بهینه سازی کامل ساختار مولکول های 2و5و8- تری هیدروکسی 1و4- نفتوکینون (2-هیدروکسی نفتازارین) و5و7و8- تری هیدروکسی 1و4- نفتوکینون (7-هیدروکسی نفتازارین) توسط نظریه تابعی چگال (dft) انجام گرفته است. محاسبات و نتایج با ترکیب اولیه ، نفتازارین، مقایسه شده است.فرکانس های ارتعاشی هماهنگ در سطح نظری b3lyp و با استفاده از سری های پایه g**31-6 و ++g**311-6 محاسبه شده است.جابه جایی های شیمیایی هیدروژن در سطح نظری g**31-6 b3lyp/ و++g**311-6 b3lyp/ محاسبه شده است.انتساب فرکانس های ارتعاشی برای ترکیبات دوتره و غیره دوتره انجام شده است. با بررسی فرکانس های طیف ir و رامان و مانند دوتره شده اش، نسبت فرکانس های کششی oh به od و نسبت فرکانس خمشی خارج از صفحه oh به od را که در پیوند هیدروژنی درگیر هستند، محاسبه کردیم. نتایج نشان داد که قدرت هر دو پیوند هیدروژنی درون مولکولی در 5و7و8- تری هیدروکسی 1و4- نفتوکینون نسبت به نفتازارین بیشتر است. اما در ترکیب 2و5و8- تری هیدروکسی 1و4- نفتوکینون تغییر در قدرت هر دو پیوند هیدروژنی درون مولکولی یکسان نیست.