پیشرفت فناوری­های نوین و سرعت تحقیقات علم ژنتیک منجر به تولید حجم بالای اطلاعات ژنتیکی در زمینه های مختلف نظیر توالی نوکلئوتید ها و اسید های آمینه، عملکرد ژن ها و پروتئین ها، جهش یافته ها و فنوتیپ های آن ها، نشانگرها و استفاده از آن ها و موضوعات مرتبط شده است. علاوه بر حجم زیاد اطلاعات ژنتیکی، این اطلاعات پیچیده و دارای تفاوت های ظریف در روش های آزمایشی هستند که می توانند در کیفیت و تفسیر اطلاع...

سابقه و هدف: یکی از شاخه های مهم بیوانفورماتیک فناوری ریزآرایه dna است که امکان بررسی بیان هزاران ژن را به طور هم زمان در حداقل زمان ممکن می سازد که در سال های اخیر موجب تولید حجم انبوهی از داده های بیان ژنی شده است. تحلیل آماری این داده ها شامل نرمال سازی، خوشه بندی، طبقه بندی و ... از جمله روش های مورد استفاده در تحلیل این نوع داده ها است. مواد و روش ها: در این مقاله داده های بیان ژنی سرطان خ...

زمینه و هدف: بیماری قلبی - عروقی یکی از مهم‌ترین علل مرگ و میر در کشورهای پیشرفته و جهان سوم است. طبق اعلام سازمان بهداشت جهانی پیش‌بینی می‌شود مرگ و میر ناشی از بیماری‌های قلبی تا سال 2030 به 23 میلیون نفر افزایش می‌یابد. در جدیدترین آمار وزیر بهداشت ایران، ۳/۳۹% کل مرگ و میرها ناشی از بیماری‌های قلبی - عروقی و 5/19% مربوط به سکته‌های قلبی گزارش شده است. این پژوهش با هدف پیش‌بینی بیماری عروق ک...

سابقه و هدف: شاربن علامتی از جمله بیماری های حاد و موثر بر گاو و گوسفندان جوان است که علائم این بیماری ایجاد میوزیت و مسمومیت است که اغلب کشنده می باشد. عامل این بیماری باکتری کلستریدیوم شووای است که یک باکتری گرم مثبت، میله ای شکل و بی هوازی است و تولید گاز و اسپور می نماید. اسپور این باکتری مقاومت بالایی دارد و می تواند در خاک و غذا سال ها زنده بماند. ابعاد این باکتری 8-3×1-5/0 میکرون است و م...

انطباق های چندتایی برای پیش بینی ساختارهای پروتئینی، پیش بینی عملکرد پروتئین ها و بررسی تکامل ژنتیکی ضروری هستند.پیدا کردن انطباق بین دنباله ها با بالاترین دقت به طوری که دنباله ها بیشترین شباهت را به هم داشته باشند، مسئله اصلی در این تحقیق است.در این پایان نامه طبقه بندی دنباله ها با توجه به ویژگی های آن ها و با توجه به این نکته که انواع مشابه ویژگی های بیولوژیکی باید با هم همتراز شوند در حالی...

همردیفی توالی ها روشی برای در اختیار گرفتن اطلاعات اساسی در بیوانفورماتیک است. با این حال، حل مساله ی همردیفی توالی های چندگانه دشوار است. در این پایان نامه ، بهینه سازی تجمع ذرات و الگوریتم ژنتیک برای حل این مساله استفاده شده است. درالگوریتم تجمع ذرات، هر ذره نشان دهنده ی یک همردیفی است و ذرات برای رسیدن به جواب با استفاده از برخی قوانین حرکت می کنند. همچنین در الگوریتم ژنتیک هر کروموزوم به عن...

در این پژوهش قصد داریم شیوه های مختلف و راهکارهای گوناگون ساخت گراف های رشته را مورد مطالعه و بررسی قرار دهیم. گراف های رشته در حقیقت خود یک شکل بهینه شده از گراف های همپوشان هستند. گراف های رشته و همپوشان توسط رشته هایی موسوم به خوانش موجود در ژنوم موجود زنده، توالی ژنوم را تعیین می کنند. در این زمینه به دلیل حجم داده ای بالا و لزوم ذخیره سازی سریع آنها، روش های متفاوتی با زمان های اجرای مختلف...

شیگلا دیسانتری یکی از عوامل اصلی بیماری اسهال در انسان است و هم چنین وبا (ویبریوکلرا) بیماری عفونی بسیار مهلکی می باشد که به صورت اپیدمی ها و پاندمی هایی بروز می کند. ساخت واکسن علیه این دو بیماری بسیار مفید به نظر می رسد. بهترین روش برای ساخت واکسن علیه این دو بیماری، استفاده از زیر واحدهای b‏ انتروتوکسین این دو باکتری می باشد که به نامهای stxb (برای شیگلادیسانتری) و ctxb (برای ویبریوکلرا) مشه...

ژن گیرنده پرولاکتین به دلیل نقش حیاتی در انتقال علائم هورمون لاکتوژن به پروموتر پروتئین شیر از مهمترین ژن های کاندیدای مؤثر در تولید شیر شناخته شده است. تحقیق حاضر با هدف توالی‌یابی اگزون 9 ژن گیرنده پرولاکتین در بز خلخالی و آنالیز بیوانفورماتیک این ژن در حیوانات اهلی انجام شده است. جهت آنالیزهای بیوانفورماتیک و مقایسه گونه‌ای، از توالی‌های ژنومی گونه‌های مختلف حیوانات اهلی استفاده شد جهش مشاهد...