در این پژوهش اثر ضد قارچی باکتری باسیلوس پومیلوس sg2 روی برخی از قارچ های بیماریزای گیاهی مورد بررسی قرار گرفت. به علت همزیستی این باکتری با ریزوکتونیا سولانی و هم چنین ناشناخته بودن این باکتری، ژن کیتیناز chis آن به همراه پروموترش توسط pcr از ژنوم باسیلوس پومیلوس sg2 تکثیر و قطعه تکثیر شده در شاتل وکتور pdhafb کلون گردید. پس از تأیید صحت ساختار، وکتور نوترکیب بوسیله ی آنزیم scai از حالت حلقوی خارج و به صورت خطی در آورده شد. پلاسمید خطی شده به باکتری باسیلوس سوبتیلیس trpc2 منتقل و قطعه ژنی طی فرآیند نوترکیبی همولوگی به جای ژن آمیلاز قرار گرفت. بیان پروتئینchis با روش sds-page و آنالیز وسترن بلات تأیید و میزان فعالیت آنزیم با روش میلر اندازه گیری شد. در نهایت آنزیم تولید شده از باکتری نوترکیب با آمونیم سولفات رسوب داده شد و پس از حل شدن در بافر مناسب برای تخمین فعالیت آنزیم و بررسی اثر ضد قارچی پروتئین نوترکیب بر روی برخی قارچ های بیماریزای گیاهی مورد بررسی قرار گرفت. اثر ضد قارچی باسیلوس سوبتیلیس نوترکیب روی ایزوله های قارچی نیز آزمون شد. نتایج نشان داد آنزیم بیان شده در باسیلوس سوبتیلیس توانست جلوی رشد ریزوکتونیا سولانی، اسکلروتینیا اسکلروتیوروم، فوزاریوم گرامیناروم را بگیرد و این نشان می دهد علاوه بر بیان پروتئین در سیستم باسیلوس سوبتیلیس، پروتئین دارای فعالیت کیتینازی بر روی دیواره ی این قارچ ها می باشد. از طرف دیگر بررسی اثر ضد قارچی باکتری باسیلوس سوبتیلیس upchi در برابر این سه قارچ نشان داد که این باکتری تنوانست از رشد این قارچ ها جلوگیری کند.

یکی از مشکلات تولید محصولات جالیزی بخصوص گیاهان خانواده کدوئیان خسارت بالای پاتوژنهای قارچی است که استفاده بی رویه از سموم را دی پی داشته است. از طرفی بعضی از خویشاوندان وحشی خانواده کدوئیان مقاومت خوبی را در تقابل با انواع پاتوژنها بروز داده اند و میتوان از آنها به عنوان ذخایر ژنتیکی برای اصلاح گیاهان زراعی حساس بهره برد. در این پژوهش توالیهای ژنی کد کننده ژن رمزگردان کیتیناز از هندوانه ابوجهل جداسازی شد. برای این کار از dna ژنومی یا cdna سنتز شده از rna کل به عنوان الگو برای جداسازی توالی مورد نظر استفاده شد. پس از بررسی های بیوانفورماتیکی روی تولیهای مشابه موجود در بانک ژن، پرایمرهای دقیق و دژنره از توالیهای اجماعی طراحی شدند و توالیهای مذکور پس از تکثیر با pcr در وکتورهای ta همسانه سازی و توالییابی شدند. در مرحله بعد پرایمرهای حاوی سایت برشی xbai و saci طراحی شدند و قطعات ژنی پس از تکثیر مجدد در وکتورهای دوتایی pbi121 همسانه سازی و پس از بررسی های اولیه و اطمینان از صحت آنها، به اگروباکتریوم نژاد gv3101 منتقل شدند. گیاهان آرابیدوپسیس با اگروباکتریومها تلقیح و گیاهان تراریخت در محیط انتخابی گزینش شدند. این گیاهان سپس با روشهای pcr و rt-pcr ارزیابی شدند. نتایج نشان داد با استفاده از هر دو نوع الگوی dna ژنومی و cdna، قطعه ژنی به طول 978 جفت باز که شامل orf کامل ژن کیتیناز بود ایجاد شد که نشان دهنده عدم وجود اینترون در ژن مذکور بود. آزمون pcr گیاهان انتخابی نشان داد که این گیاهان ژن کیتیناز را دریافت کرده اند و آزمون rt-pcr بیانگر نسخه برداری این ژن در اکثر لاینهای تراریخت بود. بررسی های اولیه نشان داد تغییرات مرفولوژیک یا فیزیولوژیک خاصی در گیاهان تراریخت ایجاد نشده است و نمو آنها مشابه گیاهان شاهد غیر تراریخت بوده است.

شوری خاک یکی از عوامل غیرزنده ی پراهمیتی است که عملکرد محصول را در نواحی خشک و نیمه خشک تحت تاثیر قرار می دهد. تنش های محیطی گوناگون از جمله شوری با برهم زدن شرایط مطلوب، سبب بروز اختلالات متابولیسمی در سلولهای گیاهی می گردند که یکی از عوامل اصلی این اختلالات افزایش تولید انواع گونه های اکسیژن فعال (ros) می باشد. مسیر گلوتاتیون-آسکوربات نقش مهمی را درسمیت زدایی گونه های فعال اکسیژن (ros) در گیاهان آوندی بازی می کند. یکی از آنزیم های کلیدی در این مسیر مونودهیدروآسکوربات ردوکتاز(mdhar) با کوفاکتور fad است که نقش احیاکنندگی رادیکال های مونودهیدروآسکوربات را بر عهده دارد. در تحقیق حاضر آنزیم مونودهیدرو آسکوربات ردوکتاز، از گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس ( aeluropus littoralis ) به عنوان منبع ژنتیکی بالقوه برای بهبود تحمل شوری و خشکی در گیاهان، شناسایی، جداسازی و همسانه سازی گردید و به گیاه توتون انتقال داده شد. برای این منظور با توجه به اطلاعات در دسترس در پایگاه ncbi ، پرایمرهای مناسب طراحی و با روش rt-pcr ژن مذکور جداسازی گردید و در وکتور ptz57r/t درون باکتری ا.کلای (dh5?) به منظور توالی یابی همسانه سازی شد. سپس به منظور انتقال به گیاه توتون رقم سامسون، با آنزیم pfu تکثیر گردیده و در ناقل pgreen0029 با پروموتور و ترمیناتور 35s که به طور جداگانه به ناقل مذکور الحاق گردید، درون باکتری اگروباکتریوم (lba4404)، همسانه سازی شد و در نهایت به گیاه توتون رقم سامسون به روش دیسک برگی انتقال داده شد. آزمون pcr گیاهان انتخابی نشان داد که این گیاهان ژن mdhar را دریافت کرده اند و آزمون rt-pcr بیانگر بیان اولیه ی این ژن در گیاهان تراریخت است. ژن mdhar شامل 1436 جفت باز و فاقد نواحی اینترونی است. مقایسه ی توالی به دست آمده با توالی های سایر mdhar های گیاهی ثبت شده در بانک ژن، بیانگر شباهت بالای این ژن با سایر mdhr های جدا شده از گیاهان خانواده ی گندمیان بوده که بیشترین شباهت با مقادیر 89 درصد با mdhar سورگم(sorghum bicolor)، وجود داشت.