موفقیت کسب وکارهای اینترنتی زمانی بیشتر است که وب سایت آنها بالاترین میزان کیفیت را در میان وب سایتهای جایگزین داشته باشد . این امر موجب می شود که کاربران یک وب سایت را به عنوان ارجح ترین وب سایت انتخاب کنند . ارتباط میان کیفیت وب سایت و ارجحیت توسط پژوهشگران بسیاری مطرح شده است ، ولی مطالعه ای تجربی در زمینه ارزیابی کیفیت وب سایتهای علمی و دانشگاهی به ویژه در ایران صورت نگرفته است. هدف این پژوهش شناسایی عوامل تأثیر گذار بر کیفیت وب سایتهای علمی و دانشگاهی و تعیین بهترین وب سایت می باشد. طرح مفهومی مورد استفاده در این پژوهش بر چهار مولفه اصلی کیفیت وب سایت شامل کیفیت اطلاعات ، کیفیت سیستم ، کیفیت خدمات و کیفیت ویژه تأمین کنندگان و 14 متغیر عملیاتی تأکید دارد . پژوهش توصیفی و از نوع پیمایشی بوده و جامعه آماری آن عبارت است از دانشجویان تحصیلات تکمیلی که در رشته مدیریت فناوری اطلاعات دانشکده های مدیریت دانشگاههای دولتی شهر تهران مشغول به تحصیل می باشند. در این پژوهش ، نمونه گیری احتمالی از نوع تصادفی برای انتخاب افراد گروه نمونه ، مناسب تشخیص داده شد و ابزار مورد استفاده برای جمع آوری اطلاعات از این افراد پرسشنامه بوده است. داده های به دست آمده با روش تجزیه و تحلیل سلسه مراتبی و به کمک نرم افزار expert choice در مدل مورد آزمون قرار گرفتند. یافته های پژوهش برتری وب سایتهای علمی با وزن 669/0 را نشان داد . بررسی مجزا در میان تک تک دانشگاهها بیانگر برتری وب سایتهای علمی بر وب سایتهای دانشگاهی بود. یافته ها بیانگر آن بودند که مولفه اصلی کیفیت اطلاعات مهمترین عامل برتری وب سایتهای علمی بوده و مولفه اصلی کیفیت خدمات موجب برتری وب سایتهای دانشگاهی شده است. بررسی وزن نرمال متغیرهای عملیاتی کیفیت وب سایت نشان داد که مرتبط بودن اطلاعات ، به روز بودن اطلاعات ، و قابل فهم بودن اطلاعات از مهمترین عوامل برتری وب سایتهای علمی هستند. کم اهمیت ترین متغیر در تعیین کیفیت وب سایتهای علمی و دانشگاهی را صرفه جویی در هزینه های دسترسی دارد و متغیرهای شخصی سازی ، ساختار و امنیت نیز از اهمیت زیادی برخوردارد نیستند. نتایج تجزیه و تحلیل حساسیت پیشنهاداتی را برای طراحان وب سایتها به همراه داشت. بهتر است طراحان وب سایتهای دانشگاهی برای بالا بردن کیفیت وب سایتهایشان کیفیت خدمات را که مهمترین متغیرهای عملیاتی آن به ترتیب پایایی ، همدلی ، پاسخگوبودن می باشند را افزایش دهند. و طراحان وب سایتهای علمی نیز برافزایش کیفیت اطلاعات که مهمترین متغیرهای عملیاتی آن به ترتیب مرتبط بودن اطلاعات ، قابل فهم بودن اطلاعات و به روز بودن اطلاعات می باشند، توجه کنند.