تخمین پارامترها در فرایند شناسایی سیستم های دینامیکی مرتبه کسری یک ضرورت در تئوری کنترل محسوب می شود. سیستم مرتبه کسری می تواند بطور کامل با دقت بالایی حتی با وجود مقادیر قابل توجهی از خطاها، شناسایی گردد. فرایند شناسایی با استفاده از الگوریتم روشهای هوشمند ارائه و در مدلهای مختلف با استفاده از تعاریف انتگرال دیفرانسیل کسری مورد تحقیق قرار گرفت.روش پیشنهادی، تئوری حساب دیفرانسیل و انتگرال را برای یافتن معادلاتی در ارتباط با پارامترهای نامعلوم بکار گرفته و سپس پارامترهای فرایند را پس از حل معادلات همزمان، تعیین می نماید. معادلات همزمان با استفاده از تکنیک بهبود گروهی ذرات (ga ,cpso, pso) حل و به روز می شود. خروجیهای شبیه سازی شده با مجموعه خروجیهای بدست آمده از سیستم واقعی مرتبه کسری، ضمن اعمال ورودی یکسان مقایسه شده، بهبود داده می شود. تابع هدف به صورت مجموع مربعات خطا بین پاسخ سیستم واقعی و سیستم تخمین زده شده تعریف شده است. نتایج از لحاظ سرعت همگرایی با یکدیگر مقایسه شده و بهترین روش شناسایی پارامترهای توابع کسری احصا گشته است. در خاتمه نیز با شبیه سازی سیستم نمونه ای و کاربردی در شرایط نویزی، اقدام به تخمین پارامترهای آزاد ساختار مدل گردیده است. نتایج بدست آمده کارآمد بودن این روش را نمایش می دهد.