نام پژوهشگر: فرزانه نیکوخواه

الگوهای زمانی و مکانی برخی آلودگیهای معدنی و بیولوژیکی رودخانه زایندهرود
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهرکرد - دانشکده کشاورزی 1392
  حامد محمودی کهنی   جهانگرد محمدی

امروزه همگام با افزایش جمعیت و فعالیت های بشری، مسائل مربوط به آب نیز مورد توجه فراوان قرار گرفته است. به طوری که مسائل مربوط به بحران و مدیریت آب از دیدگاه سازمان ملل پس از مشکل فزونی جمعیت، به عنوان دومین مسأله ی اساسی جهان شناخته شده است. حوضه آبخیز رودخانه زاینده رود در ایران مرکزی جزء حوضههای مهم و دیرینه می باشد که آب این رودخانه برای اهداف کشـاورزی، صـنعتی و آب آشامیدنی استفاده می شود. رشد صنایع در حاشیه رودخانه و وجود مناطق مسکونی در کنار رودخانه منجر به تخلیه فاضلاب آن ها به صورت مستقیم یا غیر مستقیم به رودخانه می شود. از این رو اندازه گیری میزان آلودگی در این رودخانه و یافتن الگوی مناسب از توزیع آلودگی می تواند ما را در جلوگیری یا کاهش مشکلات زیست محیطی یاری کند. جهت انجام این تحقیق نمونه هایی از 10 ایستگاه در طول رودخانه زاینده رود حد فاصل سد زاینده رود تا زرین شهر در شش نوبت در ماه های تیر، شهریور، آبان، دی و اسفند در سال1390 و اردیبهشت ‏1391 نمونه‏برداری شد. آنالیز‏های شیمیائی مربوط به ph، هدایت الکتریکی، عناصر مغذی نیترات و فسفر، عناصر سنگین (سرب، روی، مس و کادمیوم) در آب و رسوب و همچنین شاخص های میکروبی نمونه ها تعیین گردید. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که اکثر پارامتر‏های اندازه‏گیری شده به جز کلیفرم مدفوعی، کادمیوم آب، روی و مس رسوبات در دوره های زمانی مختلف تفاوت معنی داری داشتند (p<0.01). همچنین همه ی پارامتر ها به استثنای کادمیوم رسوب در مکان (ایستگاه های مختلف) دارای تفاوت معنی-دار بودند (p<0.01). نتایج مقایسه میانگین پارامترهای مختلف مربوط به دوره های زمانی نشان داد که بیشترین مقدار پارامتر‏های ph، هدایت الکتریکی، نیترات و کلیفرم مدفوعی در تیرماه، فسفر در شهریور، سرب، کادمیوم و روی آب در آبان، روی رسوب در دی ماه، سرب، کادمیوم و مس رسوب در اردیبهشت ماه بودند. علاوه بر آن، نتایج مقایسه میانگین مکانی نشان داد که ایستگاه مورکان بیشترین میزان ph، بیشترین مقدار سرب، مس و روی به ترتیب در رسوب ایستگاه پل کله، چلیوان و سد تنظیمی رخ داده است. بقیه پارامترها در ایستگاه زرین شهر بیشترین مقدار را داشتند. بررسی منابع آلاینده نشان داد که در بالادست رودخانه زاینده رود منابع آلوده کننده محدود به رواناب سطحی و زه آب های حاصل از اراضی زراعی بود. بالا بودن آلاینده ها در ایستگاه‏های پایانی رودخانه (ایستگاه پل کله و زرین شهر) مربوط به وجود مراکز شهری و کارخانجات صنعتی بود. البته مقادیر هیچ یک از پارامتر ها از مقدار استاندارد تعیین شده برای آب های آشامیدنی ایران تجاوز نکرد.

بررسی اثرات ضدقارچی پروتئین حاصل از ژن sd2mod-licbm2 تولید شده در گیاه لوبیا
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهرکرد - دانشکده کشاورزی 1392
  فاطمه شفیع زاده   بهروز شیران

یکی از مشکلات بزرگ تولید محصولات کشاورزی بیماری?های گیاهی می?باشند که از گذشته دور همواره بر کمیت و کیفیت تغذیه انسان?ها اثر گذار بوده و باعث خسارت اقتصادی، زیست محیطی و سیاسی اجتماعی فراوانی شده اند.?????? بیماری های گیاهی ناشی از قارچ ها از عمده عوامل کاهش کیفیت و ایمنی محصولات کشاورزی هستند، که کنترل موثر و با دوام این نوع پاتوژن محصولات کشاورزی، تبدیل به یکی از چالش های عمده در کشاورزی مدرن شده است. دفنزین ها ی گیاهی پروتئین ها ی غنی از سیستئین هستند که یک نقش مهم دفاعی در مقابل پاتوژن ها ی گیاهی بازی می کنند. و به دلیل فعالیت ضد قارچی گسترده خود گزینه جذاب و امیدوار کننده هستند تا در بیوتکنولوژی کشاورزی مورد استفاده قرار گیرد. ???ساختار آمینواسیدی و فعالیت ها ی زیستی دفنزین ها از تنوع زیادی برخوردار می باشند و تفاوت ها ی کوچک در توالی آمینواسیدی، ساختار و تاثیر آن ها را در برابر پاتوژن ها دگرگون می سازد. ژنsd2mod یک ژن نوترکیب است، که بر اساس ژن دفنزین آفتابگردان sd2 ساخته شده است و در آن تغییراتی بر اساس توالی ژن دفنزین اسفناج (so-d2) اعمال شده است. در این مطالعه پلاسمید حامل ژن هیبرید از طریق تکنیک اگرواینفیلتریشن، تحت کنترل عناصر رونویسی متفاوت و در تیمارهای برگ سالم و برگ خراش داده شده و برگ اولیه(مسن) و برگ ثانویه (جوان) به داخل برگ های گیاه لوبیا انتقال داده شد و بعد از سه روز پروتئین تولید شده در برگ استخراج و اندازه گیری گردید. بهترین بیان در برگ خراش دیده جوان به علت مناسب بودن بافت برای اگرواینفیلتریشن و تحریک تولید فنول های محرک ژن های افزایش دهنده بیان در اثر زخم مشاهده شد. سپس اثر ضد میکروبی پروتئین سنتز شده از ژن sd2mod تحت سیستم یوکاریوتی بر روی عوامل بیماری زای گیاهی در محیط in vitro مورد بررسی قرار گرفت. اثر ضد میکروبی پروتئین سنتز شده از ژن sd2mod-licbm2 تحت سیستم یوکاریوتی بر روی قارچ های بیماریزای گیاهی fusarium oxysporum, fusarium solani, fusarium graminarum به خوبی مشاهده شد. پروتئین sdmod به خوبی اثر بازدارندگی را بر روی رشد هیف قارچ های گونه کلتوتریکوم شاملcolletotrichum acutatum و colletotrichum gloeosporioides نشان داد که حضور موثر پروتئین دفنزین را در ایجاد مقاومت قوی به این قارچ ها اثبات می کند. اثر ضد قارچی دفنزین sdmod با تغییر در مورفولوژی هیف قارچ fusarium graminarum که عبارت از تورم نوک هیف قارچ و اختلال هیفی و اسپور است همراه بود. در تطابق توالی اسیدآمینه ای دفنزین sd2mod با دفنزین های دیگر حضور اسید آمینه لیزین در ناحیه ی موثر ضد قارچی هسته موتیف ?، علت ایجاد تغییرات موفولوژی هیفی شناخته شد. این تحقیق از ژن دستکاری شده licbm2 به عنوان ژن مارکر استفاده شد همچنین اثرات ضد میکروبی برای این پروتئین بر روی برخی قارچ های مذکور مشاهد گردید.????????????????????????

بررسی اثرات ضدباکتریایی پروتئین دفنزین حاصل از بیان موقت ژن در گیاه لوبیا
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهرکرد - دانشکده کشاورزی 1392
  زهرا نوراله نجف آبادی   ندا میراخورلی

باکتری ها از جمله فراوان ترین موجودات روی کره زمین هستند و عامل بسیاری از بیماری ها در انسان، حیوانات و گیاهان به شمار می آیند. با توجه به اهمیت آن ها در ایجاد بیماری های انسان و خسارات محصولات کشاورزی و دامپروری، مبارزه با این عوامل از اهمیت فراوانی برخوردار است. امروزه راهکارهای مختلفی از جمله استفاده از روش های مهندسی ژنتیک و انتقال ژن های مقاومت یا ضدمیکروبی برای مقابله با این بیماری ها استفاده می شود. از مهمترین گروه پپتیدهای ضدمیکروبی می توان به دفنزین ها اشاره نمود. این پپتیدهای کوچک انواع مختلفی هستند که قادرند در برابر طیف وسیعی از میکروب ها از جمله قارچ، باکتری، ویروس و مخمر مقابله کنند. در این مطالعه از ژن sdmod که نوعی دفنزین نوترکیب است استفاده شد. این ژن بر اساس ساختار دفنزین های موجود در طبیعت به منظور افزایش طیف فعالیت ضدمیکروبی ساخته شده است و همراه با ژن نشانگر licbm2 در ساختار پلاسمیدی pbisn1-in کلون شده است. جهت بررسی خواص ضدمیکروبی این ژن بر روی باکتری های بیماری زا، اثرات ضدباکتریایی آن بر روی چند گونه باکتری بیماری زای گیاهی، مانند pseudomonas syringae pv. syringae و xanthomonas axonopodis pv phaseoli، و جانوری، مانند escherichia. coli، staphylococcus. aureus، bacillus. cereus و pseudomonas. aeroginisa، بررسی شد. به این منظور این ژن بوسیله روش اگرواینفیلتریشن با استفاده از باکتری آگروباکتریوم به طور موقت در گیاه لوبیا بیان و سپس پروتئین حاصل از آن استخراج و اثرات ضدباکتریایی آن با استفاده از روش انتشار از دیسک و چاهک، در غلظت ها و زمان های مختلف رشد باکتری، بررسی گردید. نتایج حاصل از تست انتشار دیسک، نشان داد که پروتئین دفنزین حاصل از بیان ژن sdmod به خوبی بر روی باکتری های مورد آزمایش اثرات بازدارندگی دارد. این اثرات در زمان های اولیه پس از کشت باکتری بیشتر و به مرور زمان کاهش می یابد به طوریکه پس از 24 ساعت به اتمام رسیده و باکتری به رشد خود ادامه می دهد. این اثر در میان باکتری های جانوری، بر روی گروه باکتری های گرم مثبت، از جمله باکتری s.aureus، و در میان باکتری های بیماری زای گیاهی بر روی باکتری x.axonopodis pv phaseoli (m-) بیشتر می باشد. نتایج حاصل از بررسی غلظت های مختلف پروتئین، با استفاده از تست انتشار از چاهک، بر روی رشد باکتری نشان می دهد غلظت های بالاتر، اثرات ضدباکتریایی بیشتری را به همراه دارد. در این آزمایشات این اثرات در باکتری s.aureus حتی تا پس از 24 ساعت نیز ادامه دارد و به خوبی از رشد باکتری جلوگیری می کند. در میان باکتری های بیماری زای گیاهی نیز پروتئین بر روی دو باکتری xanthomonas(m-) و pseudomonas به طور یکسان بیشتر عمل می نماید. با توجه به نتایج به دست آمده از این تحقیق می توان با انتقال دائم ژن sdmod، گیاهان تراریخته مقاوم به بیماری های باکتریایی تولید نمود، و از سوی دیگر با مصرف این گیاهان توسط انسان و دام آنها را در مقابل بیماری های باکتریایی ایمن نمود.

اثرات ضد قارچی عصاره گیاه مورد (myrtus communis l) بر قارچ های جدا شده در دوره انکوباسیون تخم قزل آلای رنگین کمان (oncorhynchus mykiss)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهرکرد - دانشکده منابع طبیعی 1393
  فرشته سلیمیان ناغانی   امین نعمت اللهی

گیاه مورد (myrtus communis l)، یکی از گیاهان دارویی با ارزش ایران است که اثرات دارویی آن اثبات شده است. در این مطالعه برگ های گیاه مورد در خرداد ماه 1392 در استان چهارمحال و بختیاری جمع آوری و به روش استخراج فلاونوئید، کروماتوگرافی لایه نازک (tlc) و خیساندن (maceration) عصاره گیری انجام شد. سپس اثر غلظت های مختلف عصاره های به دست آمده روی دو قارچ ساپرولگنیا (saprolegniaspp.) و فوزاریوم (fusariumspp.) که از عوامل بیماریزای قارچی تخم ماهیان محسوب می شوند، مورد بررسی قرار گرفت. برای بررسی اثر ضد قارچی عصاره از روش تست انتشار از دیسک (disk diffusion)و تست انتشار از چاهک (well diffusion) استفاده شد. در بررسی حاضر عصاره های به دست آمده گیاه مورد روی قارچ فوزاریوم تاثیر بازدارندگی از خود نشان دادند. بر اساس نتایج به دست آمده مشخص شد که عصاره گیاه مورد اثر بخشی بهتری در جلوگیری از رشد قارچ ساپرولگنیا نسبت به قارچ فوزاریوم داشت. این مطالعه نشان دهنده وجود ترکیب های ضد قارچی در عصاره های مختلف گیاه مورد است که با مطالعه در مقیاس گسترده تر امید است که در آینده بتوان از آن به عنوان داروی مناسب جهت درمان بیماری های قارچی در آبزی پروری استفاده کرد