نام پژوهشگر: اقا فخر میرلوحی

ارزیابی پیوستگی نشانگرهای مولکولی est-ssr در بزرک linum usitatissimum l.) )
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده کشاورزی 1392
  وحیده سادات رضوی   قدرت الله سعیدی

استفاده در این پژوهش، 42 نشانگر در بین والدین چندشکلی نشان دادند و برای انجام pcr در بین 105 نتاج f2 استفاده شدند. پس از امتیازدهی نوارها، با استفاده از نرم افزار mapmaker/exp ver3.3 با معیار حداکثر فاصله 50 سانتی مورگان و حداقل lod برابر3 ، پنج گروه پیوستگی تشکیل شد.20 نشانگر est-ssr ، چهار صفت فیزیولوژیک و صفت مورفولوژیک رنگ بذر در نقشه قرار گرفتند.درگروه اول، پنج نشانگر est-ssr ، چهار صفت فیزیولوژیک و صفت رنگ بذر قرار گرفت. در گروه دوم و سوم هرکدام دو نشانگر est-ssr و گروه چهارم و پنجم به ترتیب شش و پنج نشانگر est-ssr قرار گرفت. در کل پنج گروه پیوستگی 6/785 سانتی مورگان از نقشه را پوشش داد. کلیه آغازگرهایی که درگروه لینکاژی چهارم قرار گرفتند، در نقشه توافقی تهیه شده توسط کلوتیر و همکاران نیز همگی در گروه لینکاژی هفتم بودند. اغلب نشانگرهایی که در مطالعه حاضر به هیچ گروه پیوستگی تعلق نگرفتند، در نقشه توافقی یا بر روی گروههای پیوستگی متفاوت قرار داشتند و یا در فاصله ایی بیشتر از 50 سانتی مورگان از دیگر نشانگرها بودند، که این امر دلیل اصلی عدم لینکاژ بیش از 40 درصد از نشانگرهای مورد بررسی در این مطالعه بود. تجزیه به مولفه های تعدیل شده (pcoa) پایین(25%) ، تایید کننده پراکندگی و توزیع یکنواخت نشانگرهای مورد استفاده در سطح ژنوم بود. در نهایت نمای کروموزومی گروه های پیوستگی با استفاده از نرم افزار winqtlcart2.5 ترسیم شد.