نام پژوهشگر: مهرداد شفیعی ثابت

چگونگی استفاده از پروتئینها در مطالعات فیلوژنتیکی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تهران - دانشکده علوم 1370
  مهرداد شفیعی ثابت

چکیده : کاربرد روشهای مختلف الکتروفورز پروتئینهای گیاهی در سیستمهای بافری ناپیوسته و تحت شرایط عادی و تقلیب کننده پروتئینها در تعیین خویشاوندیهای فیلوژنتیکی در سطوح مختلف تاکزنومیکی در گیاهان مورد مطالعه قرار گرفته است .به این منظور31 تاکزون در تیره شب بو (کروسیفر) برای اولین بار با روش الکتروفورز روی شیب نمایی غلظت آکریلامید و در حضور شرایط تقلیب کننده اس - دی - اس مرکاپتواتانول مورد آنالیز قرار گرفتند که 16 تای آنها به طایفه براسیسه و 9 تاکزون متعلق به جنس براسیکا بودند.مقایسه داده های بدست آمده از اندیسهای تشابه نشان داد که این روش به اندازه آنالیز الکتروفورزی بخش آلبومینی و گلب مینی و گلبولینی دانه تحت شرایط غیرتقلیب کننده و درسیستم بافرمی ناپیوسته ک توسط ووگان و همکارانش انجام شده بود ارزشمنداست و باتوجه به سهولت این روش میتواند جایگزین خوبی برای روش فوق باشد،نتایج همچنین نشان داد که این الکترو فورزتنها در مطالعه روابط فیلوژنتیکی درحد تاکزونهای نزدیک و باجنسهای نزدیک ارزشمنداست .بنابراین از سه روش دیگر الکتروفورز برای جداسازی پروتئینهای دانه های 9 تاکزون از جنس براسیکا و جنس نزدیک به آن سیناپیس استفاده شد که عبا است از الکتروفورز در سیستم بافری ناپیوسته ولی بدون شیب غلظت آکریلامید (رو لاملی)، که توام با تخمین وزن مولکولی پپتیدهای جدا شده بود همچنین آنالیز بخش و آلبومینی و گلوبولینی پروتئینهای دانه به همان روش ووگان و همکارانش انجام شد.از 9 تاکزون مورد آزمایش 5 تای آنها واریته های زراعی جنس کلم یعنی کلم قمری، کلم بروکسل، کلم سفید،کلم گل و کلم کپنهاک بوده و خردل سیاه و کلم صحرایی از جنس براسیکاو خردل سفید از جنس سیناپیس مورد آزمایش قرارگرفت واندیسهای تشابه حاصل را به کمک یک برنامه کامپیوتری با روش آنالیز خوشه ای مورد مقایسه قرارداده از یک برنامه کامپیوتری برای محاسبه و رسم کلادوگرام از جدول اندیس تشابه استفاده شده، نتایج حاصل از این عقیده که کلم اولراسه، خردل سیاه و کلم صحرایی (کامپستریس) سه تاکزون کاملا" مجزا هستند حمایت کرده همچنین نشان دادند که کلم صحرایی (کامپستریس) از خردل سیاه به واریته های مختلف کلم اولراسه نزدیک تر است کلیه نتایج حاصل با نتایج بدست آمده از روشهای دیگر الکتروفورزی، سیتوژنتیکی، مورفولوژیکی و سرولوژیکی محققین دیگر مطابقت دارد و ازاین عقیده که الکتروفورز بخش محلول پروتئینها تحت شرایط تقلیب کننده و درسیستم بافری ناپیوسته میتواند یک روش آسان و قدرتمند برای بررسی روابط فیلوژنتیکی در سرده های نزدیک در تیره شب بو باشد حمایت میکند. برای نخستین بار درایران روش بررسی پلی مورفیسم آنزیمی در شناسایی واریته های زراعی مختلف سیب مورد ارزیابی قرارگرفت . ودراین راستا نمونه های زیادی از بیش 20 واریته زراعی مختلف سیب درنظر پلی مورفیسم آنزیم پراکسیدازبرگ مورد آزمایش قرار گرفتند،ودراین بررسی از برگهایی که در مراحل مختلف نموی بودند ا واریته های زراعی مختلف و از مکانهای جغرافیایی مختلف را بایکدیگر مقایسه کردیم نتایج حاصل نشان دادند هنگامیکه برگهای ثانویه واریته های مختلف را با هم مقایسه کنیم تفاوتی در الگوی پراکسیدازی در درون یک واریته زراعی مشاهده نخواهد شد درعوض پلی مورفیسم دربین واریته های زراعی مختلف به اندازه ای که موجب تشخیص افتراقی بسیاری از واریته ها از یکدیگر شود وجود دارد.درحالی که برای تشخیص برخی دیگر از واریته ها نیاز به مطالعه سیستمهای آنزیمی دیگری غیر از پراکسیداز خواهیم داشت .