نام پژوهشگر: مجتبی آهنی‌آذری

ارزیابی تنوع ژنتیکی دو جمعیت بلدرچین ژاپنی و سفید انگلیسی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای (ssr) و تکثیر تصادفی قطعات dna چندشکل (rapd)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان - دانشکده کشاورزی 1391
  نوربی بی مامی زاده   مجتبی آهنی آذری

در این تحقیق تنوع ژنتیکی جمعیت بلدرچین ژاپنی و سفید انگلیسی، با استفاده از چهار جفت آغازگر ریزماهواره ای شاملguj0034 ،guj0049 ، guj0080، gu0097 و هشت آغازگر تکثیر تصادفی قطعات dna چندشکل(rapd) ، شامل pr3، pr9، pr11، pr16، pr20، opp11، opa07 و opa12 مورد بررسی قرار گرفت .خون گیری از 100 قطعه پرنده (50 قطعه از هر جمعیت) مزرعه تحقیقاتی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان واقع در شهر آق قلا انجام شد. dna نمونه ها با استفاده از کیت دیاتوم استخراج گردید. واکنش های زنجیره ای پلی مراز در تمام جایگاه های ریزماهواره ای به خوبی انجام شد ولی pcr با آغازگر های pr11، opp11، opa07 و opa12 سبب تکثیر نشد. محصولات واکنش زنجیره ای پلی مراز با استفاده از ژل پلی اکریل آمید 6? و ژل آگارز 5/1? الکتروفورز شد. در کل دو جمعیت، تمامی مکان های ژنی تکثیر شده، از تعادل هاردی-وینبرگ انحراف معنی داری نشان دادند. )05/0 (p<میانگین هتروزایگوسیتی کل مشاهده شده، 1615/0±6000/0 شد که بیشترین و کمترین هتروزایگوسیتی مشاهده شده برای آغازگرهای ریزماهواره ای، به ترتیب مربوط به جایگاه guj0097 (8101/0) و guj0034 (7780/0) بود. با استفاده از آغازگرهای rapd، 50 باند شناسایی گردید که از این تعداد، 44 باند چندشکل و 6 باند، تک شکل بودند. تعداد باندهای شناسایی شده برای هر آغازگر بین 10 تا 15 باند بود که در دامنه 3500-200 جفت باز قرار داشت. بیشترین درصد چندشکلی مربوط به آغازگر pr3 با 33/93? و کمترین آن مربوط به آغازگر pr20 با 33/83? بود. فراوانی اشتراک باندی برای هر آغازگر محاسبه شد که برای بلدرچین ژاپنی در دامنه 7871/0-6665/0 و برای بلدرچین سفیدانگلیسی در محدوده 7832/0-6378/0 قرار داشت. تشابه ژنتیکی درون جمعیتی به عنوان متوسط فراوانی اشتراک باندی محاسبه و مقدار آن برای بلدرچین ژاپنی 7314/0 و برای بلدرچین سفیدانگلیسی 7134/0 برآورد شد. میزان اطلاعات چندشکلی، برای آغازگرهای ریزماهواره و rapd به ترتیب 7614/0 و 8566/0 به دست آمد. با توجه به نتایج، وضعیت دو جمعیت بلدرچین به لحاظ تنوع ژنتیکی در سطح مطلوب بود. از طرفی نشانگرهای dna مورد مطالعه، می توانند به عنوان ابزاری قابل اعتماد و مناسب جهت مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت ها مورد استفاده قرار گیرند.

تعیین تنوع ژنتیکی در بز خلخالی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای و بین ریزماهواره ای (issr)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان - دانشکده کشاورزی 1392
  ابراهیم رجبی   مجتبی آهنی آذری

چکیده در این تحقیق تنوع ژنتیکی جمعیت بز خلخالی، با استفاده از پنج جفت آغازگر ریزماهواره ای شامل bm121،maf64، ilsts005، tgla122، lcsv36 و دو آغازگر بین ریزماهواره ای (issr) شامل 9c(ag) و ga)9c) مورد بررسی قرار گرفت. خونگیری از 100 راس بز خلخالی واقع در شهرستان خلخال انجام شد. dna نمونه ها با استفاده از کیت دیاتوم استخراج گردید. واکنش زنجیره ای پلی مراز در تمامی جایگاه های ریزماهواره ای و بین ریزماهواره ای بخوبی انجام شد. محصولات واکنش زنجیره ای پلی مراز با استفاده از ژل پلی آکریل آمید 8% و ژل آگارز 8/0% الکتروفورز شد. پارامترهای تنوع ژنتیکی با استفاده از نرم افزار popgene و het تعیین گردید. تمامی مکان های ژنی تکثیر شده در جمعیت فوق، از تعادل هاردی- واینبرگ انحراف معنی داری نشان دادند (05/0>p). بیشترین و کمترین مقدار هتروزیگوسیتی مشاهده شده در آغازگرهای ریزماهواره ای مربوط به جایگاه ilsts005 و bm121 بود. بر اساس نتایج حاصل از جایگاههای ریزماهواره بیشترین و کمترین مقدار شاخص شانون به ترتیب در آغازگر maf64 (28/2) و tgla122 (92/1) مشاهده شد. بیشترین و کمترین مقدار هتروزیگوسیتی مورد انتظار به ترتیب مربوط به آغازگرهای maf64 (87/0) و tgla122 (84/0) بود. با استفاده از آغازگر (ag)9c22 باند و با استفاده از آغازگر (ga)9c، 17 باند شناسایی گردید. میانگین تعداد آلل های موثر برای جایگاه های بین ریزماهواره ای (ag)9c و ga)9c) به ترتیب 31/0±52/1 و 28/0±62/1 بود. بیشترین شاخص شانون در آغازگر ga9c (54/0) و کمترین شاخص شانون در آغازگر ag9c (47/0) مشاهده شد. همچنین میزان pic در جایگاه (ag)9c، 93/0 و در جایگاه (ga)9c، 92/0 برآورد شد. بطور کلی با استفاده از دو نشانگر ریزماهواره ای و issr مشخص گردید جمعیت مورد مطالعه از تنوع نسبتا بالایی برخوردار است.