نام پژوهشگر: والنتین داودیان

استفاده از توصیف کننده های عاری از جهت در مطالعه کمی ساختار-فعالیت ترکیبات بتا-کربولین
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی 1390
  والنتین داودیان   جهانبخش قاسمی

هدف از مطالعه حاضر ایجاد یک مدل کیوسار سه بعدی معتبر با قابلیت پیشگویی بالا برای مجموعه-ای از داروهای ضدتومور می باشد. توصیف کننده های عاری از جهت، توصیف کننده هایی مستقل از هم ترازی و کاملاً قابل درک و قابل تفسیر از نظر شیمیایی هستند. این توصیف کننده ها مشابه روش کومفا از انرژی برهمکنش های برمبنای میدان نیرو مشتق می شوند که در هر نقطه از شبکه احاطه کننده مولکول محاسبه شده اند. متغیرهای استفاده شده در روش grind به صورت بردارهایی هستند که دو نقطه از فضا را با خصوصیات میدانی متفاوت به هم متصل می کنند. بنابراین مدل بهینه نهایی مدل هایی شبیه به مدل های کیفی فارماکوفوری را ارائه می دهند که می توانند یک الگوی فضایی از نحوه اتصالات در سایت فعال پروتئین را در اختیار ما قرار دهند. همچنین جهت بررسی بیشتر از یکی دیگر از روش های کیوسار سه بعدی مستقل از هم ترازی موسوم به روش volsurf استفاده شده است. توصیف گرهای مولکولی volsurf ویژگی های فارماکوشیمیایی و فارماکوسینتیکی ترکیبات را ارائه می کنند، اماgrind بیشتر جهت گیری به سمت ارائه توانایی مولکول برای اتصال با بیومولکول ها را دارد و بنابراین برای ارائه خواص فارماکودینامیکی مناسب تر است. با وجود تفاوت در ماهیت توصیف کننده ها در دو روش نتایج نسبتاً یکسانی حاصل شده است