نام پژوهشگر: [email protected] نیازی

تجزیه و تحلیل توالی هایest گونه triticum monococcum، خویشاوند وحشی گندم نان، به منظور تعیین گروه های کارکردی و بررسی بیان ژن ها
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده کشاورزی 1388
  روح الله شاملو   هومن راضی

بررسی expressed sequence tags یا ests قابلیت روشن ساختن جنبه های مولکولی گذار به گلدهی، به عنوان چشمگیرترین تغییر تکاملی در گیاهان به وسیله مطالعه انتقال مریستم راسی ساقه shoot apical meristem (sam) از وضعیت رویشی به وضعیت گل آذین را داراست. در این مطالعه دو کتابخانه ی est مربوط به مریستم راسی ساقه گونه ی triticum monococcum (amam)، به عنوان یک گیاه دیپلوئید مدل، در مراحل رویشی و آغاز فاز زایشی مورد بررسی قرار گرفت. دسته بندی و آنالیز این توالی ها و به دنبال آن انجام آزمون های آماری وجود اختلاف معنی دار در شانزده گروه کارکردی مختلف همچون پروتئین، دیواره سلولی، علامت دهی و پروتئین های تنظیمی بین دو مرحله را نشان داد که بیانگر تغییر جهت دار فعالیت ژنوم طی گذار به گلدهی است. نمایه یابی بیان ژن ها بر اساس آزمون آماری audic and claverie مبین بیان افتراقی 37 ژن مختلف نظیر sus1، erd15، gr-rbp2، spl 16 و samdc و غیره، متعلق به گروه های کارکردی متفاوت، بود.. پنج ژن ناشناخته با بیان افتراقی در بین سایر ژن ها شناسایی شد که ساختار و کارکرد پروتئین مربوط به آن ها توسط ابزار های بیوانفورماتیک پیش بینی و بررسی گردید. در یک نتیجه گیری کلی می توان چنین استنباط نمود که فرآیند گذار به گلدهی فرآیندی است پیچیده که بخش های متعددی از ژنوم را به خود مشغول می کند. همچنین به نظر می رسد تعداد زیادی ژن به خصوص برخی عوامل رونویسی و پروتئین های علامت دهی نقش حیاتی در این فرآیند ایفا می کنند