بحث تخصیص اعتبارات همواره یکی از موضوعاتی بوده است که سازمان ها و نهاد ها را با مشکلات و چالش هایی مواجه ساخته است و دانشگاه ها و مراکز آموزش عالی نیز به عنوان متولی امر آموزش و پژوهش به دلیل افزایش روزافزون تقاضا برای آموزش و مبهم و مورد اختلاف بودن اولویت های پژوهشی و مشخص نبودن ماهیت واقعی دستاورد ها، تنش های مربوط به تخصیص اعتبارات را بیش از سایر سازمان ها حس کرده اند؛ بنابراین شناسایی معیار های مناسب تخصیص اعتبارات پژوهشی و تلاش برای تخصیص بهینه آن به کمک سیستم های هوشمندی مانند شبکه های عصبی مصنوعی که در جهت بهبود کیفیت تصمیمات مالی به موفقیت هایی دست یافته اند ضروری بوده است. در این پژوهش ابتدا به کمک آئین نامه های تخصیص اعتبار پژوهشی وزارت علوم و دانشگاه های علامه طباطبایی، تهران، شهید بهشتی و صنعتی امیرکبیر، معیار های تخصیصی که در حال حاضر در این دانشگاه ها مورد تایید هستند تعیین شدند. سپس با تکمیل پرسشنامه توسط معاونین پژوهشی، معیار هایی که از دیدگاه این معاونین برای تخصیص مناسب هستند نیز شناسایی گردیدند سرانجام به منظور طراحی الگوی تخصیص اعتبار پژوهشی، معیار های به دست آمده را در قالب الگو وارد نرم افزار matlab نموده و به کمک شبکه هاپفیلد الگوی مناسب به دست آمد.