نام پژوهشگر: ابولفضل گلستانی

بررسی نقش پروپپتید انتهای کربوکسیل در ترشح bka (bacillus sp. kr8104 ?-amylase)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پایه 1389
  فاطمه یوسفی   خسرو خواجه

سویه bacillus sp. kr8104 آلفا-آمیلازی غیر وابسته به کلسیم تحت نام bka تولید و با کارایی بالا به محیط کشت خود ترشح می‏کند. کریستالوگرافی آنزیم خالص‏شده از محیط کشت پروتئینی با سه دمین عمومی آلفا-آمیلازها متشکل از 422 آمینو اسید را نشان می‏دهد. ژن این آنزیم پروتئینی با 659 آمینو اسید کد می‏کند که علاوه بر ناحیه 422 آمینو اسیدی به دست آمده در کریستالوگرافی دارای دو پپتید دیگر یکی 44 آمینو اسیدی در انتهای آمین (با مشخصات پپتیدهای نشانه مسیر ترشحی sec) و دیگری 193 آمینو اسیدی در انتهای کربوکسیل است. آنزیم بدون پپتید انتهای کربوکسیل km و kcat بیشتری را در مقابل دو سوبسترای نشاسته و eps نشان می‏دهد. برای بررسی نقش این پپتید در ترشح آنزیم چهار فرم نوترکیب مختلف از bka با و بدون پپتیدهای انتهای آمین و انتهای کربوکسیل[bka, bka?(c193), bka?(n44) and bka?(n44c193)] در باکتری e. coli bl21 تولید شدند. آنزیم‏های با پپتید انتهای کربوکسیل بیشتر از دو فرم دیگر به محیط کشت ترشح می‏شدند که نشانه‏ای از نقش این قطعه در ترشح آنزیم است که در این مطالعه به تفصیل در مورد آن بحث می‏شود. به علاوه حضور فرم‏های آنزیمی فاقد پپتید نشانه انتهای آمین در محیط کشت ترشح غیر وابسته به پپتید نشانه را نشان می‏دهد که می‏تواند به علت تشکیل ساختار کره مذاب در محیط اسیدی اطراف فسفولیپیدهای غشایی باشد. تشکیل ساختار کره مذاب دو فرم آنزیمی bka?(n44) و bka?(n44c193) در محیط‏های اسیدی با فلورسانس ذاتی، و اتصال ans تایید شد.