در تحقیق حاضر مارکر های مولکولی srap و issr جهت بررسی تنوع ژنتیکی در میان 15 نمونه از 13 گونه از جنس silene استفاده شدند. نمونه ها از نقاط مختلف ارومیه و خراسان جمع آوری شدند. 19 پرایمر srap، 62 باند قابل شمارش تولید کردند که 46 باند پلی مورف بودند(90/71 درصد). 13 پرایمر issr نیز 211 باند قابل شمارش ایجاد کردند که از میان آن ها 209 باند پلی مورف بودند(19/99 درصد). تشابه ژنتیکی از 47/0 تا 90/0 برای sarp و از 14/0 تا 39/0 برای issr متغییر بود. میانگین اطلاعات چند شکلی(pic) بدست آمده برای نشانگر های issr و srap به ترتیب 88/0 و 56/0 بود.دندروگرام با استفاده از روش upgma و با استفاده نرم افزار ntsyspc 2.02 ترسیم شد که برای مارکر srap و issr ، 3 خوشه اصلی با الگوی خوشه بندی متفاوت مشخص کرد. دندروگرم حاصل از داده های issr با اطلاعات مورفولوژیکی نسبت به دندروگرام حاصل از srap مطابقت بیشتری نشان داد.در واقع issr، پلی مورفیسم بالاتری را در مقایسه با srap نشان داد. این مسئله معرف تنوع ژنتیکی بالا در سطح بین گونه ای در جنس silene می باشد.