نام پژوهشگر: مصطفی سعادت

بررسی اثر میدان الکترومغناطیس با فرکانس پایین بر شاخص های کارکرد کبدی و میزان بیان ژن gstt1 در کبد موش های صحرایی نر
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1387
  زهرا صداقت   امین الله بهاءالدینی

در این تحقیق, اثر میدان الکترومغناطیس با فرکانس بسیار پایین و شدت 500 میکروتسلا, نهایت محدوده استاندارد برای کارگران, بر شاخص های کارکرد کبدی و میزان بیان ژن gstt1 موش های صحرایی نر با روش زیر بررسی شد: 17 سر موش صحرایی نر به سه گروه تقسیم شدند؛ 1- گروه آزمایش (7 سر موش) به مدت 30 روز در معرض میدان الکترومغناطیس با شدت 500 میکروتسلا و فرکانس 50 هرتز قرار گرفتند. 2- گروه شم (5 سر موش) که طی این مدت درون سولونوئید خاموش قرار گرفتند. 3- گروه کنترل (5 سر موش) که به مدت یک ماه در شرایط معمول آزمایشگاه نگهداری شدند. پس از گذشت 30 روز, حیوان ها وزن شده و پس از بیهوش کردن, خونگیری از آئورت شکمی آنها به منظور بررسی شاخص های کارکرد کبدی صورت گرفت و کبد آنها برای استخراج rna و بررسی میزان بیان ژن gstt1 جداسازی. پس از انجام آزمایش ها, داده ها به روش anova با استفاده از آزمون دانکن و با در نظر گرفتن سطح معنی داری(0/05>p) تجزیه و تحلیل شد. نتایج نشان داد که سطح فعالیت alt در گروه آزمایش نسبت به دو گروه دیگر کاهش معنی داری یافته است (0/001> p). در مورد دیگر شاخص های کبدی تفاوت معنی داری بین گروه ها وجود ندارد و میزان بیان ژن gstt1 در بین دو گروه کنترل و آزمایش تفاوت معنی داری را نشان نمی داد. با توجه به این نتایج به نظر می رسد میدان الکترومغناطیس با شرایط این تحقیق می تواند دارای یک پتانسیل درمانی بوده و اثر مثبتی بر کبد داشته باشد

اثر برخی محرکهای محیطی بر میزان رشد و بیان ژن gst کلاسهای phi و tau در گیاهچه ذرت ایرانی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز 1388
  مریم السادات شهرتاش   حسن محبت کار

با گسترش روزافزون صنایع و استفاده از فلزات سنگین، امکان آلودگی محیط زیست و نیز خطر ورود فلزات سنگین به زنجیره غذایی افزایش پیدا کرده است. همجنین در راستای افزایش سطح زیرکشت محصولات کشاورزی استفاده بی رویه از علف کش ها، نه تنها موجب پیدایش گونه های مقاوم علف هرز می شود، بلکه باقیمانده علف کش ها در محیط و در محصولات کشاورزی و ورود آنها به زنجیره غذایی انسان اثرات جبران ناپذیری بر سلامت باقی خواهد گذاشت. از آنجا که کشت ذرت به جهت مصارف خوراکی، دامی و صنعتی بسیار مورد توجه می باشد در این پژوهش اثر فلز سنگین کادمیم بر گیاه ذرت و تأثیر تیمار گیاه ذرت با عنصر سیلیکون، سالیسیلیک اسید و عنصر کلسیم در کاهش تنش کادمیم از طریق تأثیر بر فرایندهای مختلف بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی گیاه مورد مطالعه قرار گرفته است. همچنین اثر علف کش های پاراکوت و گلیفوسیت و تأثیر تیمار گیاه با سالیسیلیک اسید در کاهش تنش علف کش های فوق از طریق تأثیر بر پاسخهای فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی بررسی گردید. جداسازی ژن گلوتاتیون – s – ترنسفراز(کلاس tau) و القاء آن توسط کادمیم انجام گرفت. همچنین اثر فلز سنگین کادمیم بر آسیب dna نوک ریشه گیاه ذرت و ایجاد پلی مورفیسم dna با استفاده از تکنیک rapd بررسی گردید. کشت ذرت رقم 704 سینگل کراس در محلول غذایی هوگلند، در محیط کشت پرلیت و در شرایط گلخانه انجام گرفت. اثر غلظت های مختلف سیلیکون، سالیسیلیک اسید و کلسیم بر تنش کادمیم از طریق اندازه گیری میزان کلروفیل، کاروتنوئید، آنتوسیانین، پرولین، پراکسیداسیون لپیدهای غشا، قندهای محلول، درصد آب نسبی برگ، وزن تر و خشک اندام هوایی و زیرزمینی و مقدار جذب کادمیم در اندامهای هوایی و زیرزمینی بررسی شد. نتایج نشان داد که در تنش فلز کادمیم، مقدار کلروفیل و کاروتنوئید، وزن تر و خشک و درصدآب نسبی برگ به طور معنی داری در سطح 05/0 ? ? کاهش می یابد. همچنین مقدارآنتوسیانین، پرولین، پراکسیداسیون چربی، قندهای محلول در برگ و مقدار جذب کادمیم در اندامهای زیرزمینی و هوایی به طور معنی داری در سطح 05/0 ? ? افزایش یافت. تیمار گیاه با سیلیکون، سالیسیلیک اسید و کلسیم موجب کاهش تغییر در متغیرهای فیزیولوژیکی ذکر شده در سطح معنی داری نسبت به گیاه تحت تنش گردید. نتایج مولکولی نشان می دهند که بیان ژن گلوتاتیون – s – ترنسفراز(کلاس tau) در برابر تنش کادمیم القا می شود. همچنین با افزایش مقدار کادمیم، مقدار پلی مورفیسم و آسیب dna در ریشه افزایش می یابد. تأثیر غلظت های مختلف سالیسیلیک اسید بر تنش پاراکوت و گلیفوسیت، از طریق اندازه گیری مقدار کلروفیل، آنتوسیانین، پرولین، پراکسیداسیون چربی، درصد آب نسبی برگ، وزن تر و خشک اندام هوایی و زیرزمینی و فعالیت آنزیم کاتالاز بررسی گردید. تنش علف کش ها موجب کاهش کلروفیل، کاروتنوئید، آنتوسیانین، درصد آب نسبی برگ، وزن تر و خشک گیاه و همچنین باعث افزایش مقدار پرولین، پراکسیداسیون لپیدهای غشا و فعالیت آنزیم کاتالاز گردید. تیمار برگی با سالیسیلیک اسید تغییرات در متغیر های ذکر شده را نسبت به گیاه تنش در سطح معنی داری کاهش داد.

بررسی رابطه ی چندشکلی های ژنتیکی gstt1، gstm1 و gstz1 و بیماری amd (age-related macular degeneration
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1389
  حسن عثمان   مصطفی سعادت

بیماری amd یک بیماری چشمی است که به دلیل زوال شبکیه ی چشم حاصل می شود. بیماری amd از دلایل عمده ی نابینایی برگشت ناپذیر در افراد 65-60 سال و بالاتر می باشد. دو نوع مختلف از این بیماری وجود دارد: ترشحی و غیر ترشحی. گلوتاتیون -s ترانسفرازهای محلول (gsts) یک خانواده ی بزرگ مستقل از پروتئین های چند وظیفه ی هستند و بعنوان آنزیم های فاز دوم بیوترانسفورماسیون شناخته شده و در محافظت سلول ها در برابر گونه های فعال اکسیژن (ros) و سم زدایی بسیاری از گزینوبیوتیک ها شامل کارسینوژن ها، آلودگی های محیطی، عوامل ضد سرطان، آنتی بیوتیک ها و محصولات فرآیندهای اکسیداتیو نقش دارند. در مطالعه حاضر پلی مورفیسم ژن های gstt1، gstm1 و gstz1 در ارتباط با استعداد ابتلا به بیماری amd مورد بررسی قرار گرفت. 112 فرد مبتلا به amd و 112 فرد سالم به عنوان افراد بیمار و شاهد انتخاب شدند. ژنوتیپ های gstt1 و gstm1 با روش pcr و ژنوتیپ gstz1 با روشrflp-pcr تشخیص داده شد. نتایج مطالعه ی حاضر هیچ ارتباطی را برای نقش ژن های gstt1 (542/0 = p، 511/1 _ 456/1 = ci 95%، 83/0 or =)، gstm1 (889/0 =p ، 66/1 _ 558/1 = ci 95%، 962/0or = ) و gstz1 (05/0>p) با ظهور ابتلا به amd نشان نمی دهد. ارتباط استعمال دخانیات (004/0p =، 25/5-35/1=%95 ci، 66/2=or) با بیماری amd در این مطالعه تایید شد. در گروه بیماران, فراوانی افراد شاغل در خارج اتاق با بیماری amd ارتباط نشان داد (025/0p =، 55/3 – 08/1 = ci 95%، 96/1 = or)،

ارتباط چندشکلی های xrcc?،xrcc?،gsto? با فراوانی شکست کروماتیدی ایجاد شده در لنفوسیت های انسان به واسطه تیمار با سدیم آرسنیت.
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1390
  غلامرضا رفیعی   مصطفی سعادت

آرسنیک عنصر شبه فلزی می باشد که در صنعت کاربرد بسیاری دارد. بر اساس یافته های پیشین، مشتقات آرسنیک از جمله موادی با خاصیت توکسیکوژنیک و کلاستوژنیک می-باشند. این مواد در افراد مختلف، به خصوص از نظر ناهنجاری های کروموزومی تاثیرات متفاوتی دارند. از قرار معلوم، گلوتاتیون s-ترانسفراز2 از جمله ژن هایی است که در متابولیسم آرسنیک نقش دارد. دو ژن xrcc6 (ku70) و xrcc5 (ku80) نقش مهمی در ترمیم شکست دو رشته ای dna از طریق اتصال دو انتهای ناهمساخت دارند. سه چندشکلی gsto2،xrcc6 و xrcc5 که به ترتیب تحت عناوین rs156697، rs5751129 و rs617172 نامگذاری شده اند، بیان ژن ها و عملکرد محصولات پروتئینی آنها را تحت تاثیر قرار می دهند. در مطالعه حاضر تلاش بر این است که پس از تیمار خون 123 نفر مرد سالم باسدیم آرسنیت، ارتباط میان ناهنجاری های کروموزومی ایجاد شده با چندشکلی های فوق-الذکر مشخص شود. براساس یافته های حاضر،تجزیه و تحلیل های آماری نشان می دهد که شکافهای ایجاد شده به واسطه سدیم آرسنیت در افراد دارای ژنوتیپ asp/asp مربوط به ژن gsto2 به طور معنی داری بیش از دو ژنوتیپ asn/asn و asn/asp بوده و درصد ناهنجاری تام در افراد دارای ژنوتیپ asp/asp به طور معنی داری بیش از ژنوتیپ asp/asp است (05/0 p<). ارتباطی میان چندشکلی xrcc6 (t991c) و ناهنجاری های کروموزومی مشاهده نشد. با توجه به چندشکلی xrcc5 vntr (rs6147172)، شکستهای کروماتیدی ایجاد شده در ژنوتیپ 0r/1r به طور معنی داری از ژنوتیپ 1r/1r کمتر بوده و درصد سلولهای دارای ناهنجاری تام در افراد دارای ژنوتیپ های 0r/2r، 1r/1r و 1r/2r به طور معنی داری بیش از افراد داری ژنوتیپ 0r/1r می باشد (05/0 p<).

بررسی همراهی بین پلی مورفیسم های ژنتیکی در گلوتاتیون -s ترانسفراز (gstm1 ، gstt1 و gstp1) و بیماری دیابت ملیتوس نوع ii در جمعیت استان فارس
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم 1390
  الهام موثر   نگار آذرپیرا

دیابت ملیتوس، یک اختلال معمول و پیچیده است که اهمیت آن در جهان به سرعت روبه افزایش می باشد. این بیماری توسط هیپرگلیسمی مزمن شناخته می شود و با افزایش تولید گونه های فعال اکسیژن (ros) همراه است. آنزیم های آنتی اکسیدان از جمله گلوتاتیون s-ترانسفراز، در جمع آوری رادیکال های آزاد نقش مهمی دارند امّا عدم تعادل میان مکانیسم های دفاعی سلول و تولید ros می تواند موجب تجمع این رادیکال ها، ایجاد استرس اکسیداتیو و تخریب بافت ها بخصوص سلول های بتا در پانکراس شود. هدف از انجام این مطالعه، بررسی همراهی میان پلی مورفیسم های ژنتیکی در سه کلاس از ژن های gst (gstm1,gstt1, gstp1) و بیماری دیابت ملیتوس نوع ii (t2dm) در جنوب ایران می باشد. برای این منظور، 340 نفر (171 بیمار و 169 فرد سالم) در این مطالعه شرکت کردند و فراوانی ژنوتیپ های gstm1، t1 و p1 در این افراد توسط روش های multiplex-pcr و pcr-rflp تعیین گردیدند. بر اساس نتایج، در بیماران دیابتی، فراوانی ژنوتیپ gstm1-null به صورت قابل توجهی بیشتر از افراد سالم مورد بررسی بدست آورده شد (or=1.74, 95% ci=1.13-2.69, p=0.016) امّا فراوانی ژنوتیپ های gstt1 (or=1.29, 95% ci=0.077-2.14, p=0.367) و (or=0.83,95% ci=0.53-1.30,p=0.389)gstp1 در بین افراد دو گروه، تفاوت معنی داری را نشان نمی داد. همچنین فراوانی ترکیب دو ژنوتیپ gstm1-null/gstt1-null، در بیماران (88/19%) در مقایسه با افراد کنترل (83/11%) به میزان قابل توجهی بالاتر بود (p=0.022). بنابراین، به طور خلاصه نتایج ما نشان می دادند که ژنوتیپ های gstm1-null و gstt1-null ممکن است در پاتوژنز بیماری t2dm در جمعیت جنوب ایران نقش مهمی داشته باشند.

ارتباط چند شکلی ژنتیکی gstm1 با تغییرات هورمون تستوسترون در کارگران پمپ بنزین
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1390
  سمانه بهاالدینی   مصطفی سعادت

هدف از این مطالعه بررسی اثر ژنوتیپ های gstm1 بر تغییرات هورمون های جنسی کارگران مرد شاغل در پمپ بنزین های شهر شیراز می باشد. مقایسه بین سه هورمون تستوسترون، lh و fsh با در نظر گرفتن ژنوتیپ gstm1 به عنوان یک آنزیم سم زدا انجام گرفت. مطالعه به صورت مورد- شاهدی صورت گرفته است. کل افراد مورد مطالعه 214نفر بودند که ازین تعداد 114 نفر مردان شاغل در جایگاههای پمپ بنزین و 100 نفر مردانی بودند که با ترکیبات بنزینی تماس نداشته اند. میزان هورمون تستوسترون در مردان کارگر (ng/ml23/4( به صورت معنا داری از افراد گروه شاهد (ng/ml88/4) کمتر بود(001/0=p ،212=df ،31/3=t). میزان دو هورمون دیگربین دو گروه اختلاف معنا داری نداشت. میزان هورمون تستوسترون کارگران در هر نوع ژنوتیپ کاهش معنا داری نشان می داد اما شدت کاهش در افراد ژنوتیپ نول چشمگیرتر بود(047/0p=، 212df= 013/2= t). دلیل این یافته را می توان اینگونه توجیه کرد که افراد با ژنوتیپ نول به علت فقدان آنزیم سم زدای gstm1 توانایی سم زدایی ترکیبات بنزین را ندارند.

بررسی اثر داروهای قلبی-عروقی برفراوانی شکست های کروماتیدی در دودمان سلولی cho
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1390
  مژگان صدیق اردکانی   مصطفی سعادت

پروپرانولول, هیدرالازین و دیگوکسین دارو هایی هستند که به طور گسترده ای در بیماری های قلبی-عروقی مورد استفاده قرار می گیرند. اثرات مهاری پروپرانولول بر رشد تومور، التهاب ورگزایی در بسیاری از تحقیقات نشان داده شده است. هیدرالازین نیز دارای اثرات جهش زایی، سرطان زایی و رگزایی می باشد. دیگوکسین یک گلیکوزید قلبی است که اثرات مهاری آن بر رشد انواع سلول های توموری در آزمایشگاه گزارش شده است. در این تحقیق اثرات سیتوژنتیکی دارو های فوق بر دود مان سلولی تخمدان همستر چینی مورد بررسی واقع شده است. برای تعیین شاخص سمیت سلولی (ic50) این داروها، تست mtt انجام شد. مقدار ic50 برای پروپرانولول 42/0 میلی مولار، برای هیدرالازین 250 میکروگرم/میلی لیتر و برای دیگوکسین 22 میکرو گرم/میلی لیتر بدست آمد. به منظور بررسی اثرات کلاستوژنیک این داروها، ناهنجاری های کروموزومی موجود در سلول های متافازی مورد تجزیه وتحلیل قرار گرفتند. بدین منظوردودمان سلولی تخمدان همستر چینی در مجاورت با غلظت های مختلف داروها (پروپرانولول: 1/0،2/0، 3/0و 4/0 میلی مولار، هیدرالازین: 20و40 میکروگرم/میلی لیتر، دیگوکسین: 15 و 20 میکروگرم/میلی لیتر) در مدت زمان 24 ساعت قرار گرفتند. این تست برای دارو های پروپرانولول و هیدرالازین در حضور وعدم حضور سیستم فعال کننده متابولیکی (s9 mix) انجام گرفت زیرا این داروها دارای متابولیسم کبدی هستند. ضمنا میتومایسین و سدیم ارسنیت به عنوان شاهد مثبت به کار برده شدند. در مورد پروپرانولول، در غلظت های 1/0، 2/0 و3/0 انواع ناهنجاری های کروموزومی مشاهده گردید که با افزایش دوز دارو، این ناهنجاری ها افزایش یافته است. در غلظت 4/0میلی مولار نیز تعداد متافاز ها کم بودند. داروی هیدرالازین نیز در غلظت های 20 و40 میکروگرم/میلی لیتر باعث ایجاد ناهنجاری های کروموزومی شد که با افزایش دوز دارو، افزایش ناهنجاری ها مشاهده گردید. افزودن s9 mix بر سلول های تحت تیمار با پروپرانولول و هیدرالازین باعث کاهش معنی داری در ناهنجاری ها گردید. در غلظت های 15 و20 میکروگرم/میلی لیتر داروی دیگوکسین نیز نا هنجاری ها مشاهده شد. اما بین این دو غلظت تفاوت معنی داری مشاهده نگردید در حالی که شاخص میتوزی به طور معنی داری کاهش یافته بود که می تواند به علت مرگ سلول ناهنجار در دوز بالا باشد.

فراوانی چند شکلی های ژنتیکیxrcc4 i/d و sod1 a251g در جمعیت های افغانستان
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  خدیجه تاج بخش   مصطفی سعادت

افغانستان در قلب آسیا واقع شده و حلقه وصل خاورمیانه با حوزه جنوب شرق آسیا محسوب می شود. جمعیت افغانستان شامل اقوام مختلفی می باشد که بزرگترین اقوام آن به ترتیب پشتون ها، تاجیک ها، هزاره ها، ازبک ها و سادات می باشد. در این مطالعه 702 نفر غیر خویشاوند شامل 469 مرد سالم و 233 زن سالم از پنج جمعیت ذکر شده شرکت داشتند. در حدود چهل سال پیش مطالعاتی در مورد ژنتیک جمعیت افغانستان صورت گرفته است و بر اساس آنها گزارش شده که جمعیت افغانستان جزء جمعیت های بسیار هتروژن جهان است. در این مطالعه فراوانی چند شکلی ژنتیکی ژن sod1 a251g و وجود حذف و اضافه در اینترون سه از ژن xrcc4 را مورد بررسی قرار دادیم. در این مطالعه نتایج حاصل از بررسی sod1 نشان می دهد که کمترین فراوانی اللی g در پشتون ها (086/0) و بیشترین فراوانی اللی g در هزاره ها (233/0) می باشد. پشتون ها (p=0.001 =23.61, df=2, 2?) و هزاره ها (p=0.001 df=2, ،=21.55 2?) تفاوت معناداری در مقایسه با بقیه ی قومیت ها نشان دادند. نتایج حاصل از بررسی حذف و اضافه در اینتروژن سه از ژن xrcc4 نشان می دهد که فراوانی اضافه (i) در میان پشتون ها (523/0)، هزاره ها ( 592/0)، ازبک ها (597/0)، سادات (609/0) ، و در میان تاجیک ها (516/0) می باشد. جالب این که با وجود اختلاف شدید هزاره و پشتون ها با بقیه قومیت ها در مورد ژن sod1 a251g، هیچ اختلاف معناداری میان هزاره ها و پشتون ها با بقیه قومیت ها در مورد ژن xrcc4 id دیده نشد.

مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی ساختار سه‏بعدی survivin و بررسی اثر جهش t34a بر ساختار پروتئین
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1390
  فرناز قاسمیان   نوید مقرب

survivin پروتئینی است که مرگ برنامه‏ریزی شده سلول (آپاپتوز) را مهار نموده و چرخه تقسیم سلولی را نیز تنظیم می‏نماید. این پروتئین به شدت در اغلب تومورهای انسانی بیان می‏شود، اما در اکثر بافت‏های طبیعی تمایز‏یافته قابل شناسایی نیست. از میان مطالعات مرتبط با تاثیر جهش‏های مهارکننده survivin در سلول‏های سرطانی، فرم جهش‏یافته t34a مورد توجه بیشتری قرار گرفته است. نتایج به دست آمده از مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی ساختار طبیعی و جهش‏یافته این پروتئین نشان می‏دهد که ایجاد جهش فوق احتمالاً برهمکنش‏های بین survivin و پروتئین‏های hbxip (فاکتور کمکی برای اجرای عملکرد آنتی‏آپاپتوزی survivin) و xpo 1 (پروتئینی که به خروج survivin از هسته کمک می‏نماید) را دچار اختلال می‏‏نماید. از سوی دیگر، این جهش ممکن است باعث تسهیل و تقویت برهمکنش‏های میان survivin و پروتئین‏های smac/diablo (پروتئین مهارکننده فعالیت آنتی‏آپاپتوتیک survivin)، borealin و incenp (دو زیر‏واحد‏ موجود در کمپلکس cpc که در تنظیم صحیح چرخه تقسیم سلولی نقش دارند) و نیز هیستون h3 (پروتئین مورد نیاز برای تفکیک صحیح کروموزوم‏ها در حین تنظیم چرخه تقسیم سلولی) گردد. نتایج مذکور با نتایج به دست آمده از مطالعات تجربی سازگارند.

ارتباط چند شکلی های ژنتیکی حذف و اضافه و g-????t ژن xrcc? با خطر ابتلا به سرطان روده ی بزرگ
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  نغمه امامی   ایرج سعادت

تغییر در ژن های درگیر در ترمیم dna باعث کاهش ظرفیت ترمیم dna می شود و ممکن است در ابتلاء به سرطان تاثیر داشته باشد. با فرض اینکه چند شکلی در ژنهای درگیر در ترمیم dna ممکن است یک عامل خطر برای ابتلاء به سرطان روده ی بزرگ باشد، ژن xrcc4 درگیر در مسیر non homologous end-joining repair (nejr) و ابتلاء به سرطان روده ی بزرگ مورد بررسی قرار گرفت. در این مطالعه مورد – شاهدی 200 بیمار مبتلا به سرطان روده ی بزرگ و 256 فرد سالم حضور داشته اند که از لحاظ سن و جنس با هم یکسان سازی شدند. برای مشخص کردن چند شکلی ژنتیکی xrcc4g-1394t در ناحیه پروموتری و حذف و اضافه اینترون 3 این ژن به ترتیب از روش pcr-rflp و pcr استفاده شد. نتایج ما حاکی از آن است که عوامل خطر ساز مانند سابقه خانوادگی ریسک ابتلاء به سرطان روده ی بزرگ را افزایش می دهد ولی ارتباط معنی داری بین چند شکلی xrcc4g-1394t (ژنوتیپ gg نسبت به tt با 286/1 = or، 218/9 - 179/0 = ci، 803/0 = p.value و ژنوتیپ gt نسبت به tt با 020/1 = or، 825/1 - 570/0 = ci، 948/0 = p.value) و حذف و اضافه اینترون 3 xrcc4 (ژنوتیپ dd نسبت به ii با 399/1 = or، 369/2 - 826/0 = ci، 211/0 = p.value و ژنوتیپ id نسبت به ii با 279/1 = or، 945/1 - 841/0 = ci، 250/0 = p.value) با خطر ابتلاء به سرطان روده ی بزرگ مشاهده نشد.

ترانسفراز -s فراوانی چند شکلی های ژنتیکی گلوتاتیون در قوم لر catو gstt1 ،gstm1
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  فاطمه موسوی کازرونی   مصطفی سعادت

ایران کشوری است در جنوب غرب آسیا و درمنطقه خاورمیانه واقع شده است.جمعیت ایران از اقوام مختلف تشکیل شده است که قومیت های آن عبارتند از: فارس، لر، ترک، بلوچ، کرد، ترکمن، عرب، آشوریان، زرتشتیان، یهودیان، ارامنه. در این مطالعه 200 نفر، شامل 191 مرد سالم و 9 زن سالم از قوم لر شرکت نمودند، که روی فراوانی چندشکلی ژنتیکی ژن های gstm1 و gstt1 وژن catروی کدون262- تحقیق خویش را انجام دادیم. ژن های gstm1 و gstt1 آنزیم های سیتووزولی را کد می کنند، که در فازii متابولیسم سم زدایی مانند مواد سرطان زا در انسان نقش ایفا می کنند. افرادی که دارای حذف کامل هر کدام از این ژن ها هستند قادر به تولید آنزیم های gstm1 و gstt1 نمی باشند. ژن cat یکی از ژن های مهم در سیستم دفاعی بدن علیه آسیب های ناشی از استرس اکسیداتیو می باشد. تا کنون سه نوع شایع چندشکلی در این ژن شناسایی شده است. ما در این تحقیق چندشکلی c>t 262- را بررسی نمودیم. نتایج حاصل از بررسی gstm1 و gstt1 نشان می دهد که فراوانی ژنوتیپ غیرفعال(null) در جمعیت قوم لر به ترتیب 50% و 17% می باشد. همچنین نتایج حاصل از بررسی ژن cat در کدون 262- نشان می دهد که فراوانی آلل c برابر با 82/0 و فراوانی آلل t برابر با 12/0 می باشد.

ارتباط چندشکلی‏های ژنتیکیc-262tcat، a251gsod1 و c609tnqo1 با خطر ابتلا به بیماریage-related macular degeneration
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  ساغر یوسف نیا   ایرج سعادت

بیماری age-related macular degeneration (amd) یکی از دلایل کم بینایی و نابینایی در بیماران بالاتر از 65 سال در جوامع پیشرفته می‏باشد. پیشرفت بیماری آهسته و با افزایش سن اتفاق می‏افتد و به طور تدریجی می‏تواند باعث نابینایی در یک یا دو چشم شود. یکی از مهمترین دلایل ایجاد این بیماری استرس اکسیداتیو ناشی از عوامل محیطی مانند دود سیگار، اشعه x،u.v.، فشار و گرما است که این عوامل باعث افزایش سطح ros شده و نتیجه آن آسیب به ساختار سلول می‏باشد. از طرفی آنزیم‏های آنتی‏اکسیدانت سلول‏ها را در برابر ros حفاظت می‏کند و با توجه به اینکه هرگونه تغییر در ژن‏های آنتی‏اکسیدانت باعث تغییر پتانسیل آنتی‏اکسیدانت سلول‏های شبکیه چشم می‏شود، بر آن شدیم که مطالعه‏ای در زمینه بررسی رابطه چندشکلی‏های ژنتیکی آنزیم‏های آنتی‏اکسیدانت، از جمله sod1 a251g، cat c-262t و nqo1 c609t و بیماری amd را انجام دهیم. مطالعه حاضر اولین مطالعه انجام شده در جهان، در زمینه بررسی ارتباط چندشکلی‏های ژنتیکی ذکر شده و بیماری amd می‏باشد. پس از انجام آنالیزهای رگرسیون binary logistic رابطه معناداری بین چند شکلی‏های ژنتیکی sod1 a251g (727/0=p، 88/0=or، 75/1-44/0=ci95?) و nqo c609t (493/0=p،83/0=or، 42/1-48/0=ci95?( مشاهده نشد ولی رابطه معناداری با ژنوتیپ ct(043/0=p،54/0=or، 98/0-29/0=ci95?) و ct+tt (045/0=p، 55/0=or، 98/0-31/0=ci95?) ژن cat و بیماری amd مشاهده شد به طوری که آلل t خطر ابتلا به بیماری amd را کاهش می‏دهد (036/0=p، 59/0=or، 96/0-36/0=ci95?).

اثر سدیم آرسنیت بر بیان ژن های آنتی اکسیدانت و ترمیمی در دودمان سلولی جورکت
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  مریم صمدایی قادیکلایی   ایرج سعادت

آرسنیک عنصر شبه فلزی است که به طور گسترده در محیط پخش شده‏است و در صنعت کاربرد بسیاری دارد. آرسنیک معدنی به عنوان کارسینوژن کلاس i انسانی دسته بندی شده و خطر ابتلا به سرطان‏های مثانه، پوست، شش، کلیه و کبد را افزایش می‏دهد. مطالعات نشان داده که یکی از مکانیسم‏های احتمالی سمیت آرسنیک، استرس اکسیداتیو می‏باشد. آرسنیک می‏تواند به طور مستقیم با اثر بر مسیر پیام‏رسانی سلولی و تغییر مسیر سیگنالینگ بر بیان و فعالیت ژن‏های آنزیم‏های آنتی‏اکسیدانت اثر بگذارد و با کاهش عملکرد آنزیم‏های آنتی‏اکسیدانت اثرات سمی و سرطان‏زایی خود را افزایش می‏دهد. nhej یکی از مسیرهای ترمیم شکست دو رشته‏ای dna می باشد و صحت مسیر ترمیمی nhej در صحت و پایداری کروموزوم ضروری است و نقص در آنزیم‏های این مسیر، سبب آسیب بهdna و ناهنجاری‏های کروموزومی و افزایش سرطان‏زایی می‏شود. در این مطالعه اثر سدیم آرسنیت بر بیان ژن‏های آنتی‏اکسیدانت و ترمیمی در غلظت‏های 5، 10و 15 میکرومولار بررسی شده‏است. بیان ژن‏های آنتی‏اکسیدانت و ترمیمی در حضور سدیم آرسنیت کاهش یافته‏است و زمانی که سلول‏ها همزمان با سدیم آرسنیت و n استیل سیستئین تیمار شده بودند این کاهش بیان تا حدود زیادی بهبود یافته‏بود

ارتباط چند شکلی های ژنتیکی a251g sod1 و c-262t cat با خطر ابتلا به سرطان روده ی بزرگ
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم پایه 1391
  ایمان جمهیری   ایرج سعادت

مسیر های آنزیم های آنتی اکسیدان از مهمترین مسیر های درگیر در سم زدایی گونه های فعال اکسیژن (ros) و جلوگیری از صدمات ناشی از این گونه های فعال اکسیژن می باشند. بنابراین ممکن است بین چند شکلی های این ژن ها از جمله ژن سوپر اکسید دیسموتاز یک (sod1) و ژن کاتالاز با بیماری هایی که مربوط به افزایش سن هستند مانند سرطان روده بزرگ ارتباط وجود داشته باشد. در این مطالعه مورد شاهدی 204 فرد مبتلا به سرطان روده بزرگ و 239 فرد سالم به عنوان گروه کنترل انتخاب شدند. ژنوتیپ های چند شکلی تک نوکلئوتیدی sod1-251 a/g و cat–262 c/t با روش pcr-rflp مشخص گردیدند. تفاوت در فراوانی های گروه شاهد و بیمار را با آزمون کای 2 و میزان خطر، نسبت شانس (or) و فاصله اطمینان 95? (95% ci) با کمک رگرسیون لجستیک به دست آوردیم. فراوانی آلل g چند شکلی ژنتیکیsod1 در بیماران مبتلا به سرطان روده بزرگ به طور معنا داری بیشتر از گروه کنترل بود (or=1/71, 95% ci=1/09- 2/69, p=0/019 ). نتایج این مطالعه نشان می دهد که آلل g می تواند یک عامل افزایش دهنده خطر ابتلا به سرطان روده ی بزرگ باشد. همچنین در مورد ژن کاتالاز ارتباط معنی داری بین آلل t چند شکلی ژنتیکی کاتالاز و بیماری سرطان روده ی بزرگ دیده نشد (or= 0/86, 95% ci= 0/62- 1/20 , p=0/403).

ارتباط چندشکلی های ژنتیکی gstt?،gstm?،cat،xrcc? وnqo? با فراوانی شکست کروماتیدی ایجاد شده در لنفوسیت های انسان به واسطه تیمار با سدیم آرسنیت
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  فاطمه عزیزیان فارسانی   مصطفی سعادت

به طور کلی انسان در معرض آرسنیک قرار دارد. و به خوبی تثبیت شده است که ترکیبات آرسنیکی از عوامل توکسیکوژنیک و کلاستوژنیک می باشند. مطالعات پیشین تفاوت های بین فردی را برای شاخص های ژنتیکی نشان داده اند. ژن های کد کننده برای gstt1، gstm1، cat و nqo1 نقش مهمی را در حفاظت از سلول ها و بافت ها در برابر آسیب های اکسیداتیو دارند. ژن xrcc4 نقش مهمی در ترمیم شکست های دورشته ای dna از طریق مسیر nhej بر عهده دارد. هدف این مطالعه بررسی اثر چند شکلی های gstt1، gstm1، cat، nqo1 و xrcc4 روی ناهنجاری های کروموزومی ناشی از تماس با سدیم آرسنیت(1µm) در کشت سلول-های لنفوسیت می باشد. نمونه های خون از 123 مرد سالم غیرسیگاری جمع آوری شدند. ژنوتیپ چند شکلی های مطالعه شده توسط تکنیک pcr تعیین شدند. داده های ما نشان دادند که رابطه ی معناداری بین ژنوتیپ فعال و نول gstm1 و شکست کروماتیدی القاء شده توسط سدیم آرسنیت وجود دارد (3/25 در مقابل 9/22، t=-2.15، df=121، pvalue=0.033). در مورد ژن xrcc4 در طی تیمار با مایتومایسین مشاهده شد که تعداد شکست کروماتیدی در افراد دارای ژنوتیپ dd به طور معنی داری بیش از افراد دارای ژنوتیپ ii می باشد (05/0 p<). هم چنین درصد تام سلولهای حاوی ناهنجاری بدون gap در افراد دارای ژنوتیپ dd به طور معنی داری بیش از افراد دارای ژنوتیپ ii می باشد (05/0 p<).

اثر سدیم آرسنیت بر میزان بیان ژن های آنتی اکسیدان (gsto2، sod2، cat) و ژن های ترمیمی dna (xrcc4،ligase iv، xrcc5، xrcc6،xrcc7) در دودمان سلولی mcf-7
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  لیلا فلاح زاده ابرقویی   مصطفی سعادت

چکیده ندارد.

تعیین سمیت تیکوپلانین توسط سنجش mtt در دودمان سلولی cho
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  طاهره کشکولی نژاد کوهی   مصطفی سعادت

تیکوپلانین متعلق به خانواده ونکومایسین- ریستوستین از آنتی‏بیوتیک‏های گلیکوپپتیدی است که فعالیت باکتریسیدال قوی علیه باکتری‏های پاتوژنیک گرم مثبت مثل استافیلوکوکوس‏آرئوس مقاوم به متی‏سیلین، استافیلوکوکوس‏های کوآگولاز منفی، کلستریدیوم و انتروکوکوس‏ها دارد. تیکوپلانین برای درمان عفونت‏های بافت نرم و پوست، عفونت مجرای ادراری و عفونت مجرای تنفسی پایینی ، مناسب است. عفونت‏های شدید قابل درمان با این آنتی بیوتیک شامل اندوکاردیت، سپتی‏سمی، عفونت‏های مفصل و استخوان می باشد. با توجه به افزایش روز افزون مصرف آنتی‏بیوتیک تیکوپلانین بر آن شدیم تا سمیت این دارو را مورد بررسی قرار دهیم. برای این منظور با استفاده از روش mtt، اثر تیکوپلانین بر روی سه دودمان سلولی cho، jurkat و mcf-7 در غلظت‏های 200، 400، 800، 1000، 2000، 4000، 6000، 8000 و 11000 g/mlµ و در مدت زمان 24 ساعت بررسی شد. در هر سه مورد تیکوپلانین باعث افزایش رشد سلول‏ها به میزان معناداری شد. در مورد سلول‏های cho این افزایش تا غلظت g/mlµ 1000 ادامه داشت. این افزایش در مورد سلول‏های jurkat و mcf-7 به ترتیب 200 و 400 g/mlµ بود. سپس تاثیر تیکوپلانین در زمان های 42 و 72 ساعت بررسی شد و نتایج قبلی به دست آمد. نظر به اینکه تیکوپلانین در غلظت‏های بالا باعث تکثیر سلول‏ها می‏گردد، بر آن شدیم تا تاثیر این دارو را بر ترمیم زخم جلدی رت‏ها بررسی کنیم و برای این منظور از 6 رت شاهد و 6 رت تیمار استفاده شد و زخم‏هایی به ابعاد 2 در 2 سانتی متر بر ناحیه پشت آنها ایجاد شد و غلظت g/mlµ 650 به مدت 3 هفته بر ناحیه زخم ریخته شد و تفاوت معناداری بین حالت شاهد و تیمار مشاهده شد (t=4.06, df=7, p=0.005). سپس تاثیر تیکوپلانین بر کروموزوم‏های سلول‏های cho بررسی شد و از غلظت g/mlµ 1000 تیکوپلانین استفاده شد تا تاثیر غلظت تکثیردهنده دارو بر کروموزوم‏ها بررسی شود و مشاهده شد که این دارو سبب ناهنجاری‏های کروموزومی به طور معنا‏داری می شود (p<0.001، df=1،=25.00 ?? ).

مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی ساختار سه‏بعدی shp-2 و بررسی اثرجهش y62d بر ساختار آنزیم
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  سمیرا صدرپور   نوید مقرب

پروتئین‏تیروزین فسفاتاز shp-2 انسانی توسط ژن ptpn11 کد می‎‏شود و نقش مهمی در مسیر‏های مختلف پیام‏رسانی در سلول‏های انسانی ایفا می‏نماید. وقوع برخی از جهش‏های فعال‏کننده در این ژن در سلول‏های زایشی، سبب بروز اختلال در رشد و نمو و ایجاد برخی ناهنجاری‏های ژنتیکی، از جمله سندرم نونان می‏گردد که در بیماران مبتلا به این سندرم ریسک ابتلا به لوکمیا افزایش می‏یابد. shp-2 از یک دومین کاتالیتیکی (ptp) و دو دومین تنظیمی (n-sh2 و c-sh2) تشکیل شده ‏است. در این پژوهش برای بررسی تغییرات ساختاری ناشی از جهش فعال‏کننده‏ی تیروزین 62 به آسپارتیک‏اسید (y62d)، ساختارهای آنزیم shp-2 طبیعی و جهش‏یافته‏ی y62d ، با استفاده از ساختار کریستالوگرافی ثبت شده در بانک داده‏ی پروتئین (کدبانک 2shp)، مدل‏سازی و در بازه‏ی زمانی 60 نانوثانیه، شبیه‏سازی دینامیک مولکولی گردید. نتایج مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی نشان داد که در این جهش، تغییرات ساختاری قابل ملاحظه ای در دو دومین ptp و n-sh2 روی می‏دهد. درنواحی بر‏همکنش‏ بین دو دومین، فاصله‏ بین جایگاه کاتالیتیک در دومین ptp و لوپ بلوکه کننده در دومین n-sh2 در پروتئین جهش‏یافته‏ افزایش یافته است؛ ازاینرو انتظار می‏رود در مدل جهش‏یافته دسترسی به جایگاه کاتالیتیکی آنزیم برای سوبسترا و نیز پیشرفت پروتئین به سمت فعال‏شدن تسهیل ‏گردد. همچنین در ساختار طبیعی پروتئین، آسپارتیک‏اسید 61 با سیستئین 459، که در جایگاه فعال آنزیم واقع شده است، پیوند هیدروژنی می‏دهد و مانع فعالیت کاتالیتیکی سیستئین 459 می‏گردد. نتایج مطالعه‏ی ما نشان داد بین باقی‏مانده‏های‏ ‏اسید‏آمینه‏ا‏ی آسپارتیک‏اسید 61 و آرژنین 465 در شکل جهش‏یافته پل‏نمکی تشکیل شده است. به علت درگیر شدن آسپارتیک‏اسید 61 درایجاد پل‏نمکی، انتظار می‏رود برهمکنش آن با سیستئین 459 کاهش یابد. همچنین پس از جهش، دو لوپ‏ lf و fh در دومین ptp از یکدیگر فاصله می‏‏گیرند. این تغییر می‏تواند تبدیل فرم غیر‏فعال به فعال پروتئین را آسان‏تر نماید. نتایج مطالعه‏ی حاضر نشان می‏دهد علاوه بر تغییرات ساختاری ایجاد شده در جایگاه فعال آنزیم، بر اثر این جهش، فاصله‏ی بین دو لوپ ef و bg واقع در دومین n-sh2 در مدل جهش‏یافته کاهش یافته‏است. این تغییر ممکن است ورود لیگاند به این ناحیه دشوارتر کند. درکل، با توجه به تغییرات ساختاری ایجاد شده بر اثر جهش در دومین ptp و درنواحی بر‏همکنش‏ بین دو دومین انتظار می‏رود برهمکنش بین دو دومین ptp و n-sh2 کاهش‏یافته و شکل‏گیری فرم فعال پروتئین تسهیل گردد.

ارتباط چند شکلی های ژنتیکی cat c-262t و nqo1 c609t با خطر ابتلا به آب مروارید
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  نرجس زارعی   ایرج سعادت

آب مروارید، یک بیماری چند عاملی است ، که به دلیل از بین رفتن شفافیت لنز چشم ایجاد می شود. شواهد زیادی وجود دارد دال بر اینکه آسیب اکسیداتیو به عنوان فاکتور مهم در پیدایش و پیشرفت تعداد زیادی از بیماری ها از جمله آب مروارید نقش دارد. آنزیم های nqo1 و کاتالاز ( cat) از جمله آنزیم های آنتی اکسیدان هستند، که از سلولها در برابر آسیب اکسیداتیو محافظت می کنند. هدف از این مطالعه ، بررسی ارتباط ژنتیکی چند شکلی ژنهای nqo1 c609t و cat c-262t با خطر ابتلا به آب مروارید می باشد. در این مطالعه ی مورد- شاهدی ،190 فرد سالم به عنوان گروه شاهد و 190 فرد مبتلا به آب مروارید شرکت داشتند. از روش pcr-rflp جهت تعیین ژنوتیپ چند شکلی های ژنتیکی استفاده کردیم. نتایج حاصل از بررسی ژن nqo1 نشان می دهد که ژنوتیپ ct و ترکیب ژنوتیپ های ct/tt از چند شکلی ژنتیکی nqo1 c609t ریسک ابتلا به آب مروارید را افزایش می دهند (ct vs. cc: or = 1.61, 95% ci = 1.02-2.52, p value= 0.038) و (ct/tt vs. cc: or = 1.56, 95%ci =1.02-2.4, p value= 0.04). اما از نظر آماری ارتباط معنی داری بین چند شکلی ژنتیکی cat c-262t و آب مروارید مشاهده نشد.

مطالعه ساختار و فعالیت آمیلوئیدی کریستالین های قندی و غیر قندی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1391
  سارا امیرغفران   رضا یوسفی

آلفا کریستالین به عنوان چاپرون اصلی لنز مسئول حفظ شفافیت لنز و جلوگیری از نامحلول شدن، توده ای شدن و رسوب پروتئین ها روی لنز و به تعویق انداختن ابتلا به بیماری آب مروارید است. در پژوهش های قبلی گزارش شده است که توده ای شدن و تشکیل فیبر آمیلوئیدیِ کریستالین های لنز نقش اساسی در پیدایش عارضه ی آب مروارید دارد و همچنین ارتباط نزدیکی بین طیف وسیعی از بیماری های چشمی با قندی شدن غیر آنزیمی این پروتئین ها گزارش شده است. در این پژوهش نقش قندی شدن غیر آنزیمی بر ساختار، توده ای شدن و فیبریلاسیون پروتئین های کریستالین لنز چشم گاو بررسی شد. هدف اصلی این پژوهش مقایسه تمایل پروتئین های محلول لنز و آلفا کریستالینِ طبیعی و قندی برای توده ای شدن و تشکیل فیبر آمیلوئیدی بود. اِلقای فیبر آمیلوئید به کمک استرس فیزیکی و شیمیایی انجام شد. در این مطالعه از روش های مختلف طیف سنجی جذبی، فلورسانس و الکتروفورز ژلی برای مطالعه تغییرات ساختاری پروتئین استفاده شد. قندی شدن غیر آنزیمی کریستالین های لنز به وسیله الکتروفورز ژلی، آزمون opa و فلورسامین تایید شد. با کمک روش الکتروفورز ژلی وجود گونه های مولکولی با وزن بالا در کریستالین های قندی نشان داده شد. همچنین با مطالعه الکتروفورتیک در شرایط غیر احیایی و احیایی نقش اتصالات عرضی دی سولفیدی در توده ای شدن کریستالین های قندی و غیر قندی مشخص شد. نتایج مطالعه طیف جذبی- فرابنفش نشان داد که کریستالین های قندی به طور قابل توجهی در برابر توده ای شدن پس از استرس شیمیایی و فیزیکی مقاومت می کنند. نتایج مطالعه فلورسانس نشان داد که پس از القای فیبریلاسیون، میزان سطوح آبگریز نمونه های مختلف پروتئینی افزایش می یابد. افزایش سطوح آبگریز ارتباط مستقیمی با تمایل پروتئین به توده ای شدن و تشکیل فیبر آمیلوئیدی دارد. با استفاده از خاصیت جذبی اسپکتروسکوپی کنگورد و نشر فلورسانس تیوفلاوین-t تشکیل فیبر آمیلوئیدی پس از القای فیبریلاسیون توسط نمونه های مختلف پروتئینی در حضور واسرشته کننده های شیمیایی بررسی شد. این نتایج حاکی از تمایل کمتر کریستالین های قندی به تشکیل فیبر آمیلوئیدی بود. به طور کلی نتایج حاصل از این پژوهش نشان می دهد که قندی شدن غیر آنزیمی کریستالین ها منجر به پایداری ساختاری آن ها و به تَبَع آن مقاومت بیشتر نسبت به توده ای شدن و تشکیل فیبر آمیلوئیدی در حضور استرس های شیمیایی و فیزیکی می شود. این یافته در ظاهر بر خلاف شواهد متعددی است که بیانگر ارتباط بین قندی شدن کریستالین و عارضه آب مروارید در بیماران دیابتی می باشد، اما این تناقض با توجه به کاهش فعالیت چاپرونی آلفا کریستالین قندی (قبلا گزارش شده است) و یا با تولید گونه های فعال اکسیژنی به وسیله ی شکل قندی این پروتئین یا هر دو قابل توجیه است.

بررسی ارتباط بین چند شکلی های ژنتیکی حذف و اضافه اینترون 3 ژن xrcc4و c-262t ژن کاتالاز با خطر ابتلا به سرطان پستان
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1392
  شکوفه سعادت   مصطفی سعادت

بررسی ارتباط بین چند شکلی های ژنتیکی حذف و اضافه اینترون 3 ژن xrcc4 و c-262t ژن کاتالاز با خطر ابتلا به سرطان پستان شکست های دو رشته ای dna توسط سیستم ترمیمی که شامل دو مسیر نوترکیبی همولوگی (hr) و نوترکیبی غیر همولوگی (nhej) می باشد، ترمیم می شوند. چندشکلی های تک نوکلئوتیدی (snp) در ژن های دخیل در ترمیم dna می تواند احتمال ابتلا به انواع سرطان را تغییر دهد. از آنجاییکه محصول ژن xrcc4 به عنوان عضو مهمی از مسیر nhej مطرح است، در این مطالعه به بررسی حذف و اضافه در اینترون 3 ژن xrcc4 (rs28360071) با خطر ابتلا به سرطان پستان پرداختیم. از طرف دیگر با توجه به اینکه مسیرهای آنزیم های آنتی اکسیدان از مهمترین مسیرهای درگیر در سم زدایی گونه های فعال اکسیژن و صدمات ناشی از این گونه های فعال اکسیژن می باشند، ممکن است بین چندشکلی های این ژن ها از جمله ژن کاتالاز با خطر ابتلا به انواع سرطان ها ارتباط وجود داشته باشد. بنابراین در این مطالعه چندشکلی c-262t ژن کاتالاز (rs1001179) را با خطر ابتلا به سرطان پستان مورد بررسی قرار دادیم. در این مطالعه مورد-شاهدی 407 نفر زن مبتلا به سرطان پستان و 395 نفر زن سالم شرکت داشتند. از روش pcr جهت تعیین ژنوتیپ چندشکلی حذف و اضافه اینترون 3 ژن xrcc4 و از روش pcr-rflp جهت تعیین ژنوتیپ چندشکلی c-262t ژن کاتالاز استفاده شد. نتایج ما حاکی از آن بود که هیچگونه ارتباط معنی داری بین آلل d چندشکلی حذف و اضافه اینترون 3 ژن xrcc4 (or=1.10, 95%ci=0.90-1.34, p-value=0.330) و آلل t چندشکلی c-262t ژن کاتالاز (or=0.86, 95%ci=0.67-1.09, p-value=0.220) با خطر ابتلا به سرطان پستان وجود ندارد.

بررسی فراوانی چند شکلی های ژنتیکی gstm1 و gstt1 در جمعیت های ترکمن، کرد، سیستانی و بلوچ
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1392
  غلامرضا ناصری   مصطفی سعادت

گلوتاتیون s-ترانسفراز خانواده خیلی بزرگی از آنزیم¬های سم¬زدایی بوده و نقش حیاتی را در فاز دوم بیوترانسفورماسیون بسیاری از زنوبیوتیک ها، داروها و عوامل سرطان¬زا ایفاء می¬کنند. چندشکلی¬های ژنتیکی این آنزیم¬ها ممکن است استعداد افراد به ابتلاء به بیماری¬های ناشی از اثرات مخرب متابولیت¬های اکسیداتیو را، تحت تاثیر قرار دهد. مطالعات گذشته در میان جمعیت¬های مختلف نشان داده¬اند که فراوانی حذف شدگی¬های هموزیگوت (ژنوتیپ null) در ژن¬های gstm1 و gstt1 در این جمعیت ها اختلاف معنی¬داری نسبت به یکدیگر دارد. به همین دلیل، در مطالعه حاضر به منظور شناخت بهتر هتروژنیسیته اقوام مختلف ایرانی، فراوانی ژنوتیپ null این ژن¬ها در میان چهار قوم بلوچ، سیستانی، کرد و ترکمن بررسی گردید. برای این منظور، 168 فرد سالم با قومیت بلوچ، 152 نفر سیستانی، 200 نفر کرد و 200 نفر ترکمن جهت بررسی فراوانی چند شکلی¬های ژنتیکی ژن های gstm1 و gstt1 به روش multiplex pcr مورد ارزیابی قرار گرفتند. تفاوت معنی¬داری میان جنسیت افراد با توزیع فراوانی ژنوتیپ null این ژن¬ها در هیچیک از قومیت¬های مورد مطالعه مشاهده نگردید. نتایج این مطالعه نشان داد که فراوانی ژنوتیپ null ژن gstm1 در جمعیت¬های بلوچ 50%، سیستانی 51/3%، کرد 56% و ترکمن 53% بوده و فراوانی ژنوتیپ null ژن gstt1 در در جمعیت های بلوچ 8/20%، سیستانی 17/8%، کرد 18/5% و ترکمن 23% بدست آمد که در محدوده فراوانی¬های گزارش شده در نژاد¬های هندواروپایی و آسیایی می-باشد. آنالیز آماری مربع کای هیچگونه تفاوت معنی¬داری میان توزیع فراوانی¬ ژنوتیپی چندشکلی null و present ژن¬های gstm1 (χ2=1.48, df = 1, p = 0.685) و gstt1 (χ2 = 1.936, df = 1, p = 0.586) در جمعیت¬های مورد مطالعه نشان نداد.

بررسی ارتباط چندشکلی ژنتیکی vntr در پروموتر xrcc5 با ریسک ابتلا به سرطان معده
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم پایه 1393
  سمیرا پاشایی   مصطفی سعادت

آسیب های وارده به dna می تواند نواقصی را در رونوشت rna و پروتئین های ترجمه شده ی آنها بر جای گذارد که باید ترمیم گردد. یکی از این آسیب ها شکست های دو رشته ای dna است که سیستم ترمیمی این نوع شکست، شامل دو مسیرnonhomologous end joining (nhej) و homologous recombination (hr) می باشد. هر گونه تغییرات مثل چند شکلی های ژنتیکی در این دو مسیر ترمیمی می تواند منجر به سرطان شود. پروتئین های درگیر در مسیر nhej شامل xrcc5(ku80)، xrcc6(ku70)، xrcc4، dna-pk و dna ligase iv می باشند که نقص در این پروتئین ها منجر به از بین رفتن پایداری ژنومی می شود. هدف از این مطالعه، بررسی ارتباط چند شکلی vntr در ژن xrcc5 با خطر ابتلا به سرطان معده می باشد. این مطالعه شامل 159 نفر بیمار مبتلا به سرطان معده و 242 نفر سالم می باشد. از روش pcr برای تعیین ژنوتیپ چند شکلی vntr در ژن xrcc5 استفاده شد. تفاوت در فراوانی های گروه شاهد و بیمار را با آزمون کای2 و میزان خطر، نسبت شانس (or) و فاصله اطمینان 95% را با کمک رگرسیون لجستیک بدست آوردیم. نتایج ما در این مطالعه نشان داد که ارتباط معنی داری بین ژنوتیپ های این ژن و خطر ابتلا به سرطان معده وجود ندارد.

بررسی ارتباط چندشکلی c-262t ژن catبا خطر ابتلا به اسکیزوفرنیا
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1392
  سمانه صفایی   مصطفی سعادت

اسکیزوفرنی یک بیماری چند عاملی و پیچیده روانی است که هنوز به خوبی درک نشده است. آسیب اکسیداتیو به عنوان یک فاکتور مهم در پیداش و پیشرفت تعداد زیادی از بیماری ها از جمله اسکیزوفرنیا نقش دارد. آنزیم کاتالاز (cat) از جمله آنزیم های آنتی اکسیدان است، که از سلولها در برابر آسیب اکسیداتیو محافظت می کند. هدف از این مطالعه، بررسی ارتباط چند شکلی ژنتیکی cat c-262t با خطر ابتلا به اسکیزوفرنیا می باشد. در این مطالعه ی مورد- شاهدی، 363 فرد سالم به عنوان گروه شاهد و 363 فرد مبتلا به اسکیزوفرنیا حضور داشتند. پس از استخراج dna از نمونه خون این افراد از روش pcr-rflp و سپس از آنزیم محدود کننده ecorvجهت تعیین ژنوتیپ چند شکلی ژنتیکی cat c-262t استفاده کردیم. نتایج حاصل از بررسی ژن cat با استفاده از نرم افزار آماری16 spss نشان می دهد، ژنوتیپ های tt (29/2or =، 92/7-66/0= 95%ci، 189/0p =) و ct (89/0or =، 61/1-49/0= ci، 707/0 = p) در مقایسه با ژنوتیپ cc رابطه معناداری با بیماری اسکیزوفرنی ندارند.

فراوانی چند شکلی ژنتیکی ژن xrcc5 در سه جمعیت تبریز، یاسوج و ابرکوه
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم پایه 1392
  فاطمه قاسمی نیری   مصطفی سعادت

ایران کشوری در جنوب غربی آسیا است که در منطقه خاورمیانه قرار دارد. جمعیت ایران از اقوام زیادی از جمله: فارس، آذری، کرد، لر، بختیاری، بلوچ، مازندرانی، گیلک، قشقایی، عرب، لک، تالشی، ترکمن، خلج، آشوری، کلدانی، مندایی(صائبی)، تات، گرجی، سیستانی، ارمنی، و یهودی تشکیل شده است. در این مطالعه 697 نفر از سه جمعیت آذری تبریز ( شامل287 مرد و 10 زن)، لر یاسوج ( 191 مرد و 9 زن) و ابرکوه یزد (100 مرد و 100 زن) شرکت کردند. ژن xrcc5 که در ترمیم dnaدر مسیر non-homologous end joining (nhej) نقش دارد، به همراه xrcc6 به شکست دو رشته ای dna متصل شده و با فعال کردن پروتئین های دیگر منجر به ترمیم آن می شود. این ژن دارای چند شکلی های متعددی است که در این مطالعه، چند شکلی ژنتیکیvntr( rs6147172) در ناحیه پروموتر ژن xrcc5 را بررسی کردیم. نتایج حاصل از بررسی برای آلل 0r در جمعیت های تبریز، یاسوج و ابرکوه به ترتیب 75/5، 9 و 25/5 درصد می باشد. این میزان برای آلل 1r به ترتیب 32/48، 75/51، 75/46 درصد به دست آمد. فراوانی آلل 2r و 3r برای جمعیت تبریز به ترتیب 12/45 و 84/0درصد، برای جمعیت یاسوج 38 و 25/1 درصد و برای جمعیت ابرکوه 5/46 و 5/1 محاسبه شد. هم چنین در سه جمعیت بین فراوانی ژنوتیپی تفاوت معنی داری مشاهده نشد (136/0p= ،16 df= ،23/22?2=).

ارتباط چندشکلی های ژنتیکی cat c-262tو sod1 a251g با خطر ابتلاء به سرطان معده
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1392
  شیوا ابراهیم پور بروجنی   ایرج سعادت

استرس های اکسیداتیو با پیشرفت بسیاری از بیماری ها رابطه ی مستقیم دارند. گونه های فعال اکسیژن (ros) بسیار ناپایدارند و باعث آسیب ماکرومولکول ها از طریق اکسیداسیون می شوند. استرس اکسیداتیو می تواند در شرایط ازدیاد غلظت ros و کمبود ظرفیت آنتی اکسیدانی بدن اتفاق افتد. مسیرهای آنزیم های آنتی اکسیدان از مهم ترین مسیرهای درگیر در سم زدایی گونه های فعال اکسیژن (ros) و جلوگیری از صدمات ناشی از این گونه های فعال اکسیژن می باشند. ژن های کاتالاز و سوپر اکسید دیسموتاز1 از جمله مهمترین مکانیسم های دفاعی در برابر استرس های اکسیداتیو می باشند. بنابراین ممکن است بین چند شکلی های این ژن ها با انواع بیماری ها مانند سرطان معده ارتباط وجود داشته باشد.. دراین مطالعه مورد شاهدی 160 فرد مبتلا به سرطان معده و241 فرد سالم به عنوان گروه کنترل انتخاب شدند. ژنوتیپ های چند شکلی تک نوکلئوتیدی cat c-262t و sod1 a251g با روش pcr-rflp مشخص گردیدند. تفاوت در فراوانی های گروه شاهد و بیمار را با آزمون کای2 و میزان خطر، نسبت شانس (or) و فاصله اطمینان95% با کمک رگرسیون لجستیک به دست آوردیم. پس ازانجام آنالیز ارتباط معناداری بین چند شکلی ژنتیکیcat c-262t و سرطان معده مشاهده نشد (304/0= p ،23/1-52/0= ci 95% ،80/0= or). اما رابطه ی معناداری با ژنوتیپ ag (026/0= p ،91/0-24/0= ci 95% ،47/0= or) و ag+gg (021/0= p ،88/0-23/0= ci 95% ،45/0= or) ژن sod1و سرطان معده مشاهده شد بطوری که آلل g خطر ابتلاء به سرطان معده را کاهش می دهد (021/0= p ،89/0-24/0= ci 95% ،46/0= or).

مطالعه اثرِ هموسیستئین تیولاکتون بر ساختار و فیبریلاسیون کریستالین گامای استیله و غیراستیله
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1392
  شهرزاد حجاری   رضا یوسفی

پروتئین های کریستالینی که نیمه عمر نسبتاً طولانی دارند در روند پیری متحمل تغییرات شیمیایی وسیعی می شوند. این تغییرات در نهایت هم ساختار و هم برهمکنش ظریف بین مولکولی این پروتئین ها را شدیداً متاثر می کند. پیامد نهایی تغییرات فوق الذکر ممکن است به ایجاد ساختارهای توده ای و کاهش تدریجی شفافیت عدسی و در نتیجه به بروز عارضه آب مروارید منجر شود. هموسیستئین تیولاکتون که یک تیواستر درون مولکولی فوق العاده واکنش پذیر است در بدن از پیش ساز آمینواسید هموسیستئین ایجاد می شود. مطالعات متعددی پیشنهاد می کند که بین غلظت بالای هموسیستئین و طیف وسیعی از بیماری های چشمی ارتباط وجود دارد. در این پژوهش اثر هموسیستئین تیولاکتون بر ساختار و ویژگی های آمیلوئیدی کریستالین گامای استیله و غیراستیله مطالعه می شود. برای این منظور از روش های مختلف اسپکتروسکوپی (مرئی- فرابنفش، دو رنگ نمای دورانی و فلورسانس)، الکتروفورز ژلی، مطالعه کشش سطحی و مطالعه میکروسکوپی استفاده شد. مطالعات اسپکتروسکوپی مرئی - فرابنفش و فلورسانس پیشنهاد می کند که کریستالین گامای استیله در مقایسه با همتای غیراستیله اش به میزان کمتری متحمل تغییرات ساختاری در حضور هموسیستئین تیولاکتون می شود. مطالعات دو رنگ نمای دورانی نشان می دهد که از محتوای مارپیچ آلفای هر دو نمونه استیله و غیراستیله کریستالین گاما در حضور هموسیستئین تیولاکتون اندکی کاسته و همزمان به محتوای صفحات بتا و پیچه های نامنظم پروتئین افزوده می شود. در حالی که کشش سطحی نمونه ی غیراستیله ی کریستالین گاما در حضور هموسیستئین تیولاکتون به طور معناداری افزایش پیدا می کند، کشش سطحی نمونه ی استیله ی این پروتئین در حضور این تیواستر حلقوی تغییر چندانی نشان نمی دهد. مطالعات توده ای شدن پروتئین کریستالین گامای استیله و غیراستیله پیشنهاد می کند که شکل استیله این ترکیب در برابر فرآیند توده ای شدن مقاومت بیشتری در قیاس با نوع غیراستیله نشان می دهد. همچنین نتایج مطالعات اسپکتروسکوپی و میکروسکوپی دو شکل استیله و غیراستیله پیشنهاد می کند که در حضور هموسیستئین تیولاکتون شکل استیله این پروتئین تمایل کمتری برای حضور در ساختارهای فیبری دارد. به طور کلی نتایج این مطالعه پیشنهاد می کند که استیله شدن می تواند به عنوان یک سازوکار حفاظتی در مقابل تاثیرات مخرب ساختاری هموسیستئین تیولاکتون بر روی کریستالین گاما عمل کند. از اینرو مصرف مستمر آسپیرین توسط افراد مسن احتمالاً می تواند در جلوگیری از کدورت عدسی در شرایط هایپرهموسیستئینمیا (غلظت بالای هموسیستئین خون) موثر باشد.

بررسی ارتباط چند شکلیهای ژنتیکی ژن های xrcc4 و xrcc5 با خطر ابتلا به اختلال دو قطبی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1392
  محبوبه کاظمی نوقابی   مصطفی سعادت

اختلال دوقطبی یک ناهنجاری روانی جدی است که جزء مهمترین عوامل ناتوانی در میان بیماری های روانی محسوب می شود و حدود یک درصد از جمعیت را تحت تاثیر قرار می دهد. استرس اکسیداتیو در فیزیولوژی آسیب بیماران مبتلا به اختلال دوقطبی نقش مهمی بازی می کند و مطالعات از افزایش آسیب های dna ناشی از این استرس در این بیماران خبر می دهند. xrcc4 و xrcc5 پروتئین های درگیر در مسیر ترمیمی non-homologous end joining (nhej) هستند که نقش مهمی در ترمیم شکست های دو رشته ای dna ایفا می کنند و ارتباط بعضی از چندشکلی های مختلف این ژن ها با خطر ابتلا به سرطان های مختلف مورد بررسی قرار گرفته است. هدف مطالعه ی ما بررسی چندشکلی(rs28360071) insertion/deletion در اینترون 3 ژن xrcc4 و چندشکلی (rs6917977) variable number of tandem repeats (vntr) در پروموتر ژن xrcc5 و خطر ابتلا به اختلال دوقطبی است. این مطالعه ی مورد- شاهدی از 228 بیمار مبتلا و 229 فرد سالم تشکیل شده که تعیین ژنوتیپ آن ها به روش pcr معمولی انجام شد. تحلیل آماری نتایج هیچ گونه اختلاف معناداری بین توزیع ژنوتیپ های چندشکلی insertion/deletion در ژن xrcc4 بین بیماران و افراد گروه کنترل نشان نداد. همچنین ارتباط معناداری میان ژنوتیپ های چندشکلی vntr در ژن xrcc5 و خطر ابتلا به اختلال دوقطبی مشاهده نشد.

بررسی ارتباط چند شکلی ژنتیکی ژنxrcc1 و اسکیزوفرنیا
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشکده علوم پایه 1385
  نجمیه پاکیاری   مصطفی سعادت

چکیده ندارد.

بررسی ارتباط چند شکلی های ژنتیکی gstml،gsttl و gsto2 با بهره هوشی دانش آموزان شهرستان فریدونشهر
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1387
  لاله رفیعی   مصطفی سعادت

چکیده ندارد.

بررسی تاثیرات میدان الکترومغناطیس بر غلظت پلاسمایی کورتیکواسترون و تستوسترون و بیان ژن gstt1 در بیضه موش صحرایی نر
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1387
  مینا افهمی   مصطفی سعادت

چکیده ندارد.

بررسی رابطه چند شکلی های ژنتیکی gstm1،gsto2 و gstt1 و استعداد ابتلا به سرطان های سینه، معده و کلورکتال
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم 1387
  محمد مسعودی   مصطفی سعادت

چکیده ندارد.