نام پژوهشگر: احسان رشیدیان

تاثیر طول دوره گرسنگی پیش از کشتار بر برخی پارامترهای خونی، جمعیت باکتریایی چینه دان و راندمان لاشه مرغ های گوشتی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1389
  برزو آزادی نیا   حشمت اله خسروی نیا

به منظور بررسی اثر زمان گرسنگی قبل از کشتار بر میزان افت وزن زنده، وزن و راندمان لاشه، جمعیت باکتری ها و ph چینه دان و پارامترهای بیوشیمیایی خون مرغ های گوشتی نر و ماده، آزمایشی با تعداد 112 قطعه جوجه گوشتی سویه راس، در سن 35 روزگی اجرا شد. پرندگان به طور تصادفی به هفت گروه مجزا تقسیم شدند و تا سن 42 روزگی تحت شرایط استاندارد در محل اجرای آزمایش پرورش یافتند. در 42 روزگی همه پرندگان وزن شدند و سپس 8 مرغ و 8 خروس از هر گروه پس از تحمل .، 4، 8، 12، 16، 20 و24 ساعت گرسنگی کشتار گردیدند. سطح گلوکز، اسید اوریک و کلسترول خون به طور معنی داری (01/0> p) تحت تاثیر زمان گرسنگی قبل از کشتار کاهش یافت و سایر اجزای بیوشیمیای خون شامل تری گلیسرید hdl و ldl با افزایش زمان گرسنگی تغییر معنی داری نیافت (05/0< p). جنسیت فقط تاثیر معنی داری (01/0> p) بر میزان کلسترول خون داشت. میزان ph و جمعیت باکتریایی چینه دان با افزایش زمان گرسنگی افزایش معنی داری (01/0> p) یافت. جنسیت بر روی وزن چینه دان اثر معنی داری (01/0> p) داشت. درصد خونابه دفع شده از لاشه طی ساعات گرسنگی قبل از کشتار افزایش معنی داری (01/0> p) داشت ولی جنسیت تاثیری بر این مورد نداشت. افزایش ساعات گرسنگی سبب کاهش نسبت جذب آب در لاشه (01/0> p) شد اما جنسیت تاثیری نداشت. وزن و راندمان لاشه گرم و سرد تحت تاثیر ساعات گرسنگی قبل از کشتار قرار نگرفت (05/< p) ولی جنسیت اثر معنی داری (01/0> p) بر وزن لاشه گرم و سرد داشت. نسبت کاهش وزن زنده بطور معنی داری (01/0> p) با افزایش ساعات منع مصرف افزایش یافت و جنسیت نیز (05/0> p) بر آن اثر گذار بود. میزان ph چینه دان به طور معنی داری تحت تاثیر اثر متقابل جنسیت و طول زمان گرسنگی قبل از کشتار قرار گرفت (05/0< p). نتیجه گیری می شود که برای جلوگیری از کاهش وزن زنده و بهبود سلامت لاشه مرغ گوشتی طول دوره منع مصرف خوراک بین 4 تا 12 ساعت مطلوب است.

ردیابی فنوتیپی و مولکولی ژن مولد بتالاکتاماز وسیع الطیف tem در جدایه های اشریشیا کولای از نمونه های ادراری شهرستان خرم آباد
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه لرستان - دانشکده دامپزشکی 1393
  بهمن دوستی   احسان رشیدیان

هدف: امروزه انتشار سویه¬های بیماری¬زای اشریشیا کولای حاوی بتالاکتامازهای وسیع ¬الطیف (esbls) به عنوان یکی از نگرانی¬های عمده¬ی بهداشتی در سطح دنیا مطرح است. احتمالا عمده-ترین علت تکوین و گسترش بتالاکتامازهای وسیع ¬الطیف، استفاده¬ی بیش از حد یا نادرست از سفالوسپورین¬های وسیع الطیف است. هدف از مطالعه¬ی حاضر بررسی میزان فراوانی و شیوع بتالاکتاماز¬های نوع tem در سویه¬های اشریشیا کولای مولد عفونت¬های ادراری در شهرستان خرم¬آباد بود.¬ روش¬ها: یکصد جدایه اشریشیا کولای از بیماران مبتلا به عفونت¬های ادراری-تناسلی، از 12 آزمایشگاه بالینی مختلف در شهرستان خرم¬آباد جمع¬آوری گردید. اصالت جدایه¬ها با انجام آزمایشات بیوشیمیایی مورد تایید قرار گرفت. آزمون¬های حساسیت میکروبی با استفاده از روش انتشار دیسک (کیربای-¬¬بائر) و بر اساس راهنمای تایید شده توسط موسسه¬ی استاندارد بالینی و آزمایشگاهی (clsi) انجام گرفت. سویه¬های esbl مثبت با روش¬های غربال¬گری اولیه و متعاقبا دیسک ترکیبی و با استفاده از دیسک¬های حاوی سفتازیدیم¬(30¬µg)، سفتازیدیم-کلاولانیک اسید-(30/10¬µg)، سفوتاکسیم (30¬µg) و سفوتاکسیم-کلاولانیک اسید¬(30/10¬µg)، مشخص گردیدند. در ادامه تمامی نمونه¬های مثبت با روش pcr از نظر حضور ژن¬های tem و shv مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج: 31 نمونه (31%) از مجموع 100 نمونه¬ی اشریشیا کولای با توجه به نتایج آزمون¬های دیسک ترکیبی، esbl مثبت تشخیص داده شدند. تجزیه و تحلیل نمونه¬ها با روش pcr و با استفاده از پرایمر¬های اختصاصی نشان داد که 18 جدایه (06/58%) حاوی ژن¬های بتالاکتامازی رمزگذاری شده برای tem بوده، در حالی که هیچ کدام از جدایه¬ها دارای ژن shv نمی¬باشند. بحث: تحقیق اخیر میزان شیوع نسبتا بالای ژن¬های مقاومت نسبت به سفالوسپورین¬های نسل سوم در بین جدایه¬های اشریشیا کولای را نشان داده که حاکی از چالش در درمان موفقیت¬آمیز با آنتی¬بیوتیک-های رایج است. بدیهی است که استفاده بیش از حد، اشتباه و یا نادرست از عوامل ضد میکروبی در عفونت¬های انسان و نیز بخش کشاورزی، در گذشته و حال، انسان را برای مدت زمان طولانی متاثر خواهد نمود. برای تعیین میزان شیوع، منشاء، مکانیزم گسترش و روش انتقال عوامل موثر در بروز مقاومت در بتالاکتاماز¬های وسیع الطیف و یا ارگانیزم¬های مولد بتالاکتاماز¬های وسیع الطیف تحقیقات بیشتری مورد نیاز است. این امر منجر به درک بهتر و نهایتا سهولت در تدوین استاندارد¬های دقیق در امر بهداشت عمومی و اتخاذ راهبرد¬های درمانی بهبود یافته با عوامل ضد میکروبی به منظور ریشه کنی یا حداقل کند نمودن روند گسترش عوامل موثر در بروز مقاومت در بتالاکتاماز¬های وسیع الطیف و تولید کننده¬های esbl خواهد شد.

بررسی شیوع ژن های تولیدکننده شیگاتوکسین در جدایه های اشریشیا کلی از بیماران مبتلا به عفونت های مجرای ادراری در خرم آباد
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه لرستان - دانشکده دامپزشکی 1393
  فریدون منصوری   نعمت شمس

هدف : با توجه به اهمیت سویه های اشریشیا کلی وروتوکسیژنیک و مخاطراتی که از سوی این توکسین متوجه سلامتی انسان است، بررسی آن در مناطق مختلف کشور از اهمیت فوق العاده ای برخوردار می باشد . مطالعه حاضر تلاشی است در جهت شناسایی ژن های بیان کننده توکسین های مذکور در شهرستان خرم آباد است. روش ها: این تحقیق بر روی تعداد 146 جدایه اشریشیا کلی که طی سالهای 90 - 1389 از نمونه های ادرار ی ارجاعی به آزمایشگاههای تشخیص طبی سطح شهرستان خرم آباد جدا گردیده بود انجام گرفت. ابتدا جدایه ها با استفاده از محیطهای افتراقی، اختصاصی و انجام تست های بیوشیمیایی استاندارد ( imvic ، tsi ، اوره آز، ) ... شناسایی و تعیین هویت گردیدند. سپس از روش multiplex pcr جهت ردیابی ژن های stx 1 و stx 2 که بترتیب قطعات 302 و 512جفت بازی تولید می کنند، بهره گرفته شد. نتایج: از تعداد 146 نمونه بررسی شده تعداد 111(80/13%)نمونه مربوط به زنان و تعداد 29(19/86%)نمونه مربوط به مردان بود که هیچکدام آنها واجد ژن های stx1 و stx2 نبودند. بحث: علی رغم منفی شدن نتایج این تحقیق بدلایل احتمالی مختلف مانند فصل نمونه گیری،و ماندگاری نمونه ها بمدت طولانی و فریز ودیفراست آنها (گرچه شیوع این ژنها پایین است) ،نباید از خطرات بالقوه ناشی از این ژنها غافل شد. لذا بررسی سایر منابع احتمالی انتقال باکتری ضروری است.

تنوع ژنتیکی استرین های xanthomonas smithii subsp citri عامل شانکر باکتریایی مرکبات استان های لرستان و ایلام بر پایه الگوی box و eric و توالی 16s rdna
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه لرستان - دانشکده کشاورزی 1392
  مریم شاهی وند   غلام خداکرمیان

بیماری شانکر آسیایی یکی از مهم ترین بیماری های مرکبات در دنیا و عامل این بیماری xanthomonas smithii subsp. citri در بسیاری از کشورهای دنیا به عنوان یک پاتوژن قرنطینه ای است. از آنجا که مهمترین شرط لازم برای مدیریت یک بیماری گیاهی پس از شناسایی، پی بردن به تنوع ژنتیکی آن است این تحقیق به منظور شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی استرین های زانتوموناس عامل شانکر باکتریایی مرکبات در استان های لرستان و ایلام بر اساس الگوی 16 srdna و آغازگرهای box و eric (rep-pcr) انجام گردید تا در مدیریت کنترل بیماری مورد استفاده قرار گیرد. در این راستا از باغات مشکوک به آلودگی در استان های ایلام و لرستان نمونه برداری صورت گرفته و به آزمایشگاه منتقل و مجموعا سی جدایه باکتریایی جداسازی گردیدند که با انجام تست های فنوتیپی و استفاده از پرایمر های اختصاصی شانکر باکتریایی مرکبات بر اساس الگوی 16srdna، شانکر نوع a xanthomonas smithii subsp. citri تشخیص داده شد. یکی جدایه انتخاب و محصول pcr آن توالی یابی شد. توالی به دست آمده پس از همردیف سازی چند گانه با برنامه mega5 با سایر توالی های مربوط به این ناحیه موجود در بانک ژن (ncbi) مقایسه شد نتایج به دست آمده نشان داد که این جدایه در سطح 97% با xanthomonas citri subsp. citri از سایر نقاط دنیا شباهت داشته و از نظر تکاملی نزدیکترین رابطه را با توالی جدایه کرمان دارد. داده های حاصل از rep-pcr با استفاده از نرم افزار(ntsys-pc 2.02) numerical taxonomy and multivariate analysis system تجزیه و تحلیل شد و فاصله یا شباهت ژنتیکی بین افراد به صورت وجود یا عدم وجود باند در ژل مشخص شد. برای بررسی فاصله واقعی میان کلاسترها از روش (upgma) unweighted pair-group method using arithemtic average و ضریب تشابه جاکارد (j) استفاده گردید. با توجه به آنالیز rep-pcr جدایه ها در سطح 69% به 5 گروه تقسیم شدند. الگوی باند های تولید شده بین 4000-500 جفت باز بود و جدایه های استان لرستان تنوع بیشتری نشان دادند.

ردیابی فنوتیپی و مولکولی ژن مولد بتالاکتاماز وسیع الطیفtem در جدایه های اشریشیا کولای از طیور مبتلا به کلی باسیلوز در شهرستان خرم آباد
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه لرستان - دانشکده دامپزشکی 1394
  سمیرا سهرابی   احسان رشیدیان

هدف: امروزه انتشار سویه های بیماری زای اشریشیا کولای حاوی بتالاکتامازهای وسیع الطیف esbls به عنوان یکی از نگرانی های عمده ی بهداشتی در سطح دنیا مطرح است. احتمالاً عمده-ترین دلیل تکوین و گسترش بتالاکتامازهای وسیع الطیف، استفاده ی بیش از حد یا نادرست از آنتی بیوتیک ها است. هدف از مطالعه ی حاضر بررسی میزان فراوانی و شیوع بتالاکتامازهای نوع tem در سویه های اشریشیا کولای از طیور مبتلا کلی باسیلوز در شهرستان خرم آباد بود. روش کار: 100 جدایه اشریشیا کولای از طیور مبتلا به کلی باسیلوز، از 3 آزمایشگاه تشخیص دامپزشکی مختلف در شهرستان خرم آباد جمع آوری گردید. اصالت جدایه ها با انجام آزمایشات بیوشیمیایی مورد تأیید قرار گرفت. آزمایشات حساسیت میکروبی با استفاده از روش انتشار دیسک (کیری-بائر) و بر اساس راهنمای تأیید شده توسط موسسه ی استاندارد بالینی و آزمایشگاهی(clsi) انجام گرفت. سویه های esblمثبت با روش های غربالگری اولیه و متعاقباً دیسک ترکیبی و با استفاده از دیسک های حاوی سفتازیدیم (30µg)، سفتازیدیم – کلاولانیک اسید (gµ30/10)، سفوتاکسیم (30µg)، و سفوتاکسیم- کلاولانیک (30/10µg) مشخص گردید. در ادامه تمامی نمونه های مثبت با روش pcrاز نظر حضور ژن tem مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج: از مجموع 100 جدایه ی اشریشیا کولای، 4 جدایه با توجه به نتایج آزمون های دیسک ترکیبی esbl مثبت تشخیص داده شدند. تجزیه و تحلیل این جدایه ها با استفاده از پرایمر های اختصاصی نشان داد که تنها یک جدایه (25 درصد) حاوی ژن بتالاکتاماز رمز گذاری شده برای temبودند. بحث: هرچند در ایران مطالعات معدودی بر روی میزان جدایه های اشریشیا کولای مقاوم به آنتی-بیوتیک های بتالاکتام صورت پذیرفته است، اما با توجه به مشاهده مقاومت در این گونه جدایه ها از یک سو و نیز با توجه به اینکه طیور می توانند در انتشار و انتقال اشریشیا کولای های مقاوم به آنتی بیوتیک ها به انسان نقش داشته باشند و این امر گزینه های درمانی علیه عفونت های انسانی وحیوانی را به شدت محدود می کند. اطلاع از وضع مقاومت های میکروبی در طیور به منظور جلوگیری از مصرف بی رویه ی آنتی بیوتیک ها در درمان و یا پیشگیری از بیماری ضروری به نظر می رسد. این مهم با جلوگیری از مصرف بی رویه ی آنتی بیوتیک ها در درمان یا پیشگیری از بیماری های طیور و با اتخاذ راهکارهای مناسبی از قبیل: آموزش کافی به دامپزشکان درخصوص مکانیسم های مقاومت esbls، درمان عفونت های ناشی از ارگانیسم های esbl مثبت با آنتی-بیوتیک های مناسب بوقوع می پیوندد. با توجه به مطالب مشروح در فوق سازمان های دخیل درامر بهداشت صنعت طیور در کشور باید هر ساله بررسی هایی را در مورد ژن های دخیل در مقاومت آنتی بیوتیکی انجام دهند، تا روند رو به گسترش این ژن ها را در نواحی مختلف جغرافیایی آشکار نمایند و با استفاده ازیافته های مذکور، راهبردهای پیشگیرانه و مناسبی را جهت کاهش روند شیوع مقاومت های دارویی تدوین نمایند.

ردیابی فنوتیپی و مولکولی ژن های مولد بتالاکتاماز وسیع الطیف ctx-m در جدایه های اشریشیا کولای از طیور مبتلا به کلی باسیلوز در شهرستان خرم آباد
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه لرستان - دانشکده دامپزشکی 1394
  سکینه نادعلی   احسان رشیدیان

هدف: امروزه انتشار سویه های بیماری زای اشریشیا کولای حاوی بتالاکتامازهای وسیع الطیف (esbls) به عنوان یکی از نگرانی های عمده ی بهداشتی در سطح دنیا مطرح است. احتمالاً عمده ترین علت گسترش بتالاکتامازهای وسیع الطیف، استفاده بیش از حد و نادرست از سفالوسپورین های وسیع الطیف است. هدف از مطالعه حاضر بررسی میزان فراوانی و شیوع بتالاکتامازهای نوع ctx-m در سویه های اشریشیا کولای در نمونه های مرضی طیور مبتلا به کلی باسیلوز در طیور شهرستان خرم آباد است. روش ها: طی نمونه گیری که در مدت 6 ماه انجام شد، 100 جدایه اشریشیا کولای از آزمایشگاه های دامپزشکی شهرستان خرم آباد جمع آوری گردید.با انجام تست های بیوشیمیایی اصالت جدایه ها مورد تأیید قرار گرفت. آزمون های حساسیت میکروبی با استفاده از روش انتشار دیسک (kirby- bauer) و براساس راهنمایی های تأیید شده توسط موسسه ی استاندارد بالینی و آزمایشگاهی (clsi) انجام گرفت. سویه های esblمثبت با روش های غربالگری اولیه و متعاقباّ دیسک ترکیبی و با استفاده از دیسک های حاوی سفتازیدیم (30µg)، سفتازیدیم- کلاولانیک اسید (30, 10 µg )، سفوتاکسیم (30µg) و سفوتاکسیم- کلاولانیک اسید (30, 10 µg)، مشخص گردیدند. در نهایت تمامی نمونه های مثبت با روش pcr از نظر حضور ژن ctx-m مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج: از مجموع 100 جدایه ی اشریشیا کولای، 4 جدایه با توجه به نتایج آزمون های دیسک ترکیبیesbl مثبت تشخیص داده شدند. تجزیه و تحلیل جدایه ها با روش pcr و با استفاده پرایمرهای اختصاصی نشان داد که تنها 1 جدایه (25 درصد) حاوی ژن های بتالاکتامازهای رمز گذاری شده برای ctx-m بودند. بحث: در ایران هر چند مطالعات کمی روی این موضوع انجام گرفته ولی باز هم پراکندگی ژن های مقاومت در هر شهر و ناحیه متفاوت است و عوامل زیادی در این موضوع دخالت دارند. بدیهی است که این امر به عنوان یک هشدار و خطر جدی حاکی از مصرف نادرست آنتی بیوتیک ها در کشور است. تولید بتالاکتامازهای وسیع الطیف توسط باکتری های بیماری زا، می تواند به عنوان یک معضل درمانی در درمان طیور مبتلا به کلی باسیلوز که از سفالوسپورین های با طیف وسیع استفاده می کنند، در نظر گرفته می شود. و از آن جایی که احتمال اینکه این طیور وارد زنجیره ی غذایی انسان شوند واین مقاومت چندگانه دارویی رابه انسان انتقال دهند، بسیار بالا است، لذا برای حل این معضل ارتقاء سطح مدیریت بهداشتی واحدهای تولیدی، مقابله با بیماری های واگیردار از طریق واکسن، نظارت منظم و مداوم بر مصرف آنتی بیوتیک ها، سیاست های درمانی از قبیل آموزش کافی به دامپزشکان در مورد مکانیسم های مقاومت esbls، درمان عفونت هایی که مشکوک به ارگانیسم های تولید کننده ی بتالاکتاماز هستند با استفاده از آنتی بیوتیک های دارای قدرت مهارکنندگی این آنزیم ها باید انجام پذیرد. با توجه به مطالب مشروح در فوق سازمان های دخیل در امر بهداشت صنعت طیور در هر کشور باید هر ساله بررسی های گسترده ای را در مورد ژن های دخیل در مقاومت صورت دهند تا روند گسترش این ژن ها در نواحی جغرافیایی آشکار گردیده و با استفاده از یافته های مذکور، راهبردهای پیشگیرانه ی مناسبی جهت کاهش روند شیوع مقاومت های دارویی طراحی و اجرا گردد.

تعیین گروه جدایه های اشرشیا کلی مولد اسهال در کودکان در شهر خرم آباد و ارزیابی حضور اشرشیا کلی o157:h7 در نمونه ها
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم پایه 1394
  فاطمه عزیزی   محمد رعایایی

اسهال به عنوان یک اختلال گوارشی و از عوامل رایج در مرگ و میر کودکان کشورهای در حال توسعه می باشد. در میان پاتوژن های باکتریایی اشرشیا کلی مولد اسهال (dec) یکی از مهم ترین عوامل اسهال اندمیک و اپیدمیک در سطح جهان است. هدف از تحقیق حاضر، تشخیص مولکولی گروه های اشرشیا کلی مولد اسهال در کودکان به روش multiplex pcr و ارزیابی حضور اشرشیا کلی o157:h7 در نمونه ها است. روش کار: در سال 1393 (اردیبهشت تا آذر)، برای مطالعه مقطعی به منظور جداسازی اشرشیا کلی-های مولد اسهال، نتایج کشت مدفوع 578 کودک زیر 10 سال مراجعه کننده (311 پسر، 267 دختر) به بیمارستان شهید مدنی خرم آباد، بررسی شد. ابتدا نمونه ها در محیط کشت مک کانکی آگار کشت داده شدند و سپس کلنی های صورتی رنگ (لاکتوز مثبت) در محیط کشت emb آگار کشت داده شدند، به منظور ارزیابی حضور اشرشیا کلی o157:h7 ، نمونه ها در محیط سوربیتول مک-کانکی حاوی سفکسیم و تلوریت پتاسیم نیز کشت داده شدند. تایید هویت جدایه های اشرشیا کلی با انجام تست های بیوشیمیایی افتراقی انجام گردید. نتایج: از 578 نمونه مدفوع جدا شده از کودکان مبتلا به اسهال، 186 جدایه اشرشیا کلی مولد اسهال تشخیص داده شد، سپس سروگروه اشرشیا کلی های انتروپاتوژن بررسی شد که در 23 نمونه epec جدا شد و بیشترین سروگروه مربوط به سروگروه iv بود. در نهایت 186 جدایه توسط روش multiplex pcr جهت تعیین گروه جدایه های اشرشیا کلی های مولد اسهال ( 4 پاتوتایپ etec ( enterotoxigenic escherichia coli)، epec ( enteropathogenic escherichia coli)، eiec( enteroinvasive escherichia coli) و stec( shiga toxin-producing escherichia coli) ) برای تشخیص ژن های lt ، st ، bfpa ، eaea، stx1، stx2 و ial مورد بررسی قرار گرفتند. بیشترین گروه جدا شده در بین 4 پاتوتایپ etec، epec ، eiec و stec مورد بررسی به ترتیب، etec با 15درصد، epecبا 14 درصد، stec با 7/9 درصد و eiecبا 83/4 درصد بودند. در هیچکدام از جدایه ها سروتیپ اشرشیا کلی o157:h7یافت نشد. بر اساس نتایج بدست آمده می-توان بیان کرد که 4 پاتوتایپ مورد بررسی از عوامل مهم ابتلا به اسهال در کودکان می باشند و بایستی برای شناسایی آن ها از روش-های نوینی بهره گرفت.