طراحی پپتیدوممتیک مهار کننده های جدید پروتئاز htlv-1 بر اساس مطالعات داکینگ و شبیه سازی دینامیک مولکولی

ویروس htlv-1 از خانواده رتروویروس ها می باشد و باعث ایجاد بیماری هایی نظیر لوسمی t-cell بزرگسالان (atl) ، تشنج گرمسیری فلج کننده (ham/tsp ) و اختلالات عصبی می گردد. پروتئین پروتئاز یکی از مهمترین آنزیم های ویروسی بشمار می رود و با مهار آن می توان از ادامه چرخه آلودگی این ویروس جلوگیری بعمل آورد. سری جدیدی از مهار کننده ها را ایجاد گردید و با استفاده از ابزارهای محاسباتی نحوه اتصال آن ها به پروتئین پروتئاز را سنجیده شد. ترکیبات بر اساس مشابهت با پپتید اصلی و بر پایه مقلدهای پپتیدی توسط برنامه هایپرکم ایجاد و بهینه . ساختار کریستال پروتئاز ویروس htlv-1 از بانک اطلاعات پروتئینی دانلود گردید و توسط برنامه گرومکس طی عمل دینامیک مولکولی به حالت اولیه خود تبدیل گردید، این عمل بر روی پروتئازهای ویروس های hiv و blvنیز صورت گرفت. خصوصیات admet مهارکننده های طراحی شده توسط برنامه های تحت وب molinspiration، molsoft و lazar مورد ارزیابی قرار گرفت. عمل داکینگ مولکولی توسط برنامه اتوداک بر روی مهارکننده های طراحی شده انتخاب شده انجام گردید و دو ترکیبی که بهترین نتیجه را ارائه داده بودند انتخاب شده و عمل داکینگ با پروتئازهای ویروس hiv و blv نیز انجام گردید. عمل دینامیک مولکولی بر روی بهترین نتایج حاصل از داکینگ مولکولی ویروس های htlv-1 و hiv توسط گرومکس بمدت 20 نانوثانیه انجام گردید. نتایج حاصل از بررسی های admet، داکینگ و دینامیک مولکولی به ما نشان دادند ترکیبات جدید که بر پایه مقلدهای پپتیدی (سولفانوپپتویدها) ایجاد شده اند ، می توانند ترکیبات بالقوه ای برای مهار پروتئازهای ویروسی باشند و با ایجاد تغییرات مناسب در آن ها می توان از این ترکیبات هدف بعنوان ترکیبات موثری برای مهار و مبارزه با عفونت های ویروسی استفاده نمود .