معنی داری آماری مقایسه یک دنباله پروتئین با یک ساختار سه بعدی

ساختار سه بعدی یک پروتئین واسطه ی بین توالی و عملکرد آن است. بنابراین مقایسه توالی یک پروتئین با یک ساختار سه بعدی شناخته شده، می تواند در پی بردن به عملکرد یک پروتئین، موثر واقع گردد. ‎‎‎بندکش‎ی‎ ابزاریست که می تواند رابطه نامحسوس بین پروتئین مورد تحقیق و پروتئینی که ساختار سه بعدی اش شناخته شده است را مشخص کند.اکثر روشهای تریدینگ دارای چهار مولفه اصلی می باشند: 1.یک مجموعه داده از پروتئین های الگو 2.یک تابع امتیاز که میزان برازش یک چینش خاص را اندازه گیری می کند 3.چینشی که بیشترین امتیاز را دارا می باشد (بیشترین امتیاز را امتیاز تریدینگ می نامیم.) 4.یک توزیع مناسب برای بیشترین امتیاز، برای محاسبه p-value هر امتیاز تریدینگ و سپس تصمیم گیری ‎‎ ‎از‎ آنجایی که امتیاز حاصل از بندکشی به تنهایی نمی تواند رابطه ی نا محسوس را ارزیابی کند‏، بنابراین احتیاج به بررسی معنی داری این امتیاز است‏، که در این پایان نامه به آن می پردازیم. در اینجا به صورت عددی نشان می دهیم که توزیع امتیاز های بندکشی از توزیع پارتوی تعمیم یافته پیروی می کند و این توزیع را بر امتیاز های بندکشی حاصل از شبیه سازی ها برازش می کنیم. همچنین روشی جهت محاسبه آستانه توزیع پارتوی تعمیم یافته برازش شده ارائه می دهیم که قبل از برازش می توان آستانه را محاسبه کرد.