نام پژوهشگر: سجاد نظامدوست

شبیه سازی زنجیره های بیولوژیکی نادر با استفاده از mcmcmc
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران 1390
  سجاد نظامدوست   افشین فیاض

یکی از مهمترین مسایل در علم ژنتیک مقایسه زنجیره های بیولوژیک مانند dna و پروتئین ها می باشد. با توجه به نتیجه مقایسه می توان شباهت زنجیره ها را مشخص کرد. تشابه دو زنجیره نشان دهنده این مطلب است که پدر(نقطه تکامل) هر دو زنجیره یکسان می باشد. بنابراین این شباهت ها منتج به طبقه بندی این زنجیره در خانواده و زیر خانواده ها می گردد. این کار به پیش بینی عملکرد ساختمان ثانویه و همچنین بدست آوردن شجره یک پروتئین کمک می کند. این همانندی دو زنجیره که مفهوم کیفی است را کمی نموده (رتبه محلی نامیده می شود) و مرحله بعدی بررسی معنی داری این کمیت می باشد. حاصل مطالعات فراوان تجربی و تئوریک که در این زمینه انجام شده نشان داد که می توان معنی داری رتبه محلی را از طریق توزیع گامبل بدست آورد. از آنجایی که این رتبه های بزرگ بسیار کمیاب هستند و احتمال تولید آنها بسیار کوچک می باشد لذا از طریق نمونه گیری های معمولی نمی توان به آنها دست یافت. اخیرا برای حل این مشکل روش نمونه گیری از پیشامدهای نادر پیشنهاد شده است که این ایده بر اساس روشی در فیزیک آماری می باشد