هدف از مطالعه حاضر تعیین فراوانی ژنوتیپ های کلامیدیا تراکوماتیس در شیراز بوده است. در این مطالعه تعداد 285 نمونه اندوسرویکال از زنان مراجعه کننده به درمانگاه مطهری شیراز مورد بررسی قرار گرفت. تشخیص اولیه کلامیدیا تراکوماتیس در این نمونه ها با انجام pcr بر روی ژن پلاسمیدی صورت گرفت. ژنوتیپ باکتری در موارد مثبت، با انجام pcr بر روی ناحیهvd1-vd2 از ژن omp1 و تعیین توالی و هضم آنزیمی آن مشخص گردید. نتایج بیانگر فراوانی کلامیدیا تراکوماتیس به میزان %7.7 بود. فراوانی ژنوتیپ ها به ترتیب مربوط به ژنوتیپ های f (6/46%)، e (3/33%) و d (3/13%) بود. ژنوتیپ g تنها در یک نمونه شناسایی گردید. مقایسه توالی نوکلئوتیدی ژنوتیپ های شناسایی شده با توالی سویه های مرجع در genbank بیانگر وجود تفاوت نوکلئوتیدی در 4 ژنوتیپ بود. یافته های حاصل از مطالعه حاضر بعنوان بخشی از مطالعات اپیدمیولوژیک به منظور تعیین فراوانی ژنوتیپ های کلامیدیا تراکوماتیس در ایران حائز اهمیت است.