امروزه همه کشورهای جهان به دلیل محدود بودن منابع اولیه و نامحدود بودن نیازهای انسان در زندگی اجتماعی استفاده از نظام بودجه ریزی جهت رسیدن به حداکثر بهره از حداقل منابع را امری ضروری و لازم می دانند و از روشهای مختلف بودجه ریزی استفاده می کنند. در این میان کشور در حال توسعه ما نیاز بیشتری به برنامه ریزی دقیق و کارآمد برای رشد سریعتر و همه جانبه خصوصا در زمینه های اقتصادی دارد و استفاده از بودجه ریزی مناسب همراه با روش های کنترل بودجه ای نوین می تواند در این زمینه بسیار تاثیر گذار باشد. برای کمک به کنترل بودجه ای موثرتر در این تحقیق سعی شده است دلایل ایجاد مغایرت بین عملکرد بودجه و بودجه مصوب سازمان هواشناسی کشور به عنوان یکی از دستگاه های اجرایی مستقل زیر مجموعه وزارت راه و ترابری مورد بررسی قرار گیرد. این تحقیق با هدف کمک به کاهش مغایرات بودجه ای مشاهده شده بین عملکرد بودجه و بودجه مصوب سازمان هواشناسی کشور در سال های برنامه چهارم توسعه انجام شده است و پس از بررسی اسناد بودجه ای سازمان مذکور و ارزیابی پاسخ پرسشنامه های توزیع شده با استفاده از روش تحقیق همبستگی ،بین مغایرت عملکرد بودجه و عوامل مدیریتی با سه مولفه عوامل ساختاری ، عوامل محیطی و عوامل رفتاری ارتباط معنی داری مشاهده گردید و نهایتا پیشنهادهایی بر اساس نتایج بدست آمده در جهت کاهش مغایرت ها ارائه گردید.