در این پژوهش، ویژگی های ریخت شناسی برای شناسایی قارچ های بی هوازی موجود در شکمبه گوسفند بلوچی در اقلیم خشک مورد بررسی قرار گرفته است. از محیط کشت نیمه تعریف شده c جهت کشت، جداسازی و خالص سازی قارچ های بی هوازی استفاده گردید. نمونه برداری از محتویات جامد و مایع شکمبه گوسفند انجام شد و از این نمونه به عنوان منبع قارچ جهت تلقیح به محیط کشت استفاده گردید تا قارچ ها در این محیط رشد کرده و مراحل جداسازی و خالص سازی انجام شد. از روش جدیدی به نام رول باتل برای خالص سازی قارچ های بی هوازی استفاده شد. کاربرد چند آنتی بیوتیک ضد باکتریایی همچون آمپی سیلین، پنی سیلین، استرپتومایسین، اکسی تتراسایکلین و کلرامفنیکل به منظور جداسازی و خالص سازی قارچ های بی هوازی از محتویات دستگاه گوارش ضروری است. با توجه به ویژگی های ریخت شناسی، جنس هایneocallimastix, piromyces و گونه های piromyces communis, piromyces minutus, piromyces rhizinflata, cecomyces communis در شکمبه گوسفند بلوچی شناسایی شدند.