رفع مشکلات موجود در پروژه های آبیاری و زهکشی به دلیل گستردگی و پراکندگی مسیرهای کاری نیازمند اعمال مدیریت خاص و تخصیص بهینه منابع به فعالیتهای مختلف می باشد. به همین دلیل و با توجه به شرایط سخت استان سیستان و بلوچستان به دلیل دوری از مرکز و گستردگی جغرافیایی و بالاخص شرایط اقلیمی منطقه، پروژه شبکه آبیاری و زهکشی دشت باهوکلات که در همجواری مرز پاکستان و در منطقه بلوچستان جنوبی نزدیک ب شهرستان چابهار قرار دارد و در طول مدت اجرا نیز دچار مشکلات عدیده ای اعم از مسائل اجرایی و ... گردیده و بنحوی که در جهت انجام پروژه ضمن اینکه پیمانکاران مختلفی در اجرای آن نقش داشته اند ولی باز هم بدلایل مختلف قسمتی از کار نیز بصورت امانی توسط کارفرما انجام پذیرفته و بدلیل مشکلات خاص آن ، وقت و توان ویژه ای از سوی کارفرما را به خود اختصاص داده است. در این رساله نقاط ضعف و قوت ، فرصتها و تهدیدها و دلایل موفقیت یا شکست پیمانکاران دست اندرکار پروژه و نحوه اعمال مدیریت در پروژه و نوع سازماندهی پیمانکاران مورد نقد و بررسی قرار گرفته و ساختار مناسب جهت اعمال مدیریت کارآمد در پروژه پیشنهاد شده است. همچنین در این پایان نامه مشکلات مربوط به اجرای مفاد ماده 106 قانون بودجه در پروژه مزبور نیز مورد ارزیابی قرار گرفته است.