امروزه سازمان ها برای باقی ماندن در بازارهای رقابتی نیازمند پروژه های r&d می باشند. بعضی از سازمان ها با توجه به شرایط بازار و محدودیت های منابعشان هم زمان در چند پروژه، سرمایه گذاری می کنند که اثر پروژه ها بر یکدیگر (کالای جانشین، مکمل و مستقل) در ارزش نهایی پرتفوی پروژه موثر می باشند. در این پژوهش تلاش شده است که پرتفوی پروژه را با استفاده از رویکرد اختیار معامله ی فازی با در نظر گرفتن ریسک بازار و ریسک قیمت ارزش گذاری شود. هدف از این پژوهش ارائه مدلی برای لحاظ کردن تأثیرهای متقابل پروژه ها با نظر خبره در ارزیابی پرتفوی پروژه ها می باشند. در نهایت از مدل جهت ارزش گذاری پرتفوی پروژه های r&d شرکت دارویی پارس روس استفاده شده است. ارزش اختیار معامله واقعی پرتفوی پروژه های مورد نظر ، 5.51% ارزش خالص فعلی پرتفوی پروژه بدون در نظر گرفتن ارزش اختیارهای معامله واقعی می باشد. نتایج نشان می دهد که مدل ارائه شده برای ارزیابی پرتفوی پروژه ها مدلی کاربردی می باشد.