نام پژوهشگر: زهرا نعیمی فر

مطالعه برهمکنش برخی داروها با تعدادی از پروتئین ها به روش دینامیک مولکولی
پایان نامه دانشگاه تربیت معلم - تبریز - دانشکده علوم پایه 1390
  زهرا نعیمی فر   جابر جهانبین سردرودی

هرچند دانسته های ما راجع به زیست شناسی سرطان پیشرفت زیادی داشته است، نه انتشار سرطان و نه نرخ مرگ ومیرهای ناشی از آن در 50 سال اخیر تغییری نکرده است. پروتئین کینازc ( pkc ) یکی از خانواده های پروتئین" serine/threonine " است که نقشی مرکزی در سیگنال های هدایتی بازی می کند.پلی فنول کورکومین، جزء اصلی "curcuma longa" یکی از عوامل ضدسرطان و تنظیم کننده " pkc " است.در تحقیق کنونی، شبیه سازی داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی برای درک بهتری از تنظیم کنندگی " pkc " به وسیله کورکومین اجرا شده است. در این اجراها ما از مجموعه برنامه های " auto dock4 " برای داکینگ و " gromacs-4.0.7 " برای دینامیک مولکولی استفاده شده است. دراین تحقیق به نظر می رسد که پیوندهای هیدروژنی میان کورکومین و پروتئین کیناز فاکتور مهمی در برهمکنش های این دو است. شبیه سازی های صورت-گرفته می توانند در بررسی های تجربی برخی سیستم های زیستی به منظور کشف دارو مفید واقع شوند، خصوصاً در مواردی که به دست آوردن ساختار کریستالی کمپلکس پذیرنده و لیگاند دشوار است.