زمینه و هدف: سرطان یکی از دلایل عمده مرگ و میر در دنیای امروز است و به عنوان یکی از مهم ‎‎ترین مشکلات سلامت جوامع محسوب می شو‎د. اکثر روش های پیشنهادی جهت دسته بندی سرطان ‎‎به کمک داده های بیان ژن مانند یک جعبه سیاه عمل کرده‏ و قابلیت تفسیرپذیری زیستی ندارند. این مطالعه با هدف معرفی روشی بهینه با قابلیت تفسیر داده های بیان ژن انجام شد. روش بررسی: در این مطالعه، روش ترکیبی پالایشی - پوششی برای ا...

مصرف سیگار عامل بیش از 90 درصد موارد سرطان ریه است و هنوز تغییرات دقیق مولکولی ای که به علت مصرف سیگار در ریه ایجاد و منجر به ایجاد سرطان می گردند، هنوز ناشناخته مانده اند. در این پژوهش، از داده های میکروآرایه استفاده شده است. داده های میکروآرایه معمولا حاوی حجم عظیمی از داده های ژن مزاحم و بی فایده می باشند. این مجموعه داده های مزاحم، حاوی اطلاعاتی نادرست و بی ربط هستند، به همین دلیل بسیار م...

در سال های اخیر تکنولوژی میکروآرایه dna به دانشمندان علوم زیستی برای فهم فرآیندهای سلولی کمک زیادی کرده است. دانشمندان علم ژنتیک با استفاده از الگوی تجلی ژن ها نحوه عملکرد سلول ها یا بافت ها را شناسایی کرده و مسیرهای جدید برای اکتشاف داروها و تشخیص های کلینیکی معرفی کرده است. اما از آن جهت که هر آزمایش فیزیکی با خطا روبه رو است و در هر آزمایش میکروآرایه سطح فعالیت هزاران ژن اندازه گیری می شود، ...

ظهور اخیر تکنیک میکرو آرایه dna قابلیت نشان دادن همزمان بیان هزاران ژن را ایجاد کرده است. آرایه های dna شامل شمار زیادی از ملکول های dna نقطه گذاری شده در یک ترتیب منظم روی یک زمینه جامد (غشا های نا یلونی , اسلاید های شیشه ای یا تراشه های سیلیکونی) می باشد. این ساختار پس از عبور از مراحل آماده¬سازی مختلف که شامل فرآیندهای شیمیائی و فیزیکی است، در آخرین مرحله توسط سیستمی متشکل از دو پرتو لیزر با...

تجزیه، تحلیل و طبقه بندی داده های میکروآرایه یکی از موضوعات چالش برانگیز در حیطه بیوانفورماتیک است. از مهم ترین ویژگی های داده های میکروآرایه، ابعاد بسیار بالا (تعداد ژن های زیاد) در برابر تعداد کم نمونه ها می باشد. این عامل، باعث بروز مشکلات و چالش هایی در زمینه تحلیل این نوع داده ها شده است. بنابراین از روش های انتخاب ویژگی و کاهش ابعاد داده ها جهت حل این مشکلات و ارائه مدلی ساده تر و دقیق ت...

تعاملات بین ژن ها، پروتیین ها و مواد دیگر در سلول، تشکیل یک شبکه ی پیچیده می دهند که نقش مهمی در عملکرد درست سلول بازی می-کند. مدلسازی شبکه های ژنی می تواند در زمینه های مختلف مانند شناسایی بیماری های ژنتیکی، انتخاب کاندیداهای ژن درمانی و به دست آوردن ایده هایی در مورد عملکرد ژن های ناشناخته کاربرد داشته باشد. روش آزمایشگاهی میکروآرایه های dna امکان اندازه گیری همزمان بیان هزاران ژن را فراهم می...