individual HX1 by single-molecule real-time (SMRT) long-read sequencing, construct a physical map by NanoChannel arrays and generate a de novo assembly of 2.93 Gb (contig N50: 8.3 Mb, scaffold N50: 22.0 Mb, includ...

2017
Benjamin J Perry Stephen F Fitzgerald Carsten Kröger Andrew D S Cameron

The genome of Salmonella enterica subspecies enterica serovar Enteritidis phage type 8 strain EN1660, isolated from an outbreak in Thunder Bay, Canada, was sequenced to 46-fold coverage using an Illumina MiSeq with 300-bp paired-end sequencing chemistry to produce 28 contigs with an N50 value of 490,721 bp.

2017
Shaoxing Chen Chuanming Wang He Li Yunmei Shen

Here is the genome sequence of Haloparvum sedimenti DYS4, the type species of the genus Haloparvum, isolated from a salt mine. The DNA G+C content of this genome was 68.27 mol%. The scaffold N50 was 96,635 bp. The completely sequenced and annotated genome is 3,243,052 bp and contains 3,313 genes.

2015
M. B. Couger Radwa A. Hanafy Curtis Edens Connie Budd Donald P. French Wouter D. Hoff Mostafa S. Elshahed Noha H. Youssef

We report the draft genome sequence of Arthrobacter sp. strain Edens01, isolated from a leaf surface of a Rosa hybrid plant as part of the Howard Hughes Medical Institute-funded Student Initiated Microbial Discovery (SIMD) project. The genome has a total size of 3,639,179 bp and contig N50 of 454,897 bp.

2017
R. Cossío-Bayúgar E. Miranda-Miranda C. A. Arreguín-Pérez L. Lozano D. Peréz de la Rosa M. K. Rocha-Martínez M. A. Bravo-Díaz B. Sachman-Ruiz

Enterococcus spp. are Gram-positive lactic acid-producing bacteria found in the intestinal tracts of animals, like mammals, birds, and arthropods. Enterococcus spp. may cause oportunistic infections in vertebrate and invertebrate hosts. We report here the draft genome sequence of Enterococcus casseliflavus PAVET15 containing 3,722,480 bp, with 80 contigs, an N50 of 179,476 bp, and 41.93% G+C co...

ژورنال: :تحقیقات اقتصاد و توسعه کشاورزی ایران 2015
میلاد امینی زاده حامد رفیعی اندیشه ریاحی راضیه شنگایی الهام مهرپرور حسینی

کشمش یکی از مهم ترین محصولات ارزآور کشاورزی ایران است و ایران پس از کشورهای ترکیه و آمریکا سومین صادرکنندۀ کشمش جهان است. در این مقاله، با استفاده از شاخص های مزیت نسبی صادراتی، مزیت وارداتی، نسبت­های تمرکز و هرفیندال- هیرشمن، به بررسی وضعیت تجاری و ساختار بازار صادراتی و وارداتی محصول کشمش در جهان در دورۀ زمانی 2011-2001 پرداخته می شود. براساس نتایج، ساختار بازار صادراتی در این دوره انحصار چند...

Journal: :Acta Biológica Colombiana 2021

Sin importar el tipo de tecnología aplicada para la secuenciación un genoma, filtrado secuencias es paso esencial, en cual aquellas lecturas baja calidad o parte estas son eliminadas. En ensamblado construcción genoma se realiza a partir unión cortas cóntigos. Algunos ensambladores miden relación que existe entre una longitud fija (k-mer) puede verse afectada por presencia calidad. Un enfoque c...

پایان نامه :سایر - دانشکده علوم 1390

در این مطالعه سهم دانسیته ی الکترونی اوربیتال های پی و آلفا به صورت مجزا، در نانو صفحات مسطح بور نیتریدی در حضور استخلاف های مزدوج شونده با صفحه، cn,cch,n3, ocn,nco, cno و ncs توسط برنامه ی aim 2000 با شویه ای جدید محاسبه شده است. استخلاف ها در دو موقعیت، n50 و b5 به bn sheet متصل شده اند. بهینه سازی، تست فرکانس، محاسبه ی توابع موج و تحلیل nbo کلیه ی ساختارها توسط برنامه ی gaussian 03w در سطح ت...

2018
Elodie Belmas Martial Briand Anthony Kwasiborski Justine Colou Guillaume N'Guyen Béatrice Iacomi Philippe Grappin Claire Campion Philippe Simoneau Matthieu Barret Thomas Guillemette

Alternaria brassicicola causes dark spot (or black spot) disease, which is one of the most common and destructive fungal diseases of Brassicaceae spp. worldwide. Here, we report the draft genome sequence of strain Abra43. The assembly comprises 29 scaffolds, with an N50 value of 2.1 Mb. The assembled genome was 31,036,461 bp in length, with a G+C content of 50.85%.

2013
Barbara Blanco-Ulate Philippe Rolshausen Dario Cantu

Grapevine infections by Phaeoacremonium aleophilum in association with other pathogenic fungi cause complex and economically important vascular diseases. Here we present the first draft of the P. aleophilum genome sequence, which comprises 624 scaffolds with a total length of 47.5 Mb (L50, 45; N50, 336 kb) and 8,926 predicted protein-coding genes.

نمودار تعداد نتایج جستجو در هر سال

با کلیک روی نمودار نتایج را به سال انتشار فیلتر کنید