هدف از تحقیق حاضر تبین رابطه ساختار سازمانی با اثر بخشی سازمانی و میانجیگری نقش توانمندسازی در بین کارکنان آموزش و پرورش نواحی شهرستان شیراز بوده که با روش تحقیق توصیفی از نوع همبستگی انجام گردید. جامعه آماری این تحقیق شامل کلیه کارکنان اداری نواحی چهارگانه آموزش و پرورش شهرستان شیراز می باشد و نمونه آماری پژوهش کارکنان ناحیه 1و4 می باشند که به شیوه تصادفی ساده از جامعه آماری انتخاب گردیدند. جهت تعیین حجم نمونه 141 نفر از جدول مورگان و گرجسی به شیوه تصادفی طبقه ای انتخاب شدند. جهت جمع آوری اطلاعات و داده ها از سه پرسشنامه ساختار سازمانی (ورعی) ، توانمندسازی ( شورت و راینهارت ) و اثر بخشی ( هرسی بلانچارد ) استفاده گردید . جهت تجزیه و تحلیل داده ها در سطح آمار توصیفی از میانگین ، انحراف معیار و در سطح آمار استنباطی از ضریب همبستگی پیرسون و رگرسیون چند متغیره استفاده شده است . نتایج تجزیه و تحلیل نشان داد که بین ساختار سازمانی با اثر بخشی سازمانی رابطه معنی داری وجود دارد . بین ابعاد ساختار سازمانی با اثر بخشی رابطه معنی دار وجود دارد. بین ابعاد توانمندسازی با اثر بخشی رابطه معنی داری وجود دارد . از بین ابعاد ساختار سازمانی سنجش میزان تمرکز و عدم تمرکز ، قدرت قوی تری برای پیش بینی اثر بخشی سازمانی دارند و از بین مولفه های توانمندسازی خودکارآمدی قدرت قوی تری برای پیش بینی اثر بخشی سازمانی دارد.