حذف نویز داده های بیان ژنی و کاربرد آن در تشخیص سلول سرطانی با کمک شبکه های عصبی

پایان نامه
چکیده

تحقیقات وسیعی جهت تشخیص بیماری سرطان با بکارگیری داده‏ های بیان ژنی از طریق کاربرد روش‏های مهندسی از جمله هوش مصنوعی در دو دهه اخیر انجام شده است. یکی از مشکلات مهم در بکارگیری داده‏های بیولوژیکی وجود نویز بر روی این داده‏ها است. این امر بر اثر وجود خطا در هنگام جمع آوری این داده‏ها ممکن است رخ دهد. می‏توان با کمک روش‏های هوش مصنوعی این بیماری را در مراحل اولیه که هنوز بصورت غیر قابل کنترل بروز نکرده است تشخیص داده و اقدامات لازم را جهت جلوگیری از رشد آن انجام داد. تشخیص بیماری سرطان در مراحل اولیه به کاهش مرگ و میر و کاهش هزینه های ناشی از درمان کمک شایانی خواهد کرد. در این نوشتار ابندا به کمک روش بردارهای ویژه و روش ترکیبی خوشه‏بندی و استخراج بردارهای مستقل به نویززدایی این داده‏ها پرداخته شده است، سپس ویژگی های برتر به روش pca انتخاب گردیده اند. انواع مدل های هوشمند و کلاسیک از جمله شبکه های عصبی مختلف، بردار ماشین پشتیبان، knn و mmd بر روی داده ها با روش اعتبارسنجی ضربدری 10تایی تست و نتایج آنها با یکدیگر مقایسه و تحلیل شده است.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

شبکه های بیان ژنی برای آنالیز داده ماکرواری DNA

بر خلاف دیدگاه تقلیل گرایانه بیولوژی کلاسیک ، رویکرد کل نگر در بیولوژی با انفجار در پیشرفت تکنیک هایی با تکنولوژی بالا و تولید حجم عظیم داده خود را نشان داده است . اکنون چالش بیولوژیست ها کشف روش های تحلیل این داده ها است تا بتوانند در رسیدن به درک سیستم پویای پیچیده حیات کمک کنند. در بین تکنولوژی های بسیار پیشرفته اخیر که بیشترعمومی هستند میکرواری DNA از مشهورترین آن ها است . میکرواری،سطوح بیا...

متن کامل

مدل سازی خطی سیستم های غیر خطی با کمک شبکه های عصبی مصنوعی بر پایه داده های ورودی – خروجی و کاربرد آن در بویلر نیروگاه

در این مقاله روش جدیدی برای مدل سازی خطی سیستم های غیر خطی ارائه می گردد . اساس روش پیشنهادی طراحی یک شبکه عصبی مصنوعی دو لایه و‌آموزش آن بر مبنای داده های ورودی- خروجی است . وزن های اتصالات این شبکه ضرایب تابع تبدیل هستند . در سیستم هایی که رفتار آنها خطی باشد ، روش حداقل کردن مربعات خطا (lse) بهترین نتایج مدل سازی را ارائه می نماید . در سیستم هایی که رفتار غیر خطی دارند ، نظیر بعضی قسمت های ب...

متن کامل

بررسی اثرات تغییر بیان ریز آر ان ای های سلولی ناشی از ویروس پاپیلوم انسانی در سلول های سرطانی سنگفرشی سر و گردن در سطح پروفیل بیان ژنی

Background and aim: Human Papilloma Virus plays an important role in some of human malignancies and causes alterations in normal expression levels of cellular microRNAs. In this paper, we evaluated the effects of such changes on Head and Neck Squamous Cell Carcinoma tumor samples at gene expression profile level. Methods: in this descriptive-analytical study, gene expression profiles of 36 tum...

متن کامل

تشخیص خودکار خوشه های میکروکلسیفیکاسیون به کمک تبدیل موجک و شبکه های عصبی

در این مقاله، یک سیستم CAD به منظور شناسایی و تشخیص خوشه های میکروکلسیفیکاسیون در تصاویر ماموگرافی معرفی شده است. الگوریتم معرفی شده مرکب از سه مرحله اساسی است. در مرحله اول، تبدیل موجک روی تصاویر ماموگرافی اعمال شده و دو ضریب موجک به همراه دو ویژگی آماری به عنوان ویژگی های متمایز کننده پیکسل ها از نظر تعلق به یک دانه میکروکلسیفیکاسیون استخراج می گردد. سپس با استفاده از یک شبکه عصبی، دسته بندی ...

متن کامل

خوشه بندی داده های بیان ژنی و کاربرد آن در تحلیل افتراق انواع سرطان خون

سابقه و هدف: یکی از شاخه های مهم بیوانفورماتیک فناوری ریزآرایه dna است که امکان بررسی بیان هزاران ژن را به طور هم زمان در حداقل زمان ممکن می سازد که در سال های اخیر موجب تولید حجم انبوهی از داده های بیان ژنی شده است. تحلیل آماری این داده ها شامل نرمال سازی، خوشه بندی، طبقه بندی و ... از جمله روش های مورد استفاده در تحلیل این نوع داده ها است. مواد و روش ها: در این مقاله داده های بیان ژنی سرطان خ...

متن کامل

کاربرد شبکه عصبی مصنوعی در پیش بینی تبخیر-تعرق با حداقل داده های هواشناسی

برآورد دقیق تبخیر- تعرق در اعمال مدیریت بهینۀ منابع آب، ضروری است. تبخیر - تعرق مؤلفه مهمی در توازن آب در مناطق مختلف به شمار می‌رود. مهندسین آب با علم به اینکه چه مقدار از آب آبیاری به مصرف محصول می‌رسد، قادر به محاسبه مهمترین جز آب در سیکل هیدرولوژیک یعنی تبخیر - تعرق خواهند بود. در مطالعه حاضر تبخیر– تعرق روزانه دشت ارومیه با استفاده از داده‌های هواشناسی طی دوره آماری 1390 – 1363 به روش فائو...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی - پژوهشکده برق و کامپیوتر

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023