اکثر نشخوار کنندگان از جمله گاو وگوسفند به عنوان مخزن اصلی سروتیپ باکتری اشریشیاکلی محسوب می شوند. اشریشیا کلی به عنوان یکی از پاتوژن های با منشاءغذایی (مشترک بین انسان و دام) از عوامل اسهال عفونی می باشد. درمان بیماری های اسهالی نیاز به طیف وسیعی از آنتی بیوتک ها داردکه استفاده غیر منطقی از آن می تواند باعث ایجاد مقاومت دارویی و تغییر در فلور میکروبی بدن شود. پلاسمیدها، ترانسپوزونها و اینتگرونها ازموثرترین عناصر ژنتیکی متحرکی هستندکه در اکتساب و پخش عوامل مقاومت در باکتری های مختلف گرم منفی نقش دارند. تحقیق حاضر 250 نمونه سواپ رکتوم از گاو وگوسفندان در مناطق مختلف استان فارس گرفته شد. با استفاده از آزمون های بیوشیمیایی باکتری ecoli شناسایی شد. پس از استخراج dna باکتری، pcr برروی 173 نمونه باکتری با کمک پرایمر های اختصاصی hep 35 و hep 36 برای تکثیر و شناسایی ژن اینتگرون انجام شد.نتایج نشان داد که از 173 نمونه باکتری جداسازی شده، تعداد 58 مورد(34%) از لحاظ وجود ژن اینتگرون مثبت بودند. همچنین جنسیت نیز اثر معنی داری برروی میزان شیوع ژن اینتگرون داشت بطوریکه درصد جداسازی این ژن بین کل نرها 30% وبین کل ماده ها 5/42% بود پس درجنس ماده ها نسبت به نرها شیوع بیشتری داشته است. نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد که در حال حاضر درصد زیادی از نمونه های ecoli را می توان خطری جدی جهت انتقال پدیده مقاومت به جمعیت کلی باکتری ecoli و یا باکتری های نزدیک به آن دانست.امروزه گسترش ژنهای مقاوم به آنتی بیوتیک از طریق ساختارهای اینتگرونی با ایجاد مقاومت های آنتی بیوتیکی چندگانه، به مشکل مهمی در درمان عفونتهای حاصل ازانواع باکتری ها تبدیل شده است.