ورم پستان یکی از بیماری‌های عفونی غدد پستانی در گاوهای شیری است که در چند دهه‌ اخیر، به عنوان یکی از مهم‌ترین بیماری‌هایی که منجر به ضرر اقتصادی در صنعت گاو شیری می‌شود، مورد توجه زیادی قرار گرفته است. وراثت‌پذیری ورم‌ پستان پایین است و لذا مدیریت اصلاح نژادی آن کار سختی به شمار می‌رود. با توجه به اهمیت بیماری ورم پستان در مدیریت واحد‌های پرورش گاو شیری و ساز و کار مولکولی پیچیده درگیر در این ب...

یکی از عمده‌ترین مشکلات در تولید و گسترش سطح کشت یونجه در جهان و از جمله ایران، شوری است. در گیاهان شناخت کامل مکانیسم‌های تحمل و ژن‌های درگیر در شرایط تنش می‌تواند باعث بهبود تحمل تنش‌های مختلف در گیاهان زراعی با استفاده از روش‌هایی چون دستکاری ژنتیکی شود. یکی از مهم‌ترین روش‌های کنترل تنش در گیاهان، تنظیم در مرحله رونویسی ژن‌هاست. عوامل رونویسی از طریق اتصال به عناصر رونویسی در پروموتور DNA م...

هدف: شناسایی ژن هایی که در کشت های اولیه سلول های شبکه ترابکولار (tm) بیانشان تحت تأثیر فاکتورهای رونویسی pitx2 و foxc1 قرار می گیرد. همچنین شناسایی ژن هایی که در بیماری گلوکوم نقش دارند. ژن های عامل بیماری گلوکوم که تاکنون شناخته شده اند تنها در کسر کوچکی از بیماران عامل بیماری می باشند. هدف ما در این مطالعه شناسایی ژن های دیگری است که ممکن است به علت نقش های ظریف، به راحتی توسط روشهای ژنتیکی ...

در این پایان نامه یک سیستم عصبی- فازی سلسله مراتبی- مکملی برای کلاسه بندی داده های بسیاربعدی بیان ژن معرفی می شود. در سال های اخیر تکنولوژی ریزآرایه، امکان مانیتورینگ بیان هزاران ژن را بطور همزمان فراهم کرده است. داده های سطوح بیان ژن اطلاعات ارزشمندی در مورد شبکه های بیولوژیک، حالات سلولی و فهم چگونگی رفتار ژن ها دربردارد. یک هدف از تحلیل داده های بیان ژن تعیین چگونگی تأثیر بیان هر ژن منفرد رو...

سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده های ژنی که بین فنوتیپ های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن های منفرد، تحلیل خانواده های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ ها به کار می گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده های ژنی پرداخته می شود. مواد و روش ها: از دو روش ط...

ظهور ترکیبات دارویی نوین همگام با مطالعه سازوکار و جایگاه عمل آنها در راستای تیمار و پیشگیری از بیماری ها، نقش ارزنده ای در علم پزشکی طی سالیان متمادی برعهده داشته است. بااین حال روش های متداول جهت کشف و شناسایی ترکیبات دارویی جدید موفقیت چندانی در پی نداشته اند. لذا جایگزین نمودن فنآوری های نوین با روش های مرسوم که عموما پر هزینه و کم بازده بوده و منجر به واکنش های دارویی پر خطر در بیماران می ...

انتخاب ویژگی یکی از فرایندهای پیش پردازش داده‌ها در مباحث مربوط به یادگیری ماشین و داده‌کاوی محسوب می‌شود که در برخی زمینه‌ها نظیر کار با داده‌های ریزآرایه در بیوانفورماتیک که با مشکل ابعاد بالای داده‌ها در مقابل تعداد کم نمونه‌ها مواجه است، از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. انتخاب ویژگی‌های (ژن‌های) موثر در تشخیص بیماری از داده‌های ریزآرایه نقش مهمی در تشخیص زودهنگام بیماری و راه‌های مواجهه با آن...

یکی از عمده‌ترین مشکلات در تولید و گسترش سطح کشت یونجه در جهان و از جمله ایران، شوری است. در گیاهان شناخت کامل مکانیسم‌های تحمل و ژن‌های درگیر در شرایط تنش می‌تواند باعث بهبود تحمل تنش‌های مختلف در گیاهان زراعی با استفاده از روش‌هایی چون دستکاری ژنتیکی شود. یکی از مهم‌ترین روش‌های کنترل تنش در گیاهان، تنظیم در مرحله رونویسی ژن‌هاست. عوامل رونویسی از طریق اتصال به عناصر رونویسی در پروموتور DNA م...

در گذشته مطالعات متعددی برای پیدا کردن mrna های با بیان متفاوت بین نمونه های نرمال و سرطانی صورت گرفته بود اما تحقیقات گسترده در سالهای اخیر نقش mirna ها را در رشد، مرگ برنامه ریزی شده، تمایز و تکثیر سلولی مشخص کرده و عملکرد مستقیم mirna در سرطان را نیز تأیید می نماید. ساختار mirna ها و نحوه عملکرد آنها نشان می دهد که بسیاری از mirna ها در نمونه های سرطانی به صورت غیرطبیعی بیان می شوند. بنابرای...

امروزه فناوری ریزآرایه، برای تولید حجم عظیمی از داده های بیان ژن به کار می رود. این داده ها باید به صورت آماری پردازش و تحلیل شوند؛ به ویژه برای تشخیص آن ژن هایی که در تشخیص و پیش بینی یک بیماری خاص مفیدند. در این پروژه امکان به کارگیری ابزارهای نظریه بازی، مانند ارزش شیپلی و بانژاف را برای تجزیه و تحلیل داده های بیان ژن موردبررسی قرار می دهیم‎.‎ به وسیله یک روش تفکیک کننده، یک بازی همکارانه م...